• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Nia-2563
NUP96

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: Nuclear pore complex protein nup96
Gene Name: NUP96, A4A49_21629
Ensembl Gene: A4A49_21629
Ensembl Protein: OIT35661
Organism: Nicotiana attenuata
Taxa ID: 49451
LLPS Type: Scaffold


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Droplet, Nuclear pore complex, Stress granulePredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MEVDLGIHDQ  LIVSQSQCKR  RKVSLDGVAL  DQIFGENEAA  LPTLQSTDYF  TEPCLSELAI  60
61    RELMSPGYCS  CVQDFTVGRF  GYGFVKFFGE  TDVRGLDLDR  IVTFSRHEVV  VYEDENYKPP  120
121   VGEGLNKPAE  VTLLLKIRSS  KNCDVDSSRE  MVEKLRFRTE  RQGARFISFN  PSNGEWKFSV  180
181   QHFSRFGLMD  DDEEDMIMDD  VSPEVQDPVD  MNGGDVSYID  EETALVNTTD  LSHSLPAHLG  240
241   LDPMKMKEMR  MLMFPAEEED  VDDYHGGPSD  RKPQFSKESS  KSPFQHKYPR  ISPPLTRKTP  300
301   LALIEYKHGS  FGSDSPGSIL  LTQQNKGVLL  KTTKAEGFKL  DLRQQTPVSG  SHSHNVVDAG  360
361   LFMRRSFGVG  WGPNGVLIHS  GAPVGSKDSQ  SLSSIINLEK  VAFDQVARDE  NKKFKEELVD  420
421   LFFDSPLLLH  KEISHETKEF  GEGPFTLKLQ  RVVCDRVMLS  DVCRSYIGIV  ERQLEVPGLS  480
481   SASRVLLMHQ  AMIWELIKVL  FSSRQLSGKS  KSLEDEDEED  MIPDTRETVS  DVDPEALPLI  540
541   RRAEFSYWLQ  ESVCHRVQEE  VSSLNDSSDL  QHMFLLLTGR  QLDAAVELAA  SRGDVRLACL  600
601   LSQAGGSMVN  RSDVVRQLDL  WRVNGLDFNF  VETERIRVLE  LVAGNIHRAL  HDVDIDWKRF  660
661   LGLLMWYQLP  PETELPVLFR  TYQRLLNEGK  APSPVPVYID  EGPVEVSLNW  HAVKHFDLGY  720
721   YLMLLHANQE  IDFSALKTMF  SAFASTNDPL  DYHMIWHQRA  VLEAIGAFSS  NDLHVLDISF  780
781   ISQLLCLGQC  HWAVYVALHM  PHREDYPYLQ  AALIREILFQ  YCETWSSQDL  QRQFIEDLGI  840
841   PSEWLNEALA  TYFNYYSEFP  KALEHFLECG  KWQKAHTIFM  TSVAHSLFLS  EEHSEIWRLA  900
901   ASMEDHKSEI  EDWDLGAGIY  VTFYLLRSSL  QEDNDTMNQE  GSLENKNSDC  ADFISRLNNS  960
961   LAVWTSRLPV  EARVVYSKMA  EEICNLLLSD  SGGSSENEVQ  LSCYDTIFKA  PIPEVTRAYH  1020
1021  LQDAVSLFTS  YLSEVAS  1037
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGAAGTTG  ATTTAGGGAT  TCATGACCAA  CTTATTGTTT  CTCAATCTCA  ATGTAAAAGA  60
61    AGAAAAGTAT  CTCTTGACGG  CGTAGCTTTA  GATCAGATTT  TCGGCGAGAA  TGAAGCTGCT  120
121   TTACCTACCT  TGCAATCTAC  TGATTATTTT  ACTGAGCCTT  GCTTGAGTGA  ATTGGCTATT  180
181   AGGGAGCTTA  TGAGCCCAGG  GTATTGCAGC  TGTGTTCAAG  ATTTTACTGT  TGGGAGGTTC  240
241   GGATATGGGT  TTGTCAAATT  TTTTGGGGAA  ACAGATGTTA  GAGGGTTGGA  TTTGGATCGA  300
301   ATCGTGACGT  TTAGCAGGCA  TGAGGTGGTT  GTATATGAAG  ATGAAAATTA  CAAGCCCCCA  360
361   GTTGGCGAGG  GACTTAACAA  GCCTGCTGAA  GTAACTTTGC  TACTGAAAAT  ACGATCCTCG  420
421   AAAAATTGTG  ATGTGGATTC  TTCTAGAGAA  ATGGTGGAGA  AGTTGAGATT  TAGAACTGAG  480
481   AGGCAAGGAG  CACGTTTTAT  CTCGTTTAAT  CCATCAAATG  GAGAATGGAA  ATTCTCCGTT  540
541   CAGCATTTCA  GCAGATTTGG  TTTGATGGAT  GATGATGAAG  AAGATATGAT  AATGGATGAT  600
601   GTCTCTCCAG  AAGTTCAAGA  CCCAGTGGAT  ATGAATGGAG  GAGACGTTTC  CTACATTGAT  660
661   GAAGAAACCG  CCTTAGTCAA  TACAACTGAT  CTTTCACATT  CTCTTCCTGC  TCATCTTGGG  720
721   TTAGATCCTA  TGAAGATGAA  AGAAATGAGA  ATGCTGATGT  TTCCAGCAGA  AGAGGAGGAT  780
781   GTAGATGATT  ATCATGGCGG  GCCTTCTGAT  AGAAAACCAC  AATTCAGCAA  AGAATCTTCG  840
841   AAATCCCCTT  TCCAGCATAA  ATACCCGAGA  ATTAGTCCTC  CTTTGACGCG  CAAGACTCCA  900
901   TTGGCTTTGA  TTGAATACAA  ACATGGTAGT  TTTGGCTCAG  ACTCACCAGG  GTCCATTTTG  960
961   CTGACCCAAC  AAAATAAGGG  TGTGCTTCTA  AAGACAACAA  AGGCTGAAGG  TTTCAAGCTG  1020
1021  GATCTCAGGC  AGCAAACACC  TGTAAGTGGA  AGCCACTCTC  ATAATGTTGT  TGATGCAGGA  1080
1081  TTGTTCATGC  GTAGATCATT  TGGAGTTGGC  TGGGGGCCTA  ATGGTGTTCT  TATCCATTCT  1140
1141  GGCGCGCCAG  TTGGTAGTAA  AGACAGTCAA  AGTTTGTCCT  CGATAATCAA  TTTGGAGAAG  1200
1201  GTCGCATTTG  ACCAAGTAGC  TAGAGATGAA  AATAAAAAGT  TTAAGGAGGA  ACTTGTTGAT  1260
1261  TTGTTTTTTG  ATTCACCCCT  CCTCCTTCAC  AAGGAAATTA  GCCATGAAAC  CAAAGAGTTT  1320
1321  GGGGAGGGAC  CCTTCACGTT  AAAGCTACAA  AGAGTTGTGT  GTGATCGTGT  AATGCTTTCA  1380
1381  GATGTATGTC  GGAGTTATAT  TGGTATTGTT  GAGAGGCAGT  TGGAGGTTCC  TGGATTATCT  1440
1441  TCAGCATCCC  GTGTTCTTCT  GATGCACCAA  GCAATGATTT  GGGAATTAAT  AAAAGTGCTT  1500
1501  TTCTCATCCA  GACAATTGAG  TGGGAAATCA  AAGTCTCTAG  AAGATGAGGA  TGAGGAAGAC  1560
1561  ATGATACCTG  ATACGAGAGA  AACTGTTTCA  GATGTTGATC  CAGAAGCACT  TCCATTGATA  1620
1621  AGGAGAGCAG  AATTCAGCTA  TTGGTTGCAA  GAGAGTGTTT  GTCACAGGGT  GCAGGAAGAA  1680
1681  GTAAGCTCTT  TGAACGATTC  AAGCGATCTA  CAACATATGT  TCTTACTTCT  AACTGGTCGG  1740
1741  CAGCTGGATG  CTGCTGTGGA  ACTGGCTGCC  TCTAGAGGAG  ACGTGCGACT  TGCATGTCTT  1800
1801  CTTAGCCAAG  CTGGTGGTTC  GATGGTTAAT  CGTTCTGATG  TTGTTAGGCA  GCTTGATCTT  1860
1861  TGGAGAGTAA  ATGGATTGGA  TTTCAATTTT  GTTGAGACAG  AGAGGATTAG  GGTTCTTGAG  1920
1921  TTGGTTGCTG  GCAACATTCA  TAGAGCTCTG  CATGATGTAG  ACATTGACTG  GAAAAGGTTT  1980
1981  CTGGGGTTGT  TGATGTGGTA  TCAGCTTCCA  CCAGAAACTG  AATTGCCTGT  TTTATTCCGT  2040
2041  ACATATCAGC  GGCTTCTCAA  TGAAGGAAAA  GCTCCATCTC  CAGTTCCAGT  TTATATTGAT  2100
2101  GAAGGACCTG  TAGAAGTGTC  TTTGAATTGG  CATGCAGTGA  AACATTTTGA  CCTTGGTTAT  2160
2161  TATCTTATGC  TTCTTCATGC  CAATCAAGAA  ATTGATTTCA  GTGCTCTAAA  GACAATGTTC  2220
2221  AGTGCCTTTG  CTTCAACAAA  TGATCCCCTT  GACTACCACA  TGATCTGGCA  TCAACGAGCT  2280
2281  GTTTTAGAAG  CCATTGGTGC  CTTCAGTTCT  AACGATCTTC  ATGTCCTAGA  CATTAGTTTC  2340
2341  ATTTCTCAGC  TGCTGTGTCT  TGGTCAATGT  CATTGGGCTG  TCTACGTGGC  GCTTCACATG  2400
2401  CCTCACCGTG  AAGATTATCC  TTATTTGCAA  GCCGCTCTTA  TAAGGGAAAT  ACTCTTTCAG  2460
2461  TACTGTGAAA  CTTGGAGTTC  ACAGGACTTA  CAGCGGCAGT  TTATTGAGGA  TCTAGGTATT  2520
2521  CCATCAGAAT  GGTTGAACGA  GGCTTTGGCA  ACATATTTTA  ATTACTACTC  TGAATTCCCA  2580
2581  AAAGCCCTAG  AACACTTTTT  GGAATGCGGA  AAGTGGCAGA  AAGCGCACAC  CATTTTTATG  2640
2641  ACTTCAGTTG  CTCATTCTCT  TTTCCTATCA  GAAGAACACT  CTGAAATATG  GAGGCTAGCA  2700
2701  GCTTCCATGG  AGGACCACAA  GTCAGAAATT  GAAGATTGGG  ATCTGGGAGC  TGGAATATAT  2760
2761  GTAACTTTTT  ATTTGTTGAG  AAGTTCTTTG  CAGGAGGACA  ATGACACTAT  GAATCAAGAG  2820
2821  GGCTCTCTGG  AAAACAAAAA  CAGTGATTGT  GCAGACTTCA  TCAGTCGCTT  AAACAACTCT  2880
2881  TTGGCTGTTT  GGACTAGCAG  ATTGCCTGTC  GAAGCAAGGG  TGGTTTATTC  GAAGATGGCT  2940
2941  GAGGAGATAT  GCAATTTGCT  GCTTTCTGAT  AGCGGTGGAA  GTTCAGAAAA  TGAGGTTCAG  3000
3001  CTAAGCTGCT  ATGATACCAT  ATTCAAGGCA  CCCATACCTG  AAGTCACCCG  TGCATACCAT  3060
3061  TTGCAGGATG  CTGTGTCTCT  TTTTACATCT  TACCTTTCGG  AGGTGGCGTC  ATAG  3114

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Sot-0849Solanum tuberosum89.50.01870
LLPS-Sol-1040Solanum lycopersicum88.340.01846
LLPS-Coc-1914Corchorus capsularis69.40.0 795
LLPS-Thc-2111Theobroma cacao66.040.01358
LLPS-Gor-0362Gossypium raimondii65.760.01364
LLPS-Mae-1380Manihot esculenta64.990.01337
LLPS-Prp-1393Prunus persica64.720.01351
LLPS-Pot-2539Populus trichocarpa64.670.01316
LLPS-Dac-2004Daucus carota63.650.01356
LLPS-Vir-0867Vigna radiata62.950.01065
LLPS-Cus-1270Cucumis sativus61.180.01232
LLPS-Art-2189Arabidopsis thaliana60.560.01228
LLPS-Met-2220Medicago truncatula59.790.01224
LLPS-Arl-1649Arabidopsis lyrata59.630.01206
LLPS-Orgl-0372Oryza glumaepatula59.522e-22 108
LLPS-Glm-0996Glycine max59.390.01263
LLPS-Phv-1763Phaseolus vulgaris58.890.01261
LLPS-Bro-1454Brassica oleracea58.820.01178
LLPS-Brn-3012Brassica napus58.810.01181
LLPS-Brr-0977Brassica rapa58.420.01192
LLPS-Orm-0865Oryza meridionalis58.392e-41 171
LLPS-Sei-1316Setaria italica57.521e-43 176
LLPS-Via-1627Vigna angularis57.440.01204
LLPS-Lep-0469Leersia perrieri55.921e-40 167
LLPS-Tru-1640Triticum urartu55.776e-43 171
LLPS-Orr-0727Oryza rufipogon55.771e-40 167
LLPS-Orni-0844Oryza nivara55.771e-40 167
LLPS-Ori-1101Oryza indica55.774e-41 168
LLPS-Brd-1812Brachypodium distachyon55.563e-41 168
LLPS-Tra-1886Triticum aestivum55.410.01095
LLPS-Hov-1447Hordeum vulgare55.354e-42 171
LLPS-Amt-1409Amborella trichopoda55.290.01118
LLPS-Mua-1336Musa acuminata55.264e-42 171
LLPS-Org-0477Oryza glaberrima55.130.01081
LLPS-Zem-1240Zea mays55.135e-39 161
LLPS-Sob-1476Sorghum bicolor55.138e-41 167
LLPS-Orp-0457Oryza punctata55.134e-40 165
LLPS-Orb-1318Oryza barthii55.130.01081
LLPS-Ors-0387Oryza sativa54.940.01075
LLPS-Orbr-0124Oryza brachyantha54.690.01075
LLPS-Hea-1253Helianthus annuus53.211e-38 160
LLPS-Php-0217Physcomitrella patens51.921e-36 154
LLPS-Viv-1234Vitis vinifera49.062e-39 163
LLPS-Lac-0214Latimeria chalumnae44.088e-24 113
LLPS-Pof-0016Poecilia formosa43.878e-25 116
LLPS-Leo-0260Lepisosteus oculatus43.792e-25 118
LLPS-Anc-0551Anolis carolinensis43.482e-1999.0
LLPS-Fia-0522Ficedula albicollis42.764e-25 117
LLPS-Icp-0105Ictalurus punctatus42.585e-23 110
LLPS-Tag-1117Taeniopygia guttata42.112e-25 118
LLPS-Dar-0859Danio rerio42.115e-25 117
LLPS-Orn-0461Oreochromis niloticus41.949e-25 116
LLPS-Chr-0826Chlamydomonas reinhardtii41.881e-22 109
LLPS-Cog-0808Colletotrichum gloeosporioides41.62e-1276.3
LLPS-Poa-2501Pongo abelii41.57e-24 113
LLPS-Gaga-1007Gallus gallus41.451e-22 109
LLPS-Cas-0638Carlito syrichta41.452e-24 115
LLPS-Ten-0192Tetraodon nigroviridis41.453e-24 114
LLPS-Loa-0750Loxodonta africana41.458e-25 116
LLPS-Hos-1607Homo sapiens41.453e-24 114
LLPS-Pat-2713Pan troglodytes41.453e-24 114
LLPS-Myl-0758Myotis lucifugus41.452e-24 115
LLPS-Caj-3555Callithrix jacchus41.453e-24 114
LLPS-Asm-1273Astyanax mexicanus41.456e-24 114
LLPS-Gog-1761Gorilla gorilla41.453e-24 114
LLPS-Aon-1170Aotus nancymaae41.453e-24 114
LLPS-Sem-1284Selaginella moellendorffii41.190.0 730
LLPS-Gas-0663Galdieria sulphuraria41.142e-23 112
LLPS-Nol-0352Nomascus leucogenys40.797e-24 113
LLPS-Ict-0314Ictidomys tridecemlineatus40.795e-24 114
LLPS-Mam-3728Macaca mulatta40.795e-24 114
LLPS-Cap-1612Cavia porcellus40.794e-24 114
LLPS-Eqc-3985Equus caballus40.794e-24 114
LLPS-Caf-0275Canis familiaris40.794e-24 114
LLPS-Rhb-2032Rhinopithecus bieti40.795e-24 114
LLPS-Orc-3233Oryctolagus cuniculus40.795e-24 114
LLPS-Man-2111Macaca nemestrina40.796e-24 113
LLPS-Fec-0886Felis catus40.795e-24 114
LLPS-Urm-2495Ursus maritimus40.795e-24 114
LLPS-Aim-3420Ailuropoda melanoleuca40.795e-24 114
LLPS-Mup-0538Mustela putorius furo40.795e-24 114
LLPS-Ova-2323Ovis aries40.795e-24 114
LLPS-Paa-3741Papio anubis40.796e-24 113
LLPS-Mal-1233Mandrillus leucophaeus40.796e-24 113
LLPS-Ran-0242Rattus norvegicus40.795e-24 114
LLPS-Bot-1661Bos taurus40.795e-24 114
LLPS-Tar-0490Takifugu rubripes40.796e-24 113
LLPS-Sus-0082Sus scrofa40.792e-24 115
LLPS-Cea-1742Cercocebus atys40.795e-24 114
LLPS-Orl-2396Oryzias latipes40.794e-23 111
LLPS-Chs-1660Chlorocebus sabaeus40.795e-24 114
LLPS-Maf-2558Macaca fascicularis40.797e-24 113
LLPS-Mum-1572Mus musculus40.795e-24 114
LLPS-Mea-0322Mesocricetus auratus40.794e-24 114
LLPS-Osl-0117Ostreococcus lucimarinus40.355e-1274.7
LLPS-Scf-2752Scleropages formosus40.226e-25 117
LLPS-Ora-0630Ornithorhynchus anatinus40.222e-1167.8
LLPS-Pes-2030Pelodiscus sinensis40.133e-23 111
LLPS-Otg-0461Otolemur garnettii40.132e-23 111
LLPS-Dio-0531Dipodomys ordii40.134e-23 110
LLPS-Fud-1127Fukomys damarensis40.133e-23 111
LLPS-Sah-1084Sarcophilus harrisii40.138e-23 110
LLPS-Mod-1912Monodelphis domestica39.479e-22 106
LLPS-Drm-0573Drosophila melanogaster39.472e-23 112
LLPS-Meg-0358Meleagris gallopavo39.073e-20 100
LLPS-Coo-0918Colletotrichum orbiculare38.44e-1068.6
LLPS-Fuv-0132Fusarium verticillioides37.12e-0863.2
LLPS-Cae-0109Caenorhabditis elegans36.882e-1792.4
LLPS-Cogr-0047Colletotrichum graminicola36.82e-0966.2
LLPS-Fuo-1220Fusarium oxysporum36.293e-0862.4
LLPS-Ved-0053Verticillium dahliae36.05e-1171.6
LLPS-Scj-1341Schizosaccharomyces japonicus35.11e-0863.5
LLPS-Scp-1112Schizosaccharomyces pombe34.877e-1377.8
LLPS-Abg-0276Absidia glauca34.751e-0760.5
LLPS-Map-0807Magnaporthe poae34.671e-1173.9
LLPS-Gag-0227Gaeumannomyces graminis34.678e-1274.3
LLPS-Yal-0319Yarrowia lipolytica34.573e-1895.1
LLPS-Miv-0726Microbotryum violaceum34.235e-0861.6
LLPS-Kop-1238Komagataella pastoris34.184e-1171.6
LLPS-Tum-0218Tuber melanosporum33.861e-0967.0
LLPS-Chc-0994Chondrus crispus33.781e-1585.9
LLPS-Lem-0168Leptosphaeria maculans33.775e-1171.6
LLPS-Asfu-0608Aspergillus fumigatus33.336e-0965.1
LLPS-Nef-0472Neosartorya fischeri33.339e-0964.3
LLPS-Nec-0404Neurospora crassa33.12e-0966.2
LLPS-Trr-1281Trichoderma reesei32.886e-1068.2
LLPS-Asni-1082Aspergillus niger32.795e-0758.5
LLPS-Ast-1032Aspergillus terreus32.697e-0964.7
LLPS-Asc-0637Aspergillus clavatus32.693e-0862.4
LLPS-Pyt-0553Pyrenophora teres32.675e-1171.6
LLPS-Mao-0909Magnaporthe oryzae32.437e-1274.3
LLPS-Pytr-0869Pyrenophora triticirepentis32.03e-1069.3
LLPS-Blg-1169Blumeria graminis31.793e-0965.9
LLPS-Sac-1115Saccharomyces cerevisiae31.649e-1170.5
LLPS-Asf-0115Aspergillus flavus31.582e-0656.6
LLPS-Put-0265Puccinia triticina31.452e-1069.7
LLPS-Asg-0114Ashbya gossypii31.374e-1481.6
LLPS-Trv-1224Trichoderma virens31.361e-0863.9
LLPS-Fus-0053Fusarium solani31.332e-0966.6
LLPS-Crn-0481Cryptococcus neoformans31.331e-0657.0
LLPS-Spr-0465Sporisorium reilianum31.322e-1172.8
LLPS-Zyt-1154Zymoseptoria tritici31.174e-0862.0
LLPS-Phn-0058Phaeosphaeria nodorum30.871e-0863.9
LLPS-Beb-0836Beauveria bassiana30.828e-0654.7
LLPS-Pug-0564Puccinia graminis30.823e-1068.9
LLPS-Dos-0330Dothistroma septosporum30.673e-0965.5
LLPS-Usm-0237Ustilago maydis30.227e-1171.2
LLPS-Mel-0220Melampsora laricipopulina30.212e-1069.3
LLPS-Scs-0295Sclerotinia sclerotiorum30.132e-0863.2
LLPS-Scc-1237Schizosaccharomyces cryophilus29.871e-1070.1
LLPS-Asn-0733Aspergillus nidulans28.954e-0655.5
LLPS-Gaa-0111Gasterosteus aculeatus25.874e-60 229
LLPS-Anp-0458Anas platyrhynchos25.693e-59 227
LLPS-Scm-0200Scophthalmus maximus25.618e-72 266
LLPS-Xim-2400Xiphophorus maculatus23.936e-1994.4