LLPS-Hos-2343
WDR47

▼ OVERVIEW

Status: Reviewed
Protein Name: WD repeat-containing protein 47; Neuronal enriched MAP-interacting protein; Nemitin
Gene Name: WDR47, KIAA0893
Ensembl Gene: ENSG00000085433.15
Ensembl Protein: ENSP00000358979.3
Organism: Homo sapiens
Taxa ID: 9606
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateDescriptionTissue/CellPMIDs
Stress granule
"...A list of candidate SG proteins identified by mass spectrometry in NPCs, including statistical analysis."
Neural progenitor cells29373831
Postsynaptic densityPredicted from orthologsN/A(View)

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MTAEETVNVK  EVEIIKLILD  FLNSKKLHIS  MLALEKESGV  INGLFSDDML  FLRQLILDGQ  60
61    WDEVLQFIQP  LECMEKFDKK  RFRYIILKQK  FLEALCVNNA  MSAEDEPQHV  RFLFLKLEFT  120
121   MQEAVQCLHA  LEEYCPSKDD  YSKLCLLLTL  PRLTNHAEFK  DWNPSTARVH  CFEEACVMVA  180
181   EFIPADRKLS  EAGFKASNNR  LFQLVMKGLL  YECCVEFCQS  KATGEEITES  EVLLGIDLLC  240
241   GNGCDDLDLS  LLSWLQNLPS  SVFSCAFEQK  MLNIHVDKLL  KPTKAAYADL  LTPLISKLSP  300
301   YPSSPMRRPQ  SADAYMTRSL  NPALDGLTCG  LTSHDKRISD  LGNKTSPMSH  SFANFHYPGV  360
361   QNLSRSLMLE  NTECHSIYEE  SPERSDTPVD  AQRPIGSEIL  GQSSVSEKEP  ANGAQNPGPA  420
421   KQEKNELRDS  TEQFQEYYRQ  RLRYQQHLEQ  KEQQRQIYQQ  MLLEGGVNQE  DGPDQQQNLT  480
481   EQFLNRSIQK  LGELNIGMDG  LGNEVSALNQ  QCNGSKGNGS  NGSSVTSFTT  PPQDSSQRLT  540
541   HDASNIHTST  PRNPGSTNHI  PFLEESPCGS  QISSEHSVIK  PPLGDSPGSL  SRSKGEEDDK  600
601   SKKQFVCINI  LEDTQAVRAV  AFHPAGGLYA  VGSNSKTLRV  CAYPDVIDPS  AHETPKQPVV  660
661   RFKRNKHHKG  SIYCVAWSPC  GQLLATGSND  KYVKVLPFNA  ETCNATGPDL  EFSMHDGTIR  720
721   DLAFMEGPES  GGAILISAGA  GDCNIYTTDC  QRGQGLHALS  GHTGHILALY  TWSGWMIASG  780
781   SQDKTVRFWD  LRVPSCVRVV  GTTFHGTGSA  VASVAVDPSG  RLLATGQEDS  SCMLYDIRGG  840
841   RMVQSYHPHS  SDVRSVRFSP  GAHYLLTGSY  DMKIKVTDLQ  GDLTKQLPIM  VVGEHKDKVI  900
901   QCRWHTQDLS  FLSSSADRTV  TLWTYNG  927
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGACGGCTG  AAGAAACAGT  GAATGTAAAA  GAGGTTGAAA  TCATTAAGCT  AATTTTGGAC  60
61    TTCCTGAATT  CAAAGAAGCT  TCACATTAGT  ATGCTGGCCC  TGGAGAAGGA  AAGTGGAGTC  120
121   ATAAATGGCC  TGTTTTCAGA  TGATATGCTT  TTCCTGAGGT  TTCGTTATAT  TATCCTGAAG  180
181   CAGAAGTTTT  TAGAAGCTTT  ATGTGTTAAC  AACGCGATGT  CAGCAGAAGA  TGAGCCCCAG  240
241   CATCTGGAAT  TTACCATGCA  AGAAGCTGTG  CAATGTTTAC  ATGCTCTAGA  AGAATACTGT  300
301   CCTTCTAAAG  ATGACTATAG  TAAGCTCTGT  TTGCTTTTGA  CTTTGCCTCG  TCTGACCAAT  360
361   CATGCCGAGT  TTAAGGACTG  GAATCCCAGC  ACCGCACGAG  TTCACTGTTT  TGAAGAGGCT  420
421   TGTGTCATGG  TTGCAGAATT  CATCCCTGCT  GATAGGAAGC  TAAGTGAAGC  TGGTTTTAAG  480
481   GCTAGTAACA  ATCGTTTATT  TCAGCTTGTA  ATGAAAGGCC  TGCTTTATGA  ATGCTGTGTA  540
541   GAATTTTGTC  AGAGTAAAGC  AACTGGAGAA  GAAATTACAG  AAAGCGAAGT  GCTTCTTGGC  600
601   ATCGACCTCT  TATGTGGTAA  TGGTTGTGAT  GATTTGGATC  TGAGTTTACT  GTCATGGCTT  660
661   CAGAATCTTC  CATCTTCTGT  CTTCTCTTGT  GCTTTTGAAC  AGAAAATGCT  TAATATTCAT  720
721   GTTGACAAAC  TTCTGAAACC  TACAAAAGCT  GCATATGCTG  ATCTTTTGAC  TCCTCTTATC  780
781   AGCAAACTCT  CTCCCTATCC  ATCATCCCCA  ATGAGAAGAC  CTCAATCAGC  TGATGCCTAT  840
841   ATGACCCGCT  CTCTGAATCC  TGCTTTAGAT  GGCCTCACCT  GTGGACTAAC  CAGTCATGAT  900
901   AAGAGAATTT  CAGACCTTGG  AAACAAAACT  TCTCCAATGT  CACACTCCTT  TGCTAACTTC  960
961   CATTATCCAG  GGGTACAAAA  CCTCAGTAGA  AGTCTCATGC  TTGAGAATAC  AGAATGTCAC  1020
1021  AGTATTTACG  AAGAATCCCC  TGAGCGTGAT  ACACCTGTTG  ATGCACAGAG  GCCTATCGGC  1080
1081  AGTGAAATCT  TGGGCCAGAG  TTCAGTTTCA  GAAAAAGAGC  CTGCAAATGG  AGCACAGAAT  1140
1141  CCAGGACCAG  CTAAACAAGA  AAAAAATGAG  CTTCGAGATT  CAACAGAACA  ATTTCAAGAA  1200
1201  TATTATAGGC  AAAGATTACG  CTATCAACAG  CATTTAGAAC  AGAAGGAGCA  ACAGCGGCAG  1260
1261  ATATACCAAC  AGATGTTGCT  TGAAGGAGGC  GTGAATCAGG  AGGATGGTCC  TGATCAGCAG  1320
1321  CAGAATCTTA  CTGAACAGTT  CCTTAATAGG  TCCATTCAAA  AGCTTGGTGA  ATTAAATATT  1380
1381  GGAATGGATG  GCCTTGGTAA  TGAGGTATCA  GCACTCAACC  AGCAATGTAA  TGGGAGCAAA  1440
1441  GGCAATGGAT  CTAATGGTTC  TTCTGTGACT  AGTTTTACTA  CACCACCCCA  AGACTCTAGT  1500
1501  CAGAGATTAA  CACATGATGC  TTCAAATATT  CATACAAGCA  CTCCTCGTAA  TCCTGGATCA  1560
1561  ACAAATCACA  TACCTTTTCT  GGAGGAATCA  CCTTGTGGAA  GCCAAATCTC  TTCAGAACAT  1620
1621  TCGGTCATTA  AGCCACCTCT  TGGAGATTCT  CCAGGGAGTC  TTTCAAGGTC  GAAAGGGGAA  1680
1681  GAGGATGACA  AATCAAAAAA  GCAGTTTGTT  TGTATTAATA  TCCTAGAAGA  CACACAAGCT  1740
1741  GTTAGAGCAG  TGGCTTTTCA  TCCAGCTGGA  GGTTTATATG  CTGTTGGTTC  AAATTCAAAA  1800
1801  ACTCTGAGAG  TATGTGCCTA  TCCAGATGTA  ATTGATCCAA  GTGCACATGA  GACTCCTAAG  1860
1861  CAGCCGGTGG  TACGTTTTAA  AAGGAATAAA  CATCATAAAG  GATCCATTTA  CTGTGTGGCC  1920
1921  TGGAGTCCTT  GTGGGCAGTT  ATTAGCAACA  GGATCAAATG  ACAAATACGT  CAAAGTGCTG  1980
1981  CCCTTCAATG  CAGAGACTTG  TAACGCAACA  GTTTCAGGAC  CAGATCTGGA  ATTTAGTATG  2040
2041  CATGATGGAA  CAATTAGAGA  CTTGGCATTT  ATGGAAGGCC  CAGAAAGCGG  AGGAGCTATT  2100
2101  TTAATAAGTG  CTGGAGCAGG  GGATTGTAAC  ATTTATACAA  CCGATTGTCA  AAGAGGACAG  2160
2161  GGCCTCCATG  CTTTGAGTGG  ACATACTGGG  CATATTTTAG  CACTTTATAC  CTGGAGTGGC  2220
2221  TGGATGATTG  CATCTGGTTC  CCAAGATAAG  ACTGTTAGAT  TTTGGGATCT  TCGAGTACCA  2280
2281  AGTTGTGTTC  GTGTTGTTGG  CACAACATTT  CATGGAACTG  GCAGTGCAGT  GGCATCTGTA  2340
2341  GCTGTAGATC  CCAGTGGTCG  TCTCTTAGCC  ACAGGTCAAG  AAGATTCTAG  CTGCATGTTG  2400
2401  TATGACATAA  GAGGAGGAAG  AATGGTACAA  AGTTATCATC  CTCATTCCAG  TGATGTTCGC  2460
2461  TCTGTTCGAT  TCTCCCCTGG  AGCTCACTAC  TTGCTAACAG  GCTCTTATGA  TATGAAAATA  2520
2521  AAGGTGACAG  ACCTACAAGG  GGACCTCACC  AAGCAGCTTC  CTATCATGGT  GGTGGGGGAG  2580
2581  CACAAGGACA  AAGTGATTCA  GTGCAGATGG  CACACCCAGG  ATCTTTCCTT  CCTGTCATCC  2640
2641  TCTGCAGATA  GAACTGTCAC  CCTCTGGACT  TACAATGGGT  AG  2682

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Pat-3882Pan troglodytes99.890.01711
LLPS-Nol-3000Nomascus leucogenys99.570.01706
LLPS-Paa-4094Papio anubis99.570.01708
LLPS-Pap-1886Pan paniscus99.240.01695
LLPS-Gog-1604Gorilla gorilla99.030.01691
LLPS-Poa-1277Pongo abelii98.810.01685
LLPS-Maf-3249Macaca fascicularis98.810.01686
LLPS-Man-3433Macaca nemestrina98.710.01680
LLPS-Mam-3110Macaca mulatta98.60.01679
LLPS-Mal-2029Mandrillus leucophaeus98.60.01679
LLPS-Chs-3106Chlorocebus sabaeus98.60.01679
LLPS-Aon-3892Aotus nancymaae98.490.01675
LLPS-Caj-2740Callithrix jacchus98.380.01678
LLPS-Aim-3703Ailuropoda melanoleuca98.060.01685
LLPS-Fec-3754Felis catus97.950.01680
LLPS-Otg-1005Otolemur garnettii97.840.01677
LLPS-Urm-3487Ursus maritimus97.520.01669
LLPS-Orc-1729Oryctolagus cuniculus97.090.01637
LLPS-Eqc-4118Equus caballus96.820.01215
LLPS-Ict-3078Ictidomys tridecemlineatus96.770.01656
LLPS-Mup-0766Mustela putorius furo96.60.01316
LLPS-Ova-3638Ovis aries96.440.01641
LLPS-Sus-0481Sus scrofa96.340.01623
LLPS-Bot-0814Bos taurus96.330.01641
LLPS-Caf-3275Canis familiaris96.325e-107 355
LLPS-Cas-1820Carlito syrichta96.220.01635
LLPS-Loa-1032Loxodonta africana95.910.01625
LLPS-Rhb-1915Rhinopithecus bieti95.90.01618
LLPS-Myl-0931Myotis lucifugus95.90.01631
LLPS-Fud-3012Fukomys damarensis95.580.01598
LLPS-Cap-3306Cavia porcellus95.360.01596
LLPS-Mum-3689Mus musculus94.820.01617
LLPS-Ran-2189Rattus norvegicus94.720.01612
LLPS-Cea-3380Cercocebus atys92.360.01512
LLPS-Mea-2861Mesocricetus auratus91.910.01546
LLPS-Mod-3315Monodelphis domestica91.260.01448
LLPS-Anp-1598Anas platyrhynchos90.650.01555
LLPS-Ora-0428Ornithorhynchus anatinus90.350.0 726
LLPS-Meg-1435Meleagris gallopavo89.990.01532
LLPS-Sah-1517Sarcophilus harrisii89.890.01516
LLPS-Pes-0688Pelodiscus sinensis89.830.01540
LLPS-Fia-0932Ficedula albicollis89.770.01521
LLPS-Tag-2514Taeniopygia guttata89.680.01528
LLPS-Gaga-3725Gallus gallus89.660.01526
LLPS-Anc-0664Anolis carolinensis88.690.01489
LLPS-Leo-2614Lepisosteus oculatus81.30.01368
LLPS-Lac-2268Latimeria chalumnae80.170.01375
LLPS-Scf-0918Scleropages formosus78.920.01332
LLPS-Asm-1462Astyanax mexicanus77.710.01272
LLPS-Xim-2902Xiphophorus maculatus76.410.01262
LLPS-Pof-1452Poecilia formosa76.260.01264
LLPS-Dar-3222Danio rerio76.210.01244
LLPS-Scm-3312Scophthalmus maximus76.180.01261
LLPS-Tar-0150Takifugu rubripes75.670.01249
LLPS-Orl-3583Oryzias latipes75.670.01256
LLPS-Orn-0238Oreochromis niloticus75.640.01262
LLPS-Icp-2422Ictalurus punctatus74.380.01232
LLPS-Ten-0626Tetraodon nigroviridis73.940.01233
LLPS-Gaa-2892Gasterosteus aculeatus73.580.01216
LLPS-Drm-1243Drosophila melanogaster52.421e-110 351
LLPS-Cae-0783Caenorhabditis elegans48.634e-94 324
LLPS-Cii-1755Ciona intestinalis44.22e-76 258
LLPS-Xet-2036Xenopus tropicalis30.988e-1789.4
LLPS-Chc-0712Chondrus crispus30.384e-1791.3
LLPS-Dio-0610Dipodomys ordii28.864e-1687.4
LLPS-Hov-2118Hordeum vulgare27.941e-0656.6
LLPS-Osl-1299Ostreococcus lucimarinus27.884e-1686.7
LLPS-Pot-0799Populus trichocarpa27.866e-1787.8
LLPS-Sem-1965Selaginella moellendorffii27.411e-1789.4
LLPS-Tra-2112Triticum aestivum22.94e-1787.8
LLPS-Zem-2127Zea mays22.521e-1686.3
LLPS-Sob-2144Sorghum bicolor22.527e-1787.0
LLPS-Sei-2507Setaria italica22.522e-1687.0
LLPS-Org-1769Oryza glaberrima21.375e-1684.7
LLPS-Ors-1566Oryza sativa21.375e-1684.7
LLPS-Orp-0388Oryza punctata21.376e-1684.0
LLPS-Orni-1990Oryza nivara21.376e-1684.0
LLPS-Ori-2400Oryza indica21.376e-1684.0