• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Dio-0617
Ccdc88a

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: girdin
Gene Name: Ccdc88a
Ensembl Gene: ENSDORG00000010670.2
Ensembl Protein: ENSDORP00000010032.2
Organism: Dipodomys ordii
Taxa ID: 10020
LLPS Type: Client


▼ PROPERTY



▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Centrosome/Spindle pole body, Postsynaptic densityPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MENEIFTPLL  EQFMTSPLVT  WVKTFGPLAA  GSGTNLDEYV  ALVDGVFLNQ  VMLQINPKSE  60
61    SQRVNKKVNN  DASLRIHNLS  ILVKQIKFYY  QETLQQLIMM  SLPNVLIIGK  NPFSEQGTEE  120
121   VKKLLLLLLG  CAVQCQKKEE  FIERIQGLDF  DTKAAVAAHI  QEVTHNQENV  FDLQWMEVSD  180
181   MSQEDIEPLL  KNMALHLKRL  IDERDEHSET  IIELSEERDG  LHFLPHGSSS  AQSPCGSPGM  240
241   KRTESRQHLS  VELADAKAKI  RRLRQELEEK  TEQLLDCKQE  LEQMEIEFKR  LQQENMNLLS  300
301   DARCARMYRD  ELDALREKAV  RVDKLESEVS  RYKERLHDIE  FYKARVEELK  EDNQVLLETK  360
361   TMLEDQLEGT  RARSDKLHEL  EKENLQLKAK  LHDMEMVRFM  EQNQLHTPQK  SLSHEVSELT  420
421   SSRLLKLEME  NQSLTKTVEE  LRSTMDSVED  TTSKILKIEK  ENQRLNKKVE  VLESEIIQEK  480
481   QSLQNCQNLS  KDLMKEKAQL  EKTIETLREN  SERQIKILEQ  ENEHLNQTVS  SLRQRSQISA  540
541   EARVKDIEKE  NKILHESIKE  TSSKLSKIEF  EKRQIRKELE  HYKEKGERTE  ELESELHHLG  600
601   KENELLQKKI  TNLKITCEKI  EALEQENSEL  ERENRKFKKT  LDSFKNLTFQ  LESLEKENSQ  660
661   LDEENLELRR  NVESLKGASM  KMAQLQLENK  ELESEKEQLK  KGLELMKASF  KKTERLEVSY  720
721   QGLDTENQRL  QKALENSNKK  IQQLESELQD  LEMENQTLQK  NLEELKISSK  RLEQLEKENK  780
781   SLEQETSQLE  KDKKQLEKEN  KRLRQQAEIK  DITLEENNVK  IGNLEKENKT  LFKEIGVYKE  840
841   SCVRLKELEK  ENKELVKRAT  IDVKTLVTLR  EDLVSEKLKT  QQMNNDLEKL  THELEKIGLN  900
901   KERLLHDEQS  TDDSRYKLLE  SKLESTLKKS  LEIKEEKIAA  LEARLEESTN  YNQQLRQELK  960
961   TVKKNYEALK  QRQDEERMVQ  SSPVVPREDN  KWERESQETT  RELLKVKDRL  IEVERNNATL  1020
1021  QAEKQALKTQ  LKQLETQNNN  LQAQILALQR  QTVSLQEQNT  TLQTQNAKLQ  VENSTLNSQS  1080
1081  TSLMNQNAQL  LIQQSSLENE  NESIIKERED  LKCLYDSLIK  DHEKLELLHE  RQASEYESLI  1140
1141  SKHGTLKSAH  KNLEVEHKDL  EDRYNQLLKQ  KGQLEDLEKT  LKIEQEKMLL  ENKNHETIAA  1200
1201  EYKKLCGEND  RLNYTYSQLL  KETEILQTDH  KNLKSLLNNS  KLEQTRLEAE  FSKLKEQYQQ  1260
1261  LDITSTKLNN  QCELLSQLKG  NLEEENRHLL  DQIQTLMLQN  RTLLEQNMES  KDLFHVEQRQ  1320
1321  YIDKLNELRR  QKEKLEEKIM  DQYKFYDPSP  PRRRGNWITL  KMRKLIKSKK  DINRERQKSL  1380
1381  TLTPTRSDSS  EGFLQLPHQD  SQDSSSVGSN  SLEDGQTLGT  KKSSMVALKR  LPFLRNRPKD  1440
1441  KDKMKACYRR  SMSMNDLVQS  MVLAGGQWTG  STENLEVPDD  ISTGKRRKEL  GAMAFSTTAI  1500
1501  NFSTVNSSAG  FRSKQLVNNK  DTTSFEDISP  QGISDDSSTG  SRVHASRPAS  LDSGRTSTSN  1560
1561  SNNNASLHEV  KAGAVNNQSR  PQSHSSGEFS  LPHDHETWSS  SGSSPIQYLK  RQARSSPVLQ  1620
1621  HKMPETLESR  GLHKIKIGSP  GSEVVTLQQF  LEESNKLTSI  QLKSSSQENL  LDEVMKSLSV  1680
1681  SSDFLGKDKP  VSCGLSRSVS  GKTPGDFHDR  RTTKPEFVRP  GPRKTEDAYF  IGSTGKSASG  1740
1741  TQGKIKLVKE  TSLSRQSKDS  NPYATLPRAS  SVISTAEGTT  RRTSIHDFLA  KDSRLPLSID  1800
1801  SPLPTADSNI  TAASNVDKVQ  ESRNSKSRSR  EQQSS  1835
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGAGAACG  AAATTTTCAC  TCCGCTTTTG  GAGCAGTTCA  TGACCAGCCC  CTTGGTCACC  60
61    TGGGTGAAAA  CGTTCGGACC  TCTGGCCGCA  GGCAGTGGGA  CCAATCTGGA  TGAGTATGTG  120
121   GCTTTGGTGG  ATGGGGTGTT  CTTGAACCAG  GTCATGCTCC  AAATTAATCC  TAAATCGGAG  180
181   AGTCAGAGAG  TTAATAAAAA  AGTCAACAAT  GATGCTTCAC  TTAGAATTCA  TAATTTATCC  240
241   ATTTTGGTGA  AACAGATAAA  ATTTTATTAC  CAGGAGACTT  TGCAGCAATT  GATTATGATG  300
301   TCTTTGCCAA  ATGTCTTGAT  TATTGGCAAA  AATCCATTTT  CTGAACAAGG  CACGGAAGAA  360
361   GTTAAAAAAC  TGCTTTTGCT  CTTACTGGGA  TGTGCAGTTC  AGTGTCAGAA  AAAAGAAGAA  420
421   TTTATTGAAA  GAATTCAAGG  ATTAGATTTT  GATACAAAAG  CAGCAGTTGC  CGCACATATT  480
481   CAAGAGGTAA  CGCATAATCA  GGAAAATGTG  TTTGATCTGC  AATGGATGGA  AGTGTCAGAT  540
541   ATGTCTCAGG  AGGATATAGA  ACCACTATTG  AAAAATATGG  CATTGCATCT  AAAGAGACTT  600
601   ATAGACGAGA  GAGATGAACA  TTCAGAGACT  ATCATAGAAC  TCTCTGAAGA  GCGAGATGGT  660
661   CTTCATTTTC  TCCCCCATGG  CTCTTCATCT  GCACAATCAC  CCTGTGGTTC  TCCAGGCATG  720
721   AAGCGAACAG  AAAGTCGACA  GCATCTGTCA  GTGGAACTGG  CTGATGCTAA  GGCTAAGATA  780
781   AGAAGGCTTA  GGCAGGAACT  GGAGGAAAAG  ACTGAACAGT  TGTTGGACTG  CAAACAAGAA  840
841   CTTGAACAAA  TGGAAATAGA  ATTTAAAAGG  CTACAACAAG  AGAACATGAA  TTTGCTTTCG  900
901   GATGCTCGTT  GTGCTAGAAT  GTACCGAGAT  GAATTGGATG  CCCTTCGAGA  AAAGGCAGTC  960
961   AGAGTTGATA  AACTTGAAAG  TGAAGTCAGC  AGATATAAAG  AGAGACTACA  TGATATTGAA  1020
1021  TTTTATAAAG  CAAGAGTTGA  GGAATTAAAA  GAAGACAATC  AAGTTTTATT  AGAAACAAAA  1080
1081  ACCATGTTGG  AAGATCAACT  AGAAGGAACT  CGAGCTCGTT  CTGACAAATT  ACATGAATTA  1140
1141  GAAAAAGAGA  ATTTACAACT  AAAGGCTAAA  CTACATGATA  TGGAAATGGT  AAGATTTATG  1200
1201  GAGCAAAATC  AGTTACATAC  ACCACAGAAA  TCCTTGAGCC  ATGAAGTGAG  TGAGTTGACA  1260
1261  TCAAGTAGGT  TATTAAAGTT  GGAGATGGAA  AACCAAAGTT  TGACAAAAAC  TGTAGAAGAG  1320
1321  CTTCGGAGTA  CTATGGATTC  TGTAGAAGAC  ACCACTTCCA  AAATACTGAA  AATTGAAAAA  1380
1381  GAAAATCAAA  GACTGAATAA  AAAGGTTGAA  GTTCTTGAAA  GTGAGATTAT  TCAAGAAAAG  1440
1441  CAAAGTCTTC  AGAATTGTCA  AAATTTAAGC  AAGGATCTAA  TGAAGGAAAA  AGCTCAGCTC  1500
1501  GAAAAAACAA  TTGAAACACT  TAGAGAAAAT  TCAGAGAGAC  AGATTAAAAT  ACTGGAACAG  1560
1561  GAAAATGAAC  ATCTGAATCA  AACAGTGTCT  TCCTTAAGGC  AGCGTTCTCA  GATAAGTGCT  1620
1621  GAAGCAAGGG  TAAAAGACAT  TGAAAAAGAA  AATAAAATTC  TCCACGAATC  TATCAAAGAA  1680
1681  ACAAGTAGCA  AGCTAAGCAA  GATTGAATTT  GAAAAAAGGC  AAATTAGAAA  AGAATTGGAA  1740
1741  CATTATAAAG  AAAAAGGAGA  ACGAACAGAA  GAACTTGAAA  GTGAGTTGCA  TCATCTTGGA  1800
1801  AAAGAAAATG  AATTGTTGCA  GAAAAAAATA  ACCAATTTAA  AAATTACTTG  CGAAAAAATT  1860
1861  GAGGCCTTAG  AACAAGAAAA  TTCAGAGCTA  GAAAGAGAAA  ATAGAAAGTT  TAAAAAAACA  1920
1921  CTGGATAGTT  TTAAAAACCT  TACTTTTCAG  TTAGAATCCT  TAGAAAAAGA  AAATTCCCAA  1980
1981  CTTGATGAAG  AAAACTTAGA  ACTTCGAAGA  AATGTGGAGT  CTTTGAAGGG  AGCAAGCATG  2040
2041  AAAATGGCTC  AGCTACAACT  AGAAAACAAA  GAGCTAGAAA  GTGAAAAAGA  ACAACTTAAG  2100
2101  AAAGGTTTAG  AGCTCATGAA  AGCATCTTTC  AAGAAAACAG  AACGTTTGGA  AGTTAGCTAC  2160
2161  CAGGGATTAG  ATACAGAAAA  CCAAAGGCTA  CAGAAAGCTT  TGGAAAATAG  CAATAAAAAA  2220
2221  ATCCAACAAT  TAGAAAGTGA  ACTACAAGAC  TTAGAGATGG  AAAATCAAAC  ATTGCAAAAG  2280
2281  AACCTAGAAG  AATTGAAAAT  ATCTAGCAAG  AGATTAGAAC  AGCTTGAAAA  AGAAAATAAA  2340
2341  TCATTAGAGC  AGGAAACATC  TCAGCTGGAA  AAGGATAAGA  AACAACTGGA  GAAGGAAAAC  2400
2401  AAGAGACTCC  GACAACAAGC  AGAAATAAAA  GATATTACCT  TAGAAGAAAA  TAATGTGAAG  2460
2461  ATTGGAAATT  TGGAAAAAGA  AAACAAAACT  CTTTTTAAAG  AAATTGGTGT  ATATAAAGAA  2520
2521  TCTTGTGTTC  GTCTCAAAGA  ATTAGAAAAG  GAAAATAAAG  AGCTTGTGAA  AAGAGCAACT  2580
2581  ATTGATGTAA  AAACTTTGGT  TACATTACGT  GAGGATTTGG  TGAGTGAAAA  ATTGAAGACT  2640
2641  CAACAAATGA  ACAATGATCT  TGAGAAATTA  ACTCATGAGC  TTGAGAAGAT  AGGGTTAAAT  2700
2701  AAAGAGCGAC  TCTTACATGA  TGAACAAAGT  ACTGATGACA  GTAGGTACAA  ACTTTTGGAA  2760
2761  TCAAAGTTAG  AATCTACTCT  TAAGAAATCT  CTTGAAATAA  AAGAAGAAAA  AATTGCTGCA  2820
2821  TTAGAAGCTC  GATTAGAAGA  ATCCACAAAT  TATAACCAGC  AATTGCGACA  AGAACTTAAA  2880
2881  ACAGTGAAAA  AAAATTATGA  AGCACTCAAA  CAGCGACAAG  ATGAGGAAAG  AATGGTGCAG  2940
2941  AGCTCTCCTG  TAGTACCCAG  GGAAGATAAT  AAATGGGAAC  GAGAAAGCCA  AGAAACAACT  3000
3001  AGAGAGCTTC  TAAAAGTTAA  AGACAGATTA  ATTGAAGTAG  AGAGAAATAA  TGCTACATTG  3060
3061  CAAGCAGAGA  AGCAAGCATT  GAAAACTCAA  CTGAAGCAAC  TTGAAACACA  GAACAATAAT  3120
3121  TTGCAGGCTC  AGATTCTTGC  ACTTCAGAGG  CAAACTGTGT  CATTACAGGA  ACAGAATACT  3180
3181  ACCCTTCAAA  CCCAGAATGC  CAAGCTTCAG  GTTGAAAATT  CCACTCTTAA  TTCTCAAAGT  3240
3241  ACCTCACTTA  TGAACCAGAA  TGCACAACTC  TTAATCCAGC  AGTCATCCTT  AGAAAATGAA  3300
3301  AATGAATCTA  TAATCAAAGA  ACGAGAAGAC  CTGAAATGTC  TCTATGATTC  TCTAATCAAA  3360
3361  GATCATGAGA  AGCTGGAACT  TCTTCACGAA  CGCCAGGCCT  CAGAGTATGA  ATCTCTCATC  3420
3421  TCTAAACATG  GAACTCTGAA  GTCTGCCCAC  AAAAATCTTG  AAGTGGAACA  TAAAGATCTT  3480
3481  GAAGACCGTT  ACAATCAGTT  ATTAAAACAG  AAAGGACAAT  TGGAAGATTT  GGAAAAAACA  3540
3541  CTCAAAATAG  AACAGGAAAA  AATGCTTCTT  GAAAACAAAA  ATCATGAGAC  GATAGCTGCA  3600
3601  GAATACAAGA  AACTTTGTGG  TGAAAATGAT  AGGTTAAATT  ATACATATAG  CCAGCTTTTA  3660
3661  AAAGAGACTG  AAATTTTACA  AACTGACCAC  AAAAATTTGA  AAAGTCTCCT  AAATAATTCT  3720
3721  AAACTGGAAC  AAACAAGATT  AGAAGCTGAA  TTTTCGAAGC  TAAAGGAACA  GTACCAACAG  3780
3781  CTGGATATCA  CATCCACAAA  ACTAAATAAC  CAGTGTGAGT  TGCTCAGCCA  ACTTAAAGGA  3840
3841  AATTTGGAAG  AAGAAAATCG  ACATCTACTA  GATCAAATTC  AGACACTAAT  GCTTCAGAAT  3900
3901  AGAACACTGT  TGGAACAAAA  TATGGAGAGC  AAGGATCTTT  TTCATGTAGA  GCAAAGACAG  3960
3961  TACATTGATA  AGTTAAATGA  ATTAAGACGA  CAGAAGGAGA  AATTAGAAGA  GAAAATTATG  4020
4021  GATCAGTACA  AGTTTTATGA  CCCATCTCCT  CCTAGAAGGA  GAGGCAACTG  GATTACTCTA  4080
4081  AAAATGAGAA  AATTGATAAA  GTCCAAGAAA  GATATTAACC  GGGAACGTCA  GAAATCTCTA  4140
4141  ACATTAACAC  CTACACGCTC  AGATTCCAGT  GAAGGATTTC  TTCAGCTGCC  CCATCAAGAT  4200
4201  AGTCAAGATA  GTTCTTCAGT  AGGGTCAAAT  TCTTTAGAAG  ATGGACAAAC  TCTGGGGACC  4260
4261  AAGAAAAGCA  GCATGGTTGC  ACTGAAAAGA  CTGCCCTTTT  TGAGGAACAG  ACCGAAGGAT  4320
4321  AAAGACAAAA  TGAAGGCCTG  CTACCGTCGT  TCCATGTCCA  TGAATGACCT  GGTGCAGTCC  4380
4381  ATGGTCCTAG  CAGGAGGACA  GTGGACAGGT  AGTACTGAGA  ATTTGGAGGT  TCCTGATGAT  4440
4441  ATTTCAACTG  GTAAAAGGAG  AAAAGAATTG  GGAGCTATGG  CCTTCTCTAC  TACAGCCATC  4500
4501  AACTTTTCAA  CTGTCAACTC  TTCTGCAGGC  TTCAGATCCA  AGCAGTTGGT  TAATAATAAA  4560
4561  GATACTACAT  CCTTTGAAGA  TATAAGTCCA  CAAGGTATTA  GTGATGATTC  TAGTACGGGA  4620
4621  TCAAGAGTTC  ATGCTTCAAG  ACCAGCCAGC  CTTGATAGTG  GCAGAACATC  CACTAGCAAT  4680
4681  AGCAATAACA  ATGCTTCACT  CCATGAAGTC  AAAGCAGGTG  CAGTTAATAA  CCAAAGCAGG  4740
4741  CCACAAAGCC  ACAGCAGTGG  AGAATTTAGC  CTGCCTCATG  ATCATGAGAC  TTGGTCCAGC  4800
4801  AGTGGTAGCA  GTCCAATCCA  GTACTTGAAA  AGACAAGCCA  GATCAAGTCC  AGTGCTCCAG  4860
4861  CACAAAATGC  CAGAAACACT  AGAAAGTCGA  GGACTTCATA  AAATTAAAAT  TGGTTCCCCT  4920
4921  GGAAGTGAAG  TCGTTACTCT  ACAACAGTTT  CTGGAAGAAA  GCAACAAGCT  TACCTCAATA  4980
4981  CAGCTAAAGT  CCTCAAGTCA  AGAGAATCTT  TTAGATGAAG  TAATGAAAAG  TTTATCTGTT  5040
5041  TCTTCTGACT  TTTTGGGAAA  AGACAAGCCA  GTTAGTTGTG  GTCTGTCCAG  GTCAGTAAGT  5100
5101  GGAAAAACCC  CAGGGGACTT  CCATGACAGA  CGGACAACTA  AGCCTGAGTT  TGTGAGACCT  5160
5161  GGTCCTCGAA  AGACTGAAGA  TGCCTACTTC  ATTGGTTCTA  CAGGAAAGTC  TGCATCAGGC  5220
5221  ACTCAAGGAA  AGATAAAACT  AGTAAAAGAA  ACCTCTCTGT  CAAGACAATC  AAAAGATAGC  5280
5281  AATCCTTATG  CCACTTTACC  TCGTGCAAGT  AGTGTGATCT  CCACAGCCGA  AGGAACAACA  5340
5341  CGGAGGACAA  GCATACATGA  TTTTTTGGCC  AAGGACAGTA  GACTGCCTTT  GTCAATTGAT  5400
5401  TCTCCACTGC  CTACTGCTGA  TAGCAACATC  ACTGCAGCGT  CTAATGTGGA  CAAAGTACAA  5460
5461  GAAAGCAGAA  ATTCAAAAAG  CAGGTCTAGG  GAGCAACAAA  GCTCCTAA  5508

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Cas-3378Carlito syrichta94.020.03193
LLPS-Aim-4120Ailuropoda melanoleuca93.970.03195
LLPS-Eqc-4002Equus caballus93.910.03146
LLPS-Fec-2447Felis catus93.860.03180
LLPS-Hos-2405Homo sapiens93.750.03181
LLPS-Pat-3374Pan troglodytes93.750.03175
LLPS-Orc-3859Oryctolagus cuniculus93.750.03159
LLPS-Caf-4060Canis familiaris93.70.03179
LLPS-Ict-4641Ictidomys tridecemlineatus93.650.03189
LLPS-Mam-4183Macaca mulatta93.590.03165
LLPS-Maf-4620Macaca fascicularis93.590.03165
LLPS-Gog-4343Gorilla gorilla93.590.03172
LLPS-Mal-1644Mandrillus leucophaeus93.540.03166
LLPS-Sus-1751Sus scrofa93.490.03165
LLPS-Nol-3926Nomascus leucogenys93.430.03166
LLPS-Caj-1139Callithrix jacchus93.430.03160
LLPS-Chs-4794Chlorocebus sabaeus93.190.02928
LLPS-Otg-3014Otolemur garnettii93.170.03141
LLPS-Ova-1754Ovis aries93.150.03121
LLPS-Poa-1775Pongo abelii93.020.02925
LLPS-Myl-2881Myotis lucifugus92.970.03154
LLPS-Bot-0964Bos taurus92.90.03148
LLPS-Fud-1375Fukomys damarensis92.90.03115
LLPS-Mea-4458Mesocricetus auratus92.790.03145
LLPS-Cea-1850Cercocebus atys92.10.03096
LLPS-Paa-4649Papio anubis91.720.03070
LLPS-Loa-2048Loxodonta africana91.60.03108
LLPS-Man-4366Macaca nemestrina91.510.03085
LLPS-Pap-0208Pan paniscus91.460.03076
LLPS-Urm-3936Ursus maritimus91.120.03013
LLPS-Mup-4554Mustela putorius furo91.060.02957
LLPS-Mum-3695Mus musculus90.60.03051
LLPS-Aon-3171Aotus nancymaae90.170.02975
LLPS-Cap-3235Cavia porcellus90.050.0 698
LLPS-Ran-3397Rattus norvegicus88.40.02351
LLPS-Ora-3546Ornithorhynchus anatinus87.110.02865
LLPS-Sah-2905Sarcophilus harrisii86.790.02418
LLPS-Mod-4034Monodelphis domestica85.360.02705
LLPS-Pes-3423Pelodiscus sinensis85.060.02808
LLPS-Anp-2393Anas platyrhynchos84.650.02776
LLPS-Tag-0906Taeniopygia guttata84.520.02801
LLPS-Fia-2277Ficedula albicollis81.970.02707
LLPS-Anc-2887Anolis carolinensis81.340.02676
LLPS-Meg-1882Meleagris gallopavo79.360.02576
LLPS-Gaga-2472Gallus gallus77.960.02562
LLPS-Lac-0871Latimeria chalumnae75.940.02447
LLPS-Xet-1239Xenopus tropicalis72.880.02316
LLPS-Leo-0341Lepisosteus oculatus71.730.02212
LLPS-Asm-0307Astyanax mexicanus69.70.01764
LLPS-Ten-2714Tetraodon nigroviridis67.320.01563
LLPS-Gaa-0757Gasterosteus aculeatus65.950.01847
LLPS-Scf-0314Scleropages formosus65.890.02043
LLPS-Icp-2753Ictalurus punctatus65.060.01921
LLPS-Orn-3086Oreochromis niloticus64.760.02011
LLPS-Orl-3680Oryzias latipes63.240.01948
LLPS-Scm-2729Scophthalmus maximus63.060.01828
LLPS-Xim-3243Xiphophorus maculatus62.950.01962
LLPS-Pof-3469Poecilia formosa62.330.01881
LLPS-Tar-1033Takifugu rubripes60.880.01854
LLPS-Cii-1224Ciona intestinalis40.190.0 707
LLPS-Rhb-0909Rhinopithecus bieti27.789e-1274.3