• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Lac-3101
TPM1

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: Uncharacterized protein
Gene Name: TPM1
Ensembl Gene: ENSLACG00000012977.2
Ensembl Protein: ENSLACP00000022146.1
Organism: Latimeria chalumnae
Taxa ID: 7897
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Postsynaptic densityPredicted from orthologs(View)

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MDAIKKKMQM  LKLDKENALD  RAEQAETDKK  AAEDKSKQLE  DEIMQLGKKL  RTAEDERDKV  60
61    LEEFHRAEES  LLAAEQNATK  LDDELVALQK  KLKGTEDELD  KYSESLKDAQ  EKLELAEKKA  120
121   TDAEGDVASL  NRRIQLVEEE  LDRAQERLAT  ALQKLEEAEK  AADESERGMK  VIENRALKDE  180
181   EKMEIQEIQL  KEAKHIAEEA  DRKYEEVARK  LVIIESDLER  AEERAELSES  KCAELEEELK  240
241   TVTNNLKSLE  AQAEKYSQKE  DKYEEEIKVL  SDKLKEAETR  AEFAERTVAK  LEKTIDDLEE  300
301   TEKLAKAKEE  NLEMNQMLDQ  TLLELNNM  328
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGATGCCA  TCAAGAAGAA  GATGCAGATG  CTCAAGCTCG  ACAAGGAGAA  TGCCTTGGAC  60
61    AGAGCTGAGC  AAGCTGAAAC  AGACAAGAAA  GCAGCCGAGG  ACAAGAGCAA  GCAGTTAGAG  120
121   GATGAAATTA  TGCAATTGGG  AAAGAAATTG  CGTACAGCGG  AAGATGAAAG  GGATAAAGTA  180
181   TTAGAAGAAT  TCCACCGAGC  TGAAGAAAGT  CTGTTAGCTG  CAGAGCAGAA  CGCCACCAAG  240
241   CTGGATGATG  AGTTGGTGGC  TCTGCAGAAG  AAACTGAAGG  GTACTGAGGA  TGAGCTGGAC  300
301   AAGTACTCTG  AGTCCTTGAA  AGATGCCCAG  GAGAAGCTGG  AACTGGCTGA  GAAGAAAGCC  360
361   ACTGATGCTG  AGGGTGATGT  AGCTTCTCTA  AACAGACGTA  TCCAGCTGGT  TGAGGAGGAG  420
421   TTGGATCGTG  CTCAGGAGCG  TCTGGCCACT  GCCCTGCAGA  AGTTGGAGGA  GGCCGAGAAG  480
481   GCTGCAGATG  AGAGCGAGAG  AGGTATGAAG  GTCATTGAGA  ACAGAGCCTT  GAAGGATGAG  540
541   GAGAAGATGG  AAATTCAGGA  GATCCAGCTC  AAAGAGGCCA  AACACATTGC  TGAGGAGGCT  600
601   GACCGCAAAT  ATGAAGAGGT  TGCCCGTAAA  CTGGTGATCA  TTGAGAGTGA  TCTGGAGCGT  660
661   GCTGAAGAGC  GTGCTGAACT  TTCAGAAAGC  AAATGTGCTG  AGCTTGAAGA  GGAGTTGAAA  720
721   ACTGTGACCA  ACAACCTGAA  GTCACTGGAG  GCTCAGGCCG  AGAAGTACTC  ACAGAAGGAA  780
781   GACAAGTATG  AAGAGGAGAT  CAAGGTCCTC  AGTGACAAAC  TAAAAGAGGC  TGAAACCCGT  840
841   GCTGAGTTTG  CTGAAAGGAC  AGTAGCTAAG  CTGGAGAAGA  CCATTGATGA  CTTAGAAGAA  900
901   ACAGAGAAAC  TGGCAAAAGC  TAAAGAAGAA  AACCTTGAGA  TGAATCAGAT  GCTGGATCAA  960
961   ACTCTCCTGG  AGTTAAACAA  CATGTGA  987

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Anc-0795Anolis carolinensis93.145e-64 208
LLPS-Pes-2819Pelodiscus sinensis92.744e-103 310
LLPS-Ora-2616Ornithorhynchus anatinus92.233e-75 237
LLPS-Sus-3229Sus scrofa91.24e-100 307
LLPS-Anp-1987Anas platyrhynchos90.581e-85 265
LLPS-Mup-3468Mustela putorius furo89.95e-135 394
LLPS-Eqc-2862Equus caballus89.569e-137 399
LLPS-Fec-4771Felis catus89.021e-144 418
LLPS-Meg-1608Meleagris gallopavo89.022e-146 423
LLPS-Maf-2668Macaca fascicularis88.728e-137 399
LLPS-Aon-4456Aotus nancymaae88.728e-137 399
LLPS-Cea-4437Cercocebus atys88.728e-137 399
LLPS-Caj-0939Callithrix jacchus88.728e-137 399
LLPS-Aim-3563Ailuropoda melanoleuca88.727e-144 417
LLPS-Paa-3596Papio anubis88.728e-137 399
LLPS-Loa-3449Loxodonta africana88.724e-144 417
LLPS-Man-1221Macaca nemestrina88.728e-137 399
LLPS-Caf-4273Canis familiaris88.721e-143 416
LLPS-Poa-1983Pongo abelii88.728e-137 399
LLPS-Mam-2276Macaca mulatta88.728e-137 399
LLPS-Nol-3530Nomascus leucogenys88.728e-137 399
LLPS-Mum-4280Mus musculus88.411e-143 416
LLPS-Mea-3632Mesocricetus auratus88.411e-143 416
LLPS-Gog-4167Gorilla gorilla88.412e-136 397
LLPS-Tut-2218Tursiops truncatus88.413e-143 415
LLPS-Dio-3967Dipodomys ordii88.413e-143 415
LLPS-Hos-1695Homo sapiens88.412e-136 397
LLPS-Pap-2236Pan paniscus88.412e-136 397
LLPS-Pat-4422Pan troglodytes88.412e-136 397
LLPS-Ict-3031Ictidomys tridecemlineatus88.413e-143 415
LLPS-Orl-1586Oryzias latipes88.116e-146 422
LLPS-Myl-0144Myotis lucifugus88.114e-143 415
LLPS-Orn-3940Oreochromis niloticus88.116e-146 422
LLPS-Mal-0079Mandrillus leucophaeus87.932e-111 332
LLPS-Fud-4365Fukomys damarensis87.594e-118 349
LLPS-Cap-3474Cavia porcellus87.595e-118 349
LLPS-Rhb-2475Rhinopithecus bieti87.51e-140 408
LLPS-Urm-3402Ursus maritimus86.698e-118 349
LLPS-Leo-0220Lepisosteus oculatus86.019e-143 414
LLPS-Gaa-3643Gasterosteus aculeatus85.598e-139 404
LLPS-Xet-3189Xenopus tropicalis83.169e-114 338
LLPS-Pof-0233Poecilia formosa82.156e-114 339
LLPS-Otg-4506Otolemur garnettii81.824e-112 334
LLPS-Fia-1932Ficedula albicollis81.825e-109 326
LLPS-Gaga-0233Gallus gallus81.826e-109 327
LLPS-Tag-2669Taeniopygia guttata81.825e-109 326
LLPS-Sah-2524Sarcophilus harrisii81.488e-112 333
LLPS-Ran-3829Rattus norvegicus81.486e-112 334
LLPS-Mod-4019Monodelphis domestica81.488e-112 333
LLPS-Ere-0982Erinaceus europaeus81.142e-56 189
LLPS-Scm-2528Scophthalmus maximus81.144e-113 337
LLPS-Dar-3997Danio rerio81.142e-112 335
LLPS-Scf-3345Scleropages formosus80.815e-110 329
LLPS-Ten-2810Tetraodon nigroviridis80.811e-112 336
LLPS-Icp-3444Ictalurus punctatus79.84e-102 310
LLPS-Ova-3048Ovis aries78.118e-99 300
LLPS-Chs-1294Chlorocebus sabaeus77.17e-103 310
LLPS-Xim-2983Xiphophorus maculatus77.15e-103 311
LLPS-Tar-3391Takifugu rubripes76.432e-94 289
LLPS-Asm-3554Astyanax mexicanus68.92e-97 296
LLPS-Cis-0539Ciona savignyi65.666e-78 246
LLPS-Cii-2150Ciona intestinalis65.321e-78 248
LLPS-Cae-1507Caenorhabditis elegans47.972e-26 110
LLPS-Drm-2265Drosophila melanogaster42.913e-31 124