• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Loa-3519
C9orf72

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Chromosome 9 open reading frame 72
Gene Name: C9orf72
Ensembl Gene: ENSLAFG00000008980.3
Ensembl Protein: ENSLAFP00000007536.3
Organism: Loxodonta africana
Taxa ID: 9785
LLPS Type: Scaffold


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Droplet, Cajal body, Nuclear pore complex, Nuclear speckle, Nucleolus, Stress granulePredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblENSLAFT00000008980.3ENSLAFP00000007536.3
UniProtG3T2V6, G3T2V6_LOXAF

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MSTLCPPPSP  AVAKTEIALS  GESPLLAATF  AYWDNILGPR  VRHIWAPKTE  QVLLSDGEIT  60
61    FLANHTLNGE  ILRNAESGAI  DVKFFVLSEK  GVIIVSLIFD  GNWNGDRSTY  GLSIILPQTE  120
121   LSFYLPLHRV  CVDRLTHIIR  KGRIWMHKER  QENVQKIVLE  GTERMEDQGQ  SIIPMLTGEV  180
181   IPVMELLSSM  KSHSVSEEID  IADTVLNDDD  IGDSCHEGFL  LNAISSHLQT  CGCSVVIGSS  240
241   AEKVNKIVRT  LCLFLTPAER  KCSRLCEAES  SFKYESGLFV  QGLLKDSTGS  FVLPFRQVMY  300
301   APYPTTHIDV  DVNTVKQMPP  CHEHIYNQRR  YMRSELTAFW  RATSEEDMAQ  DTIIYTDESF  360
361   TPDLNIFQDV  LHRDTLVKAF  LDQVFHLKPG  LSLRSTFLAQ  FLLVLHRKAL  TLIKYIEDDT  420
421   QKGKKPFKSL  RNLKIDLDLT  AEGDLNIIMA  LAEKIKPGLH  FVLSLGDLFY  TSVQERDVLD  480
481   DF  482
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGTCGACTC  TCTGTCCGCC  ACCATCTCCA  GCTGTTGCTA  AGACAGAAAT  TGCTTTAAGT  60
61    GGTGAATCAC  CTTTATTAGC  AGCTACCTTT  GCTTACTGGG  ACAATATTCT  CGGTCCTAGA  120
121   GTAAGGCACA  TTTGGGCTCC  AAAGACAGAA  CAGGTACTTC  TCAGCGATGG  AGAAATAACT  180
181   TTTCTTGCTA  ACCACACCCT  AAATGGGGAA  ATCCTTCGAA  ATGCAGAGAG  TGGAGCCATA  240
241   GATGTAAAGT  TTTTTGTCTT  GTCTGAAAAA  GGGGTAATTA  TTGTTTCTTT  AATCTTTGAT  300
301   GGAAACTGGA  ATGGGGATAG  GAGTACCTAT  GGACTATCAA  TTATACTCCC  ACAGACGGAA  360
361   CTGAGCTTCT  ATCTCCCACT  TCACAGAGTG  TGTGTTGATA  GATTAACACA  CATTATTCGC  420
421   AAAGGAAGGA  TATGGATGCA  TAAGGAAAGG  CAAGAAAATG  TTCAGAAGAT  TGTCTTAGAA  480
481   GGCACAGAGA  GAATGGAAGA  TCAGGGTCAG  AGTATTATTC  CAATGCTTAC  TGGGGAAGTA  540
541   ATTCCTGTAA  TGGAGCTGCT  TTCATCTATG  AAATCCCACA  GTGTTTCTGA  AGAAATAGAT  600
601   ATAGCTGATA  CGGTGCTCAA  TGATGATGAT  ATTGGTGACA  GTTGTCATGA  AGGCTTCCTT  660
661   CTCAATGCCA  TCAGCTCACA  CCTACAAACA  TGCGGCTGTT  CTGTAGTCAT  AGGTAGTAGT  720
721   GCAGAGAAAG  TGAATAAGAT  AGTGAGAACA  TTATGCCTTT  TTCTGACTCC  AGCAGAGAGA  780
781   AAATGCTCCA  GATTATGTGA  AGCCGAATCA  TCATTTAAGT  ACGAGTCAGG  GCTCTTTGTG  840
841   CAAGGCCTGC  TGAAGGATTC  AACTGGAAGC  TTTGTGCTAC  CCTTCCGGCA  AGTCATGTAT  900
901   GCTCCCTATC  CCACCACACA  CATAGATGTG  GATGTCAATA  CTGTGAAGCA  GATGCCACCG  960
961   TGTCATGAAC  ATATTTATAA  TCAGCGTAGA  TACATGAGAT  CAGAGCTAAC  AGCGTTCTGG  1020
1021  AGAGCCACTT  CAGAAGAAGA  CATGGCTCAG  GATACGATCA  TCTACACAGA  TGAGAGCTTC  1080
1081  ACGCCTGATT  TGAATATCTT  TCAAGATGTT  TTACACAGAG  ACACTCTGGT  AAAAGCCTTC  1140
1141  CTAGATCAGG  TCTTCCATTT  GAAACCTGGT  TTATCTCTCA  GGAGTACTTT  CCTTGCACAG  1200
1201  TTTCTGCTTG  TGCTTCACAG  AAAAGCCTTG  ACGTTAATAA  AATACATAGA  AGATGATACG  1260
1261  CAGAAGGGAA  AAAAGCCCTT  TAAATCTCTT  CGGAACCTGA  AGATAGACCT  TGATTTAACA  1320
1321  GCAGAGGGCG  ATCTTAACAT  AATAATGGCT  CTAGCTGAAA  AAATTAAACC  AGGCCTACAC  1380
1381  TTCGTTTTAT  CTTTGGGAGA  CCTTTTCTAC  ACTAGTGTAC  AAGAACGGGA  TGTTCTAGAT  1440
1441  GACTTT  1446

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Fud-3069Fukomys damarensis97.30.0 966
LLPS-Fec-2599Felis catus97.30.0 966
LLPS-Ict-3888Ictidomys tridecemlineatus97.30.0 966
LLPS-Chs-0221Chlorocebus sabaeus97.10.0 962
LLPS-Maf-0550Macaca fascicularis97.10.0 962
LLPS-Caj-4199Callithrix jacchus97.10.0 963
LLPS-Tut-1801Tursiops truncatus97.10.0 965
LLPS-Bot-2300Bos taurus97.10.0 963
LLPS-Ova-2746Ovis aries97.10.0 963
LLPS-Mup-3856Mustela putorius furo97.10.0 962
LLPS-Aim-2404Ailuropoda melanoleuca97.10.0 962
LLPS-Mal-1760Mandrillus leucophaeus97.10.0 962
LLPS-Paa-1100Papio anubis97.10.0 962
LLPS-Urm-1169Ursus maritimus97.10.0 962
LLPS-Pat-1910Pan troglodytes97.10.0 963
LLPS-Man-3290Macaca nemestrina97.10.0 962
LLPS-Otg-0314Otolemur garnettii97.10.0 963
LLPS-Orc-1953Oryctolagus cuniculus97.10.0 964
LLPS-Mam-1459Macaca mulatta97.10.0 962
LLPS-Cea-3978Cercocebus atys96.890.0 961
LLPS-Myl-3005Myotis lucifugus96.890.0 965
LLPS-Rhb-1305Rhinopithecus bieti96.890.0 962
LLPS-Eqc-1183Equus caballus96.890.0 961
LLPS-Cap-0203Cavia porcellus96.890.0 962
LLPS-Caf-0499Canis familiaris96.890.0 961
LLPS-Cas-3469Carlito syrichta96.890.0 963
LLPS-Mea-3714Mesocricetus auratus96.680.0 964
LLPS-Aon-1071Aotus nancymaae96.680.0 962
LLPS-Sus-3662Sus scrofa96.680.0 964
LLPS-Pap-4236Pan paniscus96.680.0 952
LLPS-Poa-3435Pongo abelii96.680.0 960
LLPS-Mum-2022Mus musculus96.470.0 962
LLPS-Dio-1259Dipodomys ordii96.470.0 959
LLPS-Nol-3113Nomascus leucogenys95.910.0 625
LLPS-Ran-4314Rattus norvegicus95.850.0 952
LLPS-Hos-0616Homo sapiens94.930.0 956
LLPS-Mod-1499Monodelphis domestica94.810.0 947
LLPS-Sah-1408Sarcophilus harrisii94.610.0 944
LLPS-Ora-1160Ornithorhynchus anatinus93.150.0 937
LLPS-Meg-2562Meleagris gallopavo92.640.0 724
LLPS-Pes-2707Pelodiscus sinensis92.530.0 929
LLPS-Fia-2329Ficedula albicollis92.320.0 928
LLPS-Tag-1205Taeniopygia guttata91.910.0 924
LLPS-Anc-0621Anolis carolinensis91.70.0 917
LLPS-Anp-0194Anas platyrhynchos91.490.0 919
LLPS-Gaga-2184Gallus gallus91.10.0 638
LLPS-Gog-0940Gorilla gorilla90.870.0 885
LLPS-Lac-0892Latimeria chalumnae79.30.0 787
LLPS-Leo-1479Lepisosteus oculatus77.590.0 780
LLPS-Ten-0173Tetraodon nigroviridis75.830.0 768
LLPS-Xet-2822Xenopus tropicalis75.410.0 756
LLPS-Pof-3467Poecilia formosa75.210.0 756
LLPS-Scm-1919Scophthalmus maximus75.050.0 756
LLPS-Tar-2446Takifugu rubripes74.790.0 749
LLPS-Orn-1745Oreochromis niloticus74.790.0 761
LLPS-Xim-1903Xiphophorus maculatus74.590.0 747
LLPS-Scf-1007Scleropages formosus74.260.0 727
LLPS-Gaa-0769Gasterosteus aculeatus73.550.0 742
LLPS-Orl-2006Oryzias latipes72.930.0 719
LLPS-Asm-0111Astyanax mexicanus72.730.0 593
LLPS-Dar-4209Danio rerio71.90.0 728
LLPS-Icp-0696Ictalurus punctatus70.660.0 716
LLPS-Abg-0841Absidia glauca26.268e-2199.8
LLPS-Cae-0381Caenorhabditis elegans25.451e-0861.6