• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Leo-a799

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: C1q and TNF related 4
Ensembl Gene: ENSLOCG00000017323.1
Ensembl Protein: ENSLOCP00000021428.1
Organism: Lepisosteus oculatus
Taxa ID: 7918
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Postsynaptic densityPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblENSLOCT00000021465.1ENSLOCP00000021428.1
UniProtW5NLB9, W5NLB9_LEPOC
GeneBankAHAT01030862
Entrez102682680

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     EMSPALQLLI  GLLYHMACGG  AVPGHMTQGP  VEHRSAFSVA  RTSSMEGGPK  MVVTFDKVYV  60
61    NIGNDFDPKT  GIFRCRIPGA  YYFSFTVGKF  PRKNLSVMLM  KNKNEVQVIV  YDEHHSKERK  120
121   VQSQSAMLQL  DFGDTVWLRL  HGDPRYALYS  NTGPYTTFNG  YLIYPDTYSF  QRNSLSYQEL  180
181   RHGPVGQGPA  DCAGAQRLDH  MLSDQPARRE  EEEEGEEEEE  EEGDPRSAFS  TARTQSVTGE  240
241   DQGALEHRPM  TFDTDFVNIG  GDFNASAGVF  TCRVPGAYYF  SFTIGKLPHK  TVSVKLMKNS  300
301   LEVQAMIYDD  SRSKRREMQS  QSLMLSLKKG  DTVWLYSHQH  EGYGAYSNHG  KYITFTGFLV  360
361   YPELPRPRTQ  NAAKEKNEI  379
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     GAGATGTCCC  CGGCTCTGCA  GCTCCTGATT  GGCTTGCTGT  ATCACATGGC  ATGCGGGGGG  60
61    GCGGTGCCGG  GTCACATGAC  ACAGGGGCCC  GTAGAGCACC  GCTCCGCCTT  CTCCGTGGCC  120
121   CGGACCAGCA  GCATGGAGGG  GGGCCCCAAG  ATGGTGGTGA  CCTTCGACAA  GGTCTACGTC  180
181   AACATCGGGA  ACGACTTCGA  CCCCAAGACC  GGTATCTTCC  GCTGCAGAAT  CCCCGGCGCC  240
241   TACTACTTCT  CCTTCACGGT  GGGCAAGTTT  CCCAGGAAGA  ACCTGTCCGT  GATGCTGATG  300
301   AAGAACAAGA  ACGAGGTGCA  GGTCATCGTC  TACGACGAGC  ACCACAGCAA  GGAGAGGAAG  360
361   GTGCAAAGTC  AGAGCGCCAT  GCTGCAGCTG  GATTTCGGGG  ACACCGTGTG  GCTGCGGCTG  420
421   CACGGAGACC  CCAGATACGC  TCTGTACAGC  AACACGGGGC  CGTACACCAC  CTTTAACGGG  480
481   TACCTGATCT  ACCCCGACAC  CTACTCCTTC  CAGAGGAACA  GCCTGTCCTA  CCAGGAGCTC  540
541   AGGCACGGCC  CTGTGGGCCA  AGGGCCAGCT  GACTGCGCCG  GGGCTCAGCG  CCTGGACCAC  600
601   ATGCTCTCCG  ACCAGCCAGC  GCGCCGCGAG  GAAGAAGAAG  AGGGTGAGGA  GGAGGAGGAG  660
661   GAGGAGGGGG  ACCCCAGGTC  GGCCTTCTCC  ACGGCCAGGA  CCCAGAGCGT  CACGGGGGAG  720
721   GACCAAGGCG  CGCTGGAGCA  CAGGCCCATG  ACCTTCGACA  CGGACTTCGT  CAACATCGGC  780
781   GGCGACTTCA  ACGCCTCGGC  CGGCGTCTTC  ACCTGCAGGG  TGCCCGGCGC  CTACTACTTC  840
841   TCCTTCACCA  TCGGCAAGCT  GCCCCACAAG  ACCGTCTCCG  TGAAGCTGAT  GAAGAACAGC  900
901   CTGGAGGTGC  AGGCCATGAT  CTACGACGAC  AGCCGCTCCA  AGAGGCGGGA  GATGCAGAGC  960
961   CAGAGCCTGA  TGCTGTCTCT  GAAGAAGGGA  GACACCGTCT  GGCTCTACAG  CCACCAGCAC  1020
1021  GAGGGCTACG  GCGCCTACAG  CAACCACGGC  AAGTACATCA  CCTTCACCGG  CTTCCTCGTC  1080
1081  TACCCGGAGC  TCCCACGGCC  CCGAACGCAG  AACGCCGCCA  AGGAAAAGAA  TGAAATATGA  1140

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Mum-a934Mus musculus6e-133392undefined
LLPS-Hos-a949Homo sapiens2e-134396undefined