• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Gor-2064
B456_008G276300

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2; Cleavage and polyadenylation specificity factor 100 kDa subunit
Gene Name: B456_008G276300
Ensembl Gene: B456_008G276300
Ensembl Protein: KJB52780
Organism: Gossypium raimondii
Taxa ID: 29730
LLPS Type: LLPS regulator


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Cleavage body, Histone locus body, Nuclear specklePredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblKJB52780KJB52780
UniProtA0A0D2UAV8, A0A0D2UAV8_GOSRA
GeneBankCM001747KJB52780.1
RefSeqXM_012584691.1XP_012440145.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MGTSVQVTPL  CGVYNENPLS  YLVSIDGFNF  LIDCGWNDLF  DPSLLQPLSR  VASTVDAVLL  60
61    SHSDTLHLGA  LPYAMKQFGL  SAPFYSTEPV  HRLGLLTMYD  HYLSRKQVSD  FDLFSLDDID  120
121   AAFQSIARLT  YSQNYHLSGK  GEGIVIAPHV  AGHLLGGTVW  KITKDGEDVI  YAVDFNRRKE  180
181   KHLNGTVLES  FVRPAVLITD  AYNALNNQPP  KPQRERDRDF  VEIISKTLEG  GGNVLLPVDT  240
241   AGRVLELLLV  LEENWSLKSL  NFPIYFVTYV  SASTIDYVKS  FLEWMSDAIA  KSFETSRDNA  300
301   FLLKNIKLLT  SKSELDSVPD  GPKVILASMA  SLEAGFSHDI  FVEWAADVKN  LVLFTERGQF  360
361   GTLARMLQAD  PPPKAVKVTM  SRRVPLTGEE  LIAYEEEQNR  LKKEEALKAS  LIKEEESKAS  420
421   LATDVNSSDP  MVIDTHNKHP  SLDGLGQHGS  RFRDVLIDGF  VPPSSSVAPM  FPFYDNTSDW  480
481   DDFGEVINPD  DYVIKDEDMD  QGATRTGGDM  DGKLDEGSAS  LILDTTPSKV  ISNELTVQVK  540
541   SSLVYMDYEG  RSDGRSVKSI  LAHVAPLKLV  LVHGSAEATE  HLKQHCLKHV  CPHVYAPQIE  600
601   ETIDVTSDLC  AYKVQLSEKL  MSNVLFKKLG  DYEIAWVDAE  VGKTENDMLS  LLPISTPAPP  660
661   HKSVVVGDLK  MADFKQFLAS  KGVKVEFAAG  ALRCGEYVTL  RKVGVASQKG  GGSGTQQIII  720
721   EGPLCEDYYK  IREYLYSQFY  LL  742
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGGGACGT  CGGTTCAGGT  AACCCCACTC  TGTGGAGTAT  ACAACGAGAA  CCCTCTCTCT  60
61    TACTTAGTCT  CAATCGACGG  CTTCAACTTC  TTAATCGACT  GTGGATGGAA  TGACCTCTTT  120
121   GACCCCTCCC  TTCTTCAACC  CCTCTCCAGG  GTTGCTTCGA  CGGTAGACGC  GGTGTTGCTG  180
181   TCGCATTCGG  ACACGCTCCA  CCTCGGTGCT  CTTCCGTACG  CTATGAAACA  ATTTGGACTC  240
241   TCGGCTCCCT  TTTATTCCAC  TGAACCGGTT  CATCGATTAG  GCCTTCTCAC  TATGTACGAT  300
301   CATTATCTCT  CTCGTAAGCA  AGTATCAGAC  TTCGATTTGT  TCTCCCTGGA  TGACATTGAT  360
361   GCTGCTTTCC  AGAGTATAGC  TCGGCTAACC  TACTCGCAGA  ATTATCATTT  ATCTGGAAAA  420
421   GGTGAGGGTA  TTGTAATTGC  TCCTCATGTT  GCTGGCCATC  TCTTGGGTGG  TACTGTTTGG  480
481   AAGATAACAA  AGGACGGAGA  AGATGTCATA  TATGCTGTCG  ACTTTAACCG  ACGCAAAGAG  540
541   AAGCATTTGA  ATGGAACTGT  TCTAGAATCT  TTTGTTCGGC  CTGCTGTTCT  TATAACTGAT  600
601   GCCTACAATG  CTTTGAACAA  TCAACCTCCT  AAGCCGCAAA  GGGAGAGGGA  CAGAGATTTT  660
661   GTTGAAATCA  TCTCGAAGAC  TCTAGAAGGT  GGTGGAAATG  TGTTGCTACC  TGTCGATACC  720
721   GCTGGTCGTG  TCTTGGAACT  TCTCTTGGTT  TTAGAAGAGA  ACTGGTCATT  GAAGTCTTTG  780
781   AACTTCCCCA  TCTACTTTGT  GACATATGTT  TCAGCAAGCA  CAATTGATTA  TGTCAAGAGT  840
841   TTTCTTGAGT  GGATGAGTGA  TGCTATAGCT  AAATCCTTTG  AAACTTCACG  TGATAATGCT  900
901   TTTCTTCTGA  AGAATATCAA  ACTTTTAACA  AGCAAGAGTG  AACTTGATAG  CGTGCCTGAT  960
961   GGTCCCAAGG  TTATACTAGC  ATCCATGGCC  AGCTTAGAAG  CAGGATTTTC  TCATGATATT  1020
1021  TTTGTTGAGT  GGGCAGCAGA  TGTCAAGAAT  CTTGTTCTAT  TTACTGAAAG  GGGCCAGTTT  1080
1081  GGCACGTTAG  CTCGTATGCT  CCAGGCAGAT  CCACCTCCAA  AAGCTGTTAA  AGTCACGATG  1140
1141  TCTAGGAGGG  TTCCTTTGAC  TGGGGAGGAG  TTGATTGCTT  ATGAAGAAGA  ACAGAACCGG  1200
1201  TTGAAAAAAG  AAGAAGCTTT  AAAAGCTAGT  CTTATCAAAG  AGGAAGAATC  TAAAGCTTCT  1260
1261  CTTGCAACCG  ATGTCAATTC  TAGTGATCCA  ATGGTTATTG  ACACTCATAA  TAAGCATCCC  1320
1321  TCACTGGATG  GGTTAGGTCA  ACATGGGAGC  AGATTCCGTG  ATGTTCTGAT  TGATGGATTT  1380
1381  GTGCCCCCAT  CCTCTAGTGT  TGCCCCAATG  TTTCCCTTCT  ATGACAATAC  TTCTGATTGG  1440
1441  GATGACTTTG  GTGAGGTCAT  AAATCCTGAT  GATTATGTAA  TAAAGGATGA  AGATATGGAC  1500
1501  CAAGGAGCTA  CGCGTACTGG  TGGGGATATG  GATGGAAAAC  TTGATGAAGG  CTCTGCTAGT  1560
1561  TTGATACTTG  ACACAACACC  TTCAAAAGTC  ATATCTAACG  AGTTGACTGT  GCAAGTAAAG  1620
1621  TCTTCACTTG  TTTACATGGA  TTATGAGGGG  CGTTCTGATG  GTCGTTCTGT  CAAATCAATC  1680
1681  CTTGCCCACG  TGGCTCCATT  AAAGCTTGTC  TTGGTGCATG  GATCAGCAGA  GGCAACAGAG  1740
1741  CATTTGAAGC  AACATTGCTT  GAAACATGTT  TGTCCTCATG  TTTATGCTCC  CCAAATTGAA  1800
1801  GAAACAATTG  ATGTCACATC  TGATTTATGT  GCTTATAAGG  TACAATTATC  TGAGAAGTTG  1860
1861  ATGAGCAATG  TCCTCTTTAA  AAAGTTAGGA  GACTACGAAA  TAGCTTGGGT  GGATGCTGAA  1920
1921  GTAGGGAAGA  CAGAAAACGA  CATGCTCTCA  TTACTACCCA  TCTCGACACC  AGCTCCCCCG  1980
1981  CATAAATCTG  TGGTTGTAGG  TGATCTGAAA  ATGGCAGATT  TCAAGCAGTT  TCTTGCCAGT  2040
2041  AAAGGTGTCA  AGGTAGAATT  TGCTGCAGGG  GCGTTGCGAT  GCGGTGAATA  CGTGACATTA  2100
2101  CGCAAAGTTG  GGGTTGCAAG  CCAAAAGGGT  GGTGGTTCTG  GTACACAGCA  AATCATAATC  2160
2161  GAAGGTCCCT  TGTGCGAAGA  TTACTACAAG  ATACGGGAAT  ATCTATATTC  CCAGTTTTAT  2220
2221  TTACTTTAG  2229

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Coc-1969Corchorus capsularis92.180.01355
LLPS-Thc-0541Theobroma cacao91.370.01370
LLPS-Mae-1581Manihot esculenta85.20.01278
LLPS-Pot-1783Populus trichocarpa82.880.01224
LLPS-Prp-2105Prunus persica82.610.01245
LLPS-Hea-0737Helianthus annuus82.350.01207
LLPS-Via-0453Vigna angularis81.670.01219
LLPS-Viv-2009Vitis vinifera81.670.01196
LLPS-Glm-1093Glycine max81.540.01211
LLPS-Met-0002Medicago truncatula81.40.01221
LLPS-Phv-0403Phaseolus vulgaris81.270.01209
LLPS-Cus-1265Cucumis sativus80.890.01213
LLPS-Sol-2082Solanum lycopersicum80.320.01214
LLPS-Arl-0601Arabidopsis lyrata79.840.01192
LLPS-Dac-0760Daucus carota79.810.01202
LLPS-Nia-0594Nicotiana attenuata79.510.01199
LLPS-Art-2675Arabidopsis thaliana79.440.01191
LLPS-Brr-1295Brassica rapa79.170.01183
LLPS-Bro-0523Brassica oleracea79.030.01179
LLPS-Brn-1032Brassica napus78.90.01179
LLPS-Mua-1926Musa acuminata75.470.01125
LLPS-Vir-1714Vigna radiata74.710.01123
LLPS-Amt-0985Amborella trichopoda74.090.01080
LLPS-Orm-1953Oryza meridionalis73.666e-110 353
LLPS-Orbr-1161Oryza brachyantha73.620.01072
LLPS-Orni-0924Oryza nivara73.230.01068
LLPS-Orr-0964Oryza rufipogon73.230.01072
LLPS-Ors-1426Oryza sativa73.230.01072
LLPS-Orp-1070Oryza punctata72.950.01066
LLPS-Sob-1458Sorghum bicolor72.950.01054
LLPS-Orgl-0933Oryza glumaepatula72.840.01066
LLPS-Orb-1683Oryza barthii72.840.01066
LLPS-Sei-1566Setaria italica72.410.01041
LLPS-Ori-1794Oryza indica72.370.01043
LLPS-Brd-1327Brachypodium distachyon72.180.01056
LLPS-Hov-2017Hordeum vulgare72.010.01055
LLPS-Lep-1963Leersia perrieri71.840.0 644
LLPS-Tra-1742Triticum aestivum71.470.01051
LLPS-Tru-0645Triticum urartu69.930.01024
LLPS-Zem-1257Zea mays69.430.01024
LLPS-Php-0423Physcomitrella patens59.20.0 866
LLPS-Sem-0093Selaginella moellendorffii57.950.0 832
LLPS-Aim-1773Ailuropoda melanoleuca46.341e-98 317
LLPS-Dar-0775Danio rerio40.839e-150 463
LLPS-Tar-0313Takifugu rubripes40.661e-1275.5
LLPS-Ten-0859Tetraodon nigroviridis40.668e-1376.3
LLPS-Leo-2515Lepisosteus oculatus40.616e-140 437
LLPS-Scf-2579Scleropages formosus39.752e-139 436
LLPS-Scm-1110Scophthalmus maximus39.511e-138 434
LLPS-Chr-0713Chlamydomonas reinhardtii39.462e-71 256
LLPS-Cym-0264Cyanidioschyzon merolae39.373e-75 266
LLPS-Orn-2060Oreochromis niloticus39.351e-131 416
LLPS-Cae-1658Caenorhabditis elegans39.296e-0757.4
LLPS-Osl-0073Ostreococcus lucimarinus38.581e-150 463
LLPS-Abg-1219Absidia glauca37.984e-157 483
LLPS-Drm-1602Drosophila melanogaster37.347e-156 478
LLPS-Ora-1360Ornithorhynchus anatinus37.254e-155 477
LLPS-Gaa-0630Gasterosteus aculeatus37.246e-156 479
LLPS-Orl-0039Oryzias latipes37.233e-1171.2
LLPS-Lac-2037Latimeria chalumnae37.221e-157 484
LLPS-Icp-2502Ictalurus punctatus37.217e-156 479
LLPS-Sah-3726Sarcophilus harrisii37.137e-155 476
LLPS-Mod-1475Monodelphis domestica37.138e-155 476
LLPS-Myl-2217Myotis lucifugus37.061e-158 486
LLPS-Mup-2643Mustela putorius furo37.04e-154 475
LLPS-Fud-1095Fukomys damarensis37.02e-154 476
LLPS-Cap-1057Cavia porcellus37.01e-154 476
LLPS-Eqc-1280Equus caballus37.08e-155 476
LLPS-Ict-3544Ictidomys tridecemlineatus37.01e-154 476
LLPS-Urm-0943Ursus maritimus37.01e-154 476
LLPS-Loa-3533Loxodonta africana36.911e-152 471
LLPS-Dio-0122Dipodomys ordii36.884e-154 474
LLPS-Sus-2814Sus scrofa36.889e-154 474
LLPS-Fec-1222Felis catus36.882e-153 473
LLPS-Pof-1544Poecilia formosa36.826e-159 487
LLPS-Mea-0899Mesocricetus auratus36.762e-155 478
LLPS-Asm-1444Astyanax mexicanus36.692e-154 476
LLPS-Xim-1753Xiphophorus maculatus36.641e-154 476
LLPS-Ran-4526Rattus norvegicus36.632e-155 478
LLPS-Gaga-2763Gallus gallus36.563e-155 478
LLPS-Tag-1563Taeniopygia guttata36.564e-155 477
LLPS-Bot-1648Bos taurus36.452e-154 475
LLPS-Meg-0666Meleagris gallopavo36.42e-153 473
LLPS-Pes-1839Pelodiscus sinensis36.44e-154 474
LLPS-Xet-3291Xenopus tropicalis36.372e-149 462
LLPS-Paa-1082Papio anubis36.325e-155 477
LLPS-Mal-1163Mandrillus leucophaeus36.325e-155 477
LLPS-Chs-3445Chlorocebus sabaeus36.325e-155 477
LLPS-Maf-1591Macaca fascicularis36.325e-155 477
LLPS-Aon-2175Aotus nancymaae36.326e-155 476
LLPS-Cea-1441Cercocebus atys36.325e-155 477
LLPS-Gog-1138Gorilla gorilla36.326e-155 476
LLPS-Caj-0024Callithrix jacchus36.326e-155 476
LLPS-Mam-2280Macaca mulatta36.325e-155 477
LLPS-Hos-0182Homo sapiens36.326e-155 476
LLPS-Pat-0029Pan troglodytes36.326e-155 476
LLPS-Pap-2264Pan paniscus36.326e-155 476
LLPS-Man-0836Macaca nemestrina36.325e-155 477
LLPS-Rhb-0074Rhinopithecus bieti36.325e-155 477
LLPS-Anp-2874Anas platyrhynchos36.236e-151 466
LLPS-Mum-0547Mus musculus36.21e-155 479
LLPS-Cas-0210Carlito syrichta36.29e-156 479
LLPS-Caf-2235Canis familiaris36.072e-154 475
LLPS-Nol-1972Nomascus leucogenys36.072e-149 462
LLPS-Orc-1779Oryctolagus cuniculus36.079e-155 476
LLPS-Anc-1013Anolis carolinensis35.784e-153 472
LLPS-Ova-0980Ovis aries35.641e-146 454
LLPS-Fia-1022Ficedula albicollis35.582e-146 454
LLPS-Gas-0553Galdieria sulphuraria34.743e-120 385
LLPS-Cii-0022Ciona intestinalis33.582e-140 439
LLPS-Chc-0694Chondrus crispus32.867e-118 381
LLPS-Scc-1373Schizosaccharomyces cryophilus32.365e-102 338
LLPS-Scp-1121Schizosaccharomyces pombe31.915e-95 319
LLPS-Scj-0951Schizosaccharomyces japonicus31.824e-106 348
LLPS-Dos-0686Dothistroma septosporum31.788e-37 152
LLPS-Otg-1501Otolemur garnettii31.752e-38 155
LLPS-Ere-0954Erinaceus europaeus31.561e-37 153
LLPS-Poa-2302Pongo abelii30.171e-67 237
LLPS-Zyt-0799Zymoseptoria tritici29.453e-36 151
LLPS-Crn-0368Cryptococcus neoformans29.451e-26 120
LLPS-Trr-1138Trichoderma reesei29.012e-33 142
LLPS-Gag-0403Gaeumannomyces graminis29.01e-31 136
LLPS-Fuv-0848Fusarium verticillioides28.713e-34 144
LLPS-Map-1073Magnaporthe poae28.471e-29 130
LLPS-Fus-1118Fusarium solani28.471e-33 143
LLPS-Sot-0354Solanum tuberosum28.462e-26 119
LLPS-Yal-1364Yarrowia lipolytica28.441e-26 120
LLPS-Tum-0317Tuber melanosporum28.432e-40 164
LLPS-Coo-0049Colletotrichum orbiculare28.381e-34 145
LLPS-Fuo-1171Fusarium oxysporum28.242e-33 142
LLPS-Org-1272Oryza glaberrima27.733e-26 119
LLPS-Spr-1123Sporisorium reilianum27.646e-33 140
LLPS-Asn-0141Aspergillus nidulans27.495e-29 128
LLPS-Asg-1077Ashbya gossypii27.362e-29 129
LLPS-Cis-0856Ciona savignyi27.041e-32 138
LLPS-Sac-0923Saccharomyces cerevisiae26.885e-29 128
LLPS-Nec-0528Neurospora crassa26.754e-34 144
LLPS-Mao-0385Magnaporthe oryzae26.094e-30 131
LLPS-Usm-1173Ustilago maydis26.054e-32 138
LLPS-Lem-0772Leptosphaeria maculans25.162e-58 218
LLPS-Miv-0720Microbotryum violaceum25.166e-39 159
LLPS-Pyt-0701Pyrenophora teres25.113e-53 202
LLPS-Asni-1278Aspergillus niger25.061e-51 197
LLPS-Pytr-1198Pyrenophora triticirepentis25.054e-52 199
LLPS-Ved-0363Verticillium dahliae24.761e-49 192
LLPS-Phn-0924Phaeosphaeria nodorum24.571e-58 218
LLPS-Cogr-0334Colletotrichum graminicola24.578e-41 165
LLPS-Beb-1225Beauveria bassiana24.495e-43 172
LLPS-Cog-0426Colletotrichum gloeosporioides24.435e-44 175
LLPS-Mel-1265Melampsora laricipopulina24.11e-34 145
LLPS-Blg-0098Blumeria graminis24.082e-45 179
LLPS-Trv-0865Trichoderma virens24.047e-45 177
LLPS-Scs-0488Sclerotinia sclerotiorum23.891e-42 171
LLPS-Kop-1402Komagataella pastoris23.79e-38 155