• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Orc-a069
LIMCH1

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: LIM and calponin homology domains 1
Gene Name: LIMCH1
Ensembl Gene: ENSOCUG00000015547.3
Ensembl Protein: ENSOCUP00000013367.3
Organism: Oryctolagus cuniculus
Taxa ID: 9986
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Postsynaptic densityPredicted from orthologs(View)

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MACPALGLEA  LQPLQPEPPP  EPAFSEAQKW  IEQVTGRSFG  DKDFRTGLEN  GILLCELLNA  60
61    IKPGLVKKIN  RLPTPIAGLD  NIILFLRGCK  ELGLKESQLF  DPSDLQDTSN  RVTVKSLDYS  120
121   RKLRNVLVTI  YWLGKAANSY  ASYSGTTLNL  KEFEGLWAQM  RKETDDIESP  KRSIRDSGYI  180
181   DCWDSERSDS  LSPPRHGRDD  SFDSLDSFGS  RSRQTPSPDV  VLRGSSDGRG  SDSESDLPHR  240
241   KLPDVKKDDM  SARRTSHGEP  KSAVPFNQYL  PNKSNQTAYV  PAPLRKKKAE  REEYRKSWST  300
301   ATSPLGGERP  FSYPETIEEE  GSDMGSLGEE  DPIGQMDAGG  NPSDAGLELP  DGSGKGQPPS  360
361   EGTTVTPTAR  SEEKDAAEVQ  KRRRLEQAGI  KVMPAAQRFA  SQKQLGEEKD  TICDIILRKE  420
421   NPFLTHQHGK  DSESEDEVAC  RLPDLVKDDF  AARRARMNQP  KPTVPLNQLL  YGPYRKKEAE  480
481   TSDGSKPAKG  NSEKKSLEYK  RNQGKAEELK  SVATCITRAQ  ESEPVEEGGK  KVPDLYKDDL  540
541   AQRRIQGCLG  PHREAPSFII  PSKITEADLK  TWERLQVSGK  TRDGDSQQIC  APEPLPEIKA  600
601   ETAIRDDFAS  RKARAYKKAS  GPRQKFVHFG  PVTEIDQQKW  KRLSIGKAGP  REEVGVAGHS  660
661   SRLPAHPASP  ASAAGPGLKE  DPVLTRQDDC  RIVNSGLDDY  CQRDSRLAPV  PESQEEWASS  720
721   VGECPGNTEE  VTSKPAPQGG  KEENEGVAPR  ASAMLPEAEC  PAESSQPLAC  PLASEREPAG  780
781   AEEKAEESAA  PAWSASGPKG  QGKLSESQKD  DTMARTTGES  LSHPGSSPNQ  CLPVPFAKQQ  840
841   EVEESAEDPP  VKDRRYGPRT  PVSDDAESTS  LFDMRCEEEA  AVLPHSRARQ  EQLQLINSQL  900
901   REEDDKWQDD  LARWKSRRRS  ASQDLIKKEE  ERKKMEKLLA  GEDGTSERRK  SIKTYREIVQ  960
961   EKERRERELH  EAYKNARSQE  EADGILQQYI  ERFTISEAVL  ERLEMPKILE  RSHSTEPNLS  1020
1021  SFLSDPNPMK  YLRQQSLPPP  KFTATVETTI  ARASAPDAST  AAGSGSPSKT  VTPKAVPMLT  1080
1081  PKPYSQPKNS  QEVLKTFKVD  GKVSMNGETA  HGDEEEKGRE  CPTVTPAVSL  TTSQMFEGVA  1140
1141  RVHGSPVELK  QDNNSVEINI  KKPNPVPQEA  TATTEETELN  SHEDENDGGE  PGSENVDLAA  1200
1201  SEPQHFTSTV  TRCSPTVALV  ELPSSPSPDE  RGQKSSENEM  SGKVELVLSQ  KVVKPKSPEP  1260
1261  EATLTFPFLD  KMHETSQLHL  PNLNSQELPG  TASVPLRVQN  SWRRSQFFSQ  SDSPSNEKSP  1320
1321  VTTPFKFWAW  DPEEERRRQE  KWQQEQERLL  QERYQKEQDK  LKEEWEKAQK  EVEEEERRYY  1380
1381  EEERKIIEDT  VVPFTISSSS  ADQLSTSSSV  TEGSGTVKKM  DLENCQEEKE  ERRQKEPFQG  1440
1441  DDNDLLHKTR  GCDPLEEKGS  SLMPEAPAHS  ENPTSKGIHQ  DHQLGAEAGA  LSCGMNPQLS  1500
1501  QDPSQHQQVS  NPPTHISEDV  KPKSLPLDRN  MSHQIESPTE  RRKKSPRGSF  QAGSFSPCSP  1560
1561  TPPGQSPSRS  ISGKKLCSSC  GLALGKGAAM  IIETLNLYFH  IQCFRCGICK  GQLGDAMSGT  1620
1621  DVRIRNSLLN  CNDCYLRSRS  AGQPTTL  1647
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGCTTGTC  CCGCGCTCGG  TCTGGAAGCT  CTTCAGCCCC  TGCAGCCCGA  GCCGCCCCCC  60
61    GAGCCCGCCT  TCTCCGAGGC  GCAGAAGTGG  ATCGAGCAAG  TAACTGGCAG  AAGTTTTGGT  120
121   GACAAAGATT  TTCGGACTGG  ATTAGAAAAT  GGAATCCTTC  TCTGCGAGTT  GCTGAATGCT  180
181   ATAAAGCCAG  GACTTGTTAA  AAAGATCAAT  AGATTGCCTA  CCCCCATTGC  AGGATTGGAC  240
241   AATATTATCT  TATTCTTGAG  AGGTTGTAAA  GAGCTCGGCC  TCAAAGAATC  TCAACTGTTT  300
301   GACCCGAGTG  ACCTCCAGGA  TACGTCCAAC  AGAGTAACGG  TCAAGAGCCT  CGATTATAGT  360
361   CGGAAGCTGA  GAAATGTACT  AGTGACCATT  TATTGGCTGG  GAAAGGCTGC  AAATAGCTAT  420
421   GCATCCTACA  GCGGAACGAC  TCTGAACCTG  AAGGAGTTTG  AAGGCTTGTG  GGCTCAGATG  480
481   AGAAAGGAGA  CTGATGACAT  TGAGAGTCCT  AAGCGCAGCA  TCCGAGACAG  TGGTTACATC  540
541   GACTGCTGGG  ATTCGGAGCG  CAGCGACTCC  CTCTCTCCTC  CTCGGCACGG  TCGCGATGAC  600
601   TCCTTCGACA  GCCTCGATTC  CTTCGGCTCC  CGTTCCAGGC  AGACACCTTC  GCCAGATGTA  660
661   GTGCTCAGGG  GAAGCAGCGA  TGGGAGAGGA  AGCGACTCTG  AGTCCGACTT  GCCACATCGG  720
721   AAGCTACCAG  ATGTGAAGAA  AGATGACATG  TCTGCACGAC  GGACTTCCCA  TGGTGAGCCA  780
781   AAATCAGCAG  TGCCTTTTAA  CCAGTACCTC  CCCAACAAGA  GCAATCAGAC  GGCCTACGTC  840
841   CCCGCTCCTC  TGAGAAAGAA  GAAGGCTGAG  CGGGAGGAGT  ACAGGAAGAG  CTGGAGCACT  900
901   GCCACCTCCC  CGCTGGGTGG  TGAGAGGCCC  TTCAGCTATC  CTGAAACAAT  AGAGGAAGAG  960
961   GGAAGTGACA  TGGGGTCTCT  GGGTGAAGAG  GACCCAATTG  GCCAGATGGA  CGCAGGTGGA  1020
1021  AATCCTTCTG  ATGCCGGGTT  AGAATTACCC  GACGGCAGTG  GTAAGGGGCA  GCCTCCTTCA  1080
1081  GAGGGGACTA  CGGTGACACC  CACGGCCAGG  TCAGAAGAAA  AAGATGCTGC  CGAAGTTCAA  1140
1141  AAGCGCAGAA  GGCTAGAGCA  AGCAGGAATC  AAGGTCATGC  CAGCAGCACA  GCGCTTTGCC  1200
1201  AGTCAAAAGC  AATTGGGAGA  AGAGAAGGAC  ACCATTTGTG  ATATTATCCT  TCGCAAAGAG  1260
1261  AACCCTTTCC  TGACCCATCA  GCATGGCAAA  GATTCTGAGT  CAGAAGACGA  AGTTGCGTGT  1320
1321  CGACTGCCCG  ATCTTGTGAA  AGATGACTTT  GCTGCGAGGA  GAGCAAGGAT  GAACCAACCC  1380
1381  AAGCCAACGG  TGCCACTGAA  TCAGCTCCTC  TATGGGCCCT  ATAGAAAGAA  AGAGGCAGAG  1440
1441  ACATCAGATG  GCAGCAAACC  CGCCAAAGGA  AACTCAGAGA  AGAAAAGCCT  AGAATATAAA  1500
1501  AGAAACCAGG  GCAAAGCAGA  AGAGCTGAAG  TCAGTAGCGA  CCTGTATTAC  GAGGGCCCAG  1560
1561  GAGAGTGAAC  CAGTGGAAGA  GGGAGGGAAG  AAGGTGCCAG  ATCTTTACAA  GGACGACCTG  1620
1621  GCCCAGCGGA  GAATTCAGGG  CTGCCTCGGC  CCTCACCGCG  AGGCCCCAAG  CTTCATCATA  1680
1681  CCCTCCAAGA  TAACAGAAGC  TGACTTGAAG  ACGTGGGAGA  GACTGCAAGT  GTCAGGAAAG  1740
1741  ACGAGGGACG  GAGATTCTCA  GCAAATCTGT  GCCCCCGAGC  CTCTACCAGA  AATTAAAGCA  1800
1801  GAAACCGCCA  TCCGCGATGA  CTTTGCCAGC  CGCAAAGCCA  GGGCCTATAA  GAAAGCTTCC  1860
1861  GGCCCAAGGC  AAAAATTTGT  GCACTTCGGG  CCGGTGACAG  AGATAGACCA  GCAGAAGTGG  1920
1921  AAGCGGCTCA  GCATTGGCAA  GGCGGGGCCC  CGGGAGGAGG  TAGGAGTCGC  CGGTCACAGC  1980
1981  AGCAGGCTGC  CAGCACACCC  TGCATCCCCT  GCCTCAGCCG  CCGGCCCTGG  ACTAAAGGAA  2040
2041  GACCCAGTGC  TCACTCGGCA  GGATGACTGC  AGAATAGTGA  ATTCTGGCCT  AGATGACTAT  2100
2101  TGCCAAAGGG  ACTCGAGGCT  GGCTCCTGTG  CCGGAGTCTC  AGGAAGAGTG  GGCCAGCAGT  2160
2161  GTGGGCGAGT  GCCCCGGGAA  CACGGAGGAA  GTTACATCCA  AACCGGCGCC  ACAGGGTGGC  2220
2221  AAAGAAGAAA  ATGAAGGAGT  TGCTCCAAGA  GCATCTGCGA  TGTTGCCCGA  GGCAGAATGC  2280
2281  CCGGCGGAGA  GCAGCCAGCC  CCTTGCCTGT  CCTCTGGCCT  CTGAGCGGGA  GCCGGCAGGG  2340
2341  GCTGAAGAGA  AGGCGGAGGA  GTCAGCAGCG  CCTGCCTGGA  GTGCCAGTGG  ACCGAAAGGC  2400
2401  CAAGGAAAGC  TCTCTGAGTC  ACAGAAAGAT  GACACAATGG  CCAGGACAAC  TGGGGAGTCC  2460
2461  CTGAGTCACC  CTGGATCCAG  CCCAAACCAG  TGCCTTCCGG  TTCCATTTGC  AAAGCAACAG  2520
2521  GAGGTCGAGG  AATCCGCTGA  GGATCCACCC  GTGAAGGATC  GGAGATACGG  TCCGAGAACT  2580
2581  CCTGTGTCTG  ATGACGCAGA  GAGCACGAGT  TTGTTTGACA  TGCGGTGCGA  GGAGGAGGCC  2640
2641  GCCGTGCTGC  CGCACAGCAG  GGCCCGCCAG  GAGCAGCTGC  AACTGATAAA  CAGCCAGCTG  2700
2701  CGGGAAGAGG  ACGACAAATG  GCAAGACGAC  CTGGCTCGTT  GGAAGAGTCG  TAGGAGAAGT  2760
2761  GCATCACAAG  ACTTGATCAA  GAAAGAGGAG  GAAAGAAAAA  AAATGGAGAA  GTTACTGGCT  2820
2821  GGAGAGGATG  GAACCAGTGA  ACGAAGGAAA  AGCATCAAGA  CCTACAGAGA  AATTGTTCAA  2880
2881  GAAAAAGAGC  GGAGAGAGAG  AGAGCTGCAC  GAAGCATATA  AGAACGCACG  GTCGCAGGAG  2940
2941  GAGGCCGACG  GGATCCTGCA  GCAGTACATC  GAGAGGTTTA  CCATCAGCGA  GGCTGTTCTT  3000
3001  GAACGCTTGG  AGATGCCAAA  AATTCTGGAA  AGAAGCCATT  CAACAGAGCC  AAACTTATCC  3060
3061  TCCTTCCTGA  GCGACCCCAA  CCCCATGAAA  TACCTGCGGC  AACAGTCACT  GCCTCCGCCC  3120
3121  AAGTTCACTG  CCACTGTGGA  AACCACCATC  GCGCGTGCCA  GTGCCCCGGA  TGCCAGCACG  3180
3181  GCAGCAGGCA  GTGGGTCCCC  CAGCAAAACT  GTGACCCCCA  AAGCAGTGCC  TATGCTGACA  3240
3241  CCCAAGCCTT  ACTCCCAGCC  CAAAAACTCT  CAAGAGGTTC  TCAAGACCTT  TAAGGTAGAT  3300
3301  GGGAAAGTCA  GCATGAACGG  AGAGACAGCC  CACGGAGATG  AGGAAGAGAA  GGGAAGAGAG  3360
3361  TGTCCCACAG  TGACACCTGC  TGTCTCCTTA  ACCACGTCCC  AGATGTTTGA  AGGTGTGGCC  3420
3421  AGAGTGCACG  GGTCACCAGT  GGAGCTCAAG  CAAGACAACA  ACAGCGTTGA  GATCAACATA  3480
3481  AAGAAGCCAA  ATCCTGTTCC  CCAGGAAGCG  ACAGCCACCA  CGGAGGAAAC  AGAACTGAAC  3540
3541  AGCCACGAAG  ATGAGAATGA  TGGCGGAGAA  CCAGGAAGTG  AGAATGTAGA  CCTTGCCGCA  3600
3601  TCAGAGCCTC  AGCACTTTAC  ATCCACCGTG  ACTCGCTGCA  GCCCCACGGT  GGCCCTGGTG  3660
3661  GAGCTGCCCT  CCAGCCCCTC  GCCCGACGAG  AGAGGCCAGA  AGAGCTCAGA  AAATGAAATG  3720
3721  AGCGGGAAGG  TGGAGCTGGT  GCTGTCTCAG  AAGGTGGTAA  AGCCAAAGTC  CCCAGAACCA  3780
3781  GAAGCTACCC  TGACATTTCC  ATTTCTGGAC  AAAATGCATG  AAACCAGCCA  ACTACATTTG  3840
3841  CCAAATCTCA  ATTCTCAAGA  GTTGCCTGGC  ACTGCCAGTG  TTCCCCTTAG  AGTTCAGAAC  3900
3901  TCTTGGCGAC  GGTCCCAGTT  TTTCTCCCAG  TCAGATTCTC  CAAGCAATGA  AAAGTCACCT  3960
3961  GTAACTACAC  CTTTTAAGTT  CTGGGCGTGG  GACCCCGAAG  AGGAGCGCAG  ACGACAGGAA  4020
4021  AAATGGCAAC  AGGAGCAGGA  GCGTTTGCTC  CAGGAGAGAT  ACCAGAAGGA  GCAGGACAAG  4080
4081  CTAAAAGAAG  AGTGGGAAAA  GGCCCAGAAG  GAGGTGGAAG  AGGAAGAACG  CAGATACTAT  4140
4141  GAGGAGGAGC  GTAAGATAAT  TGAAGATACT  GTGGTCCCGT  TTACTATTTC  CTCAAGTTCT  4200
4201  GCAGACCAGC  TGTCTACATC  TTCCTCTGTG  ACTGAAGGCA  GTGGGACAGT  GAAAAAGATG  4260
4261  GACTTGGAAA  ACTGTCAAGA  AGAAAAAGAA  GAGAGAAGAC  AGAAGGAACC  GTTCCAGGGA  4320
4321  GATGACAATG  ACTTATTGCA  TAAGACTAGA  GGATGTGACC  CACTGGAGGA  GAAGGGCAGC  4380
4381  AGCCTAATGC  CAGAGGCCCC  GGCTCATTCT  GAGAATCCCA  CATCCAAAGG  AATCCATCAA  4440
4441  GACCATCAGC  TGGGAGCAGA  GGCCGGAGCC  CTCAGCTGTG  GGATGAATCC  ACAGCTGTCT  4500
4501  CAGGATCCAT  CCCAGCATCA  GCAGGTGTCA  AACCCACCCA  CGCACATTTC  AGAAGATGTG  4560
4561  AAGCCAAAAT  CCCTGCCACT  GGATAGAAAC  ATGAGCCATC  AGATTGAGTC  TCCCACGGAA  4620
4621  AGGCGAAAGA  AAAGTCCTCG  AGGGAGCTTC  CAGGCTGGGT  CCTTCTCACC  CTGCTCTCCC  4680
4681  ACCCCGCCCG  GCCAGTCACC  CAGCAGGTCG  ATCAGCGGGA  AGAAGCTGTG  CTCTTCCTGT  4740
4741  GGGCTGGCCC  TGGGGAAAGG  AGCTGCGATG  ATCATCGAGA  CCCTGAATCT  GTATTTCCAC  4800
4801  ATCCAGTGTT  TCAGGTGTGG  AATTTGTAAA  GGACAGCTTG  GAGATGCCAT  GAGCGGGACA  4860
4861  GATGTTAGAA  TCCGAAATAG  TCTTCTAAAC  TGTAACGACT  GCTACCTGCG  ATCCAGAAGT  4920
4921  GCTGGCCAGC  CCACAACCTT  GTGA  4944

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Hos-a071Homo sapiens0.02260undefined
LLPS-Mum-a073Mus musculus0.01106undefined