LLPS-Dar-4105
pms1

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: PMS1 homolog 1, mismatch repair system component
Gene Name: pms1
Ensembl Gene: ENSDARG00000000476.13
Ensembl Protein: ENSDARP00000156514.1
Organism: Danio rerio
Taxa ID: 7955
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MKALPPETVR  LLCSSQVITS  VLNVVKELIE  NSLDAGSSSL  EVKLENYGLD  RIEVRDNGSG  60
61    IKATDVSVMA  VKHYTSKISC  HEDLEQLETY  GFRGEALASI  CAISEVIITT  KTADDDFSIQ  120
121   YSVDHNGQIV  SQKPSHLGQG  TTVCAANLFK  NLPVRRQYYS  NTKKCKDELK  RVQNLLMAYA  180
181   VIKPELRVTL  SHNKAVVWQK  SRVSDHRTAL  MAVLGAASVA  NMLPVQHHQE  QPEIHIDGFF  240
241   PKPGSDLNST  SSSTTDKSFI  FVNSRPVHHK  EILKLIKQYY  TSAQSNSESV  SRRYPTFMMN  300
301   ITIPASTVDV  NLTPDKTEVM  LQNKDEVLLS  VETMLISLYG  YSNGEENLKT  AGNPSDVTSL  360
361   DEPKRTSPDI  SLKHPELPED  SSSNAEKQDG  ELSLSNTANT  SSSSISEDWV  INRSDLDSIN  420
421   CSVPVDDVVM  NSTADLNSNS  PKASESDSGP  ESQISAENWS  AGRAFSNQIT  GEYLEPVKLH  480
481   IPKAIEDLGG  TEAKSVKSSP  SKKPSNVIVE  KMAKLTAYEL  ISNRSVRQPS  SAFSLFEQDT  540
541   RSQVLQENPK  ASPQDVTAAA  KERWESLGEE  DRKKYEGKAE  KSLNAYNLQR  KRAAEGGVQC  600
601   GEGKKQMSAE  SPLNKAQGVK  RKAPLANQQA  LDKLFSSQPS  SKRSPAKISK  PLPFTIATLK  660
661   QSLNLLSEQS  SSSVQGLRLV  NRLASHGAWV  VLCGRKLMLL  NPFRVEEALL  FKRLLEDNIL  720
721   PTVRLQTPVL  LTDGVLGGPE  YMDVLLNMKK  DGPEFNGDIS  LTDPRLVANG  FEIRMISGPQ  780
781   SSERHVEVMG  MADCMPFFGI  GDLREILQAI  KARGAKTVAQ  CRPRKVSHYL  ESEAVRLARQ  840
841   LPLSLSRADV  TNTLRRMQQE  LQDESQVCIH  RLPFFHNLVT  LPETEQEALQ  IMSGSQ  896
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGAAGGCGC  TTCCCCCCGA  GACTGTGCGT  CTGCTGTGCA  GCTCTCAGGT  TATTACATCT  60
61    GTCCTGAATG  TTGTCAAGGA  ACTGATCGAG  AATTCACTTG  ATGCTGGTTC  CTCAAGCCTT  120
121   GAAGTCAAAC  TGGAGAATTA  TGGACTGGAT  CGCATTGAAG  TGCGAGACAA  TGGTTCTGGT  180
181   ATTAAAGCTA  CTGATGTTTC  TGTGATGGCT  GTAAAACACT  ATACGTCTAA  AATCTCTTGC  240
241   CATGAAGACC  TGGAACAGCT  AGAGACTTAC  GGCTTCAGAG  GAGAAGCTCT  GGCATCCATA  300
301   TGTGCCATCT  CAGAGGTGAT  TATTACTACC  AAAACTGCAG  ATGACGATTT  TAGCATTCAG  360
361   TATTCAGTGG  ATCACAATGG  ACAGATCGTC  TCTCAGAAGC  CATCTCATCT  TGGCCAGGGC  420
421   ACCACGGTGT  GTGCGGCAAA  TCTGTTCAAG  AACCTTCCGG  TTAGACGGCA  GTATTATTCC  480
481   AACACTAAAA  AATGTAAAGA  TGAGCTTAAG  AGGGTCCAGA  ACTTACTCAT  GGCTTATGCT  540
541   GTAATAAAGC  CTGAGTTACG  GGTCACGCTG  AGCCACAACA  AGGCTGTGGT  CTGGCAGAAG  600
601   TCCAGGGTGT  CGGATCACCG  AACTGCCCTC  ATGGCCGTGC  TCGGAGCAGC  GTCCGTAGCC  660
661   AACATGCTCC  CCGTCCAGCA  TCACCAGGAG  CAACCAGAGA  TCCACATCGA  TGGATTCTTT  720
721   CCCAAACCGG  GCTCAGATTT  GAATTCCACC  AGCTCCTCTA  CGACTGATAA  GTCATTCATC  780
781   TTTGTAAACA  GTCGACCTGT  GCATCATAAA  GAGATACTTA  AGCTTATCAA  GCAGTATTAC  840
841   ACCAGTGCTC  AGTCTAACAG  TGAATCCGTA  AGCCGCCGAT  ATCCCACTTT  TATGATGAAC  900
901   ATCACCATAC  CGGCCTCAAC  TGTGGACGTT  AACCTGACAC  CTGATAAAAC  TGAAGTGATG  960
961   CTACAGAATA  AGGATGAAGT  TCTGTTGTCA  GTGGAGACTA  TGCTAATCTC  CTTGTATGGA  1020
1021  TACTCTAATG  GTGAAGAGAA  TCTCAAAACT  GCAGGAAATC  CCTCTGATGT  TACTTCATTG  1080
1081  GATGAGCCTA  AACGGACTTC  CCCAGATATT  AGTTTAAAGC  ACCCAGAACT  GCCCGAGGAT  1140
1141  TCTTCCTCGA  ATGCAGAAAA  ACAGGACGGT  GAGCTCTCCT  TGAGCAACAC  CGCAAACACC  1200
1201  AGCTCTTCTT  CGATTTCGGA  GGATTGGGTG  ATCAACAGAA  GTGATTTGGA  CAGTATTAAT  1260
1261  TGCTCAGTAC  CTGTTGACGA  TGTGGTAATG  AACTCTACAG  CTGATCTGAA  CTCCAACTCT  1320
1321  CCAAAGGCGT  CTGAGAGTGA  CAGCGGTCCA  GAGAGCCAGA  TATCTGCCGA  GAACTGGAGT  1380
1381  GCGGGCAGGG  CCTTCTCCAA  TCAAATCACT  GGGGAATACC  TAGAACCTGT  CAAACTGCAC  1440
1441  ATCCCAAAGG  CAATTGAAGA  CCTTGGAGGA  ACCGAGGCCA  AGAGCGTGAA  GTCTAGCCCA  1500
1501  TCTAAAAAGC  CCTCTAACGT  GATTGTGGAG  AAAATGGCCA  AGCTGACAGC  CTATGAGCTT  1560
1561  ATCAGCAACC  GCTCCGTGCG  TCAGCCCTCG  TCTGCCTTTT  CGCTGTTTGA  GCAAGACACC  1620
1621  AGATCGCAGG  TCCTCCAGGA  GAACCCAAAA  GCCAGTCCTC  AGGATGTCAC  AGCTGCTGCG  1680
1681  AAAGAGAGAT  GGGAAAGCCT  CGGGGAGGAA  GACCGCAAAA  AGTATGAAGG  CAAGGCCGAA  1740
1741  AAGTCTCTGA  ACGCCTACAA  CCTTCAAAGG  AAGAGGGCAG  CGGAGGGAGG  CGTCCAGTGC  1800
1801  GGAGAGGGCA  AGAAGCAGAT  GAGCGCCGAG  TCTCCATTGA  ACAAAGCTCA  AGGCGTGAAG  1860
1861  CGCAAAGCCC  CCCTCGCCAA  CCAGCAGGCC  CTGGACAAAC  TCTTCTCCTC  TCAGCCCTCC  1920
1921  AGTAAAAGGA  GCCCTGCCAA  AATCTCCAAA  CCCCTCCCGT  TCACTATCGC  AACCCTCAAG  1980
1981  CAGAGTCTTA  ACCTCCTCTC  CGAGCAGAGC  AGCTCAAGTG  TGCAGGGCCT  CAGGCTTGTA  2040
2041  AACCGCTTGG  CTTCTCACGG  TGCCTGGGTC  GTTTTATGCG  GCAGAAAGCT  CATGTTGTTG  2100
2101  AACCCGTTTC  GAGTGGAGGA  GGCCTTGCTG  TTTAAAAGAC  TTCTGGAGGA  TAATATACTT  2160
2161  CCAACCGTGA  GGCTGCAGAC  CCCCGTACTG  CTGACAGATG  GGGTGCTCGG  TGGGCCAGAG  2220
2221  TACATGGATG  TCCTTCTGAA  CATGAAGAAA  GATGGTCCTG  AATTTAATGG  AGACATCAGC  2280
2281  TTAACTGATC  CCAGGCTTGT  GGCAAACGGT  TTTGAGATTA  GGATGATTTC  AGGTCCGCAG  2340
2341  TCTTCGGAGA  GGCATGTTGA  GGTGATGGGC  ATGGCCGACT  GCATGCCGTT  CTTCGGGATA  2400
2401  GGAGACCTGA  GGGAGATTCT  GCAGGCTATA  AAGGCCCGCG  GAGCAAAAAC  CGTGGCGCAA  2460
2461  TGTAGACCTC  GCAAAGTCTC  ACACTACCTC  GAGAGCGAGG  CAGTGAGACT  AGCAAGACAG  2520
2521  TTACCTCTCA  GTCTCTCAAG  AGCCGATGTT  ACAAACACAC  TTCGCCGAAT  GCAACAGGAA  2580
2581  CTTCAAGACG  AAAGTCAGGT  CTGCATTCAC  AGGCTGCCAT  TTTTTCACAA  TCTGGTGACC  2640
2641  CTTCCTGAAA  CCGAGCAGGA  GGCTCTACAG  ATCATGTCCG  GTTCTCAGTA  A  2691

▼ ANNOTATION

Disorder
D2P2IUPred2A
Interaction
RAINMIST
Physicochemical
AAindex

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Lac-1124Latimeria chalumnae67.065e-146 466
LLPS-Asm-3362Astyanax mexicanus67.060.01033
LLPS-Dio-1911Dipodomys ordii65.641e-69 235
LLPS-Mum-2121Mus musculus64.714e-145 460
LLPS-Icp-0134Ictalurus punctatus64.530.01073
LLPS-Anp-2447Anas platyrhynchos64.112e-149 472
LLPS-Fia-3264Ficedula albicollis63.992e-148 469
LLPS-Anc-3711Anolis carolinensis62.762e-140 449
LLPS-Orc-2192Oryctolagus cuniculus62.654e-140 447
LLPS-Tag-0147Taeniopygia guttata62.335e-143 454
LLPS-Loa-1966Loxodonta africana61.764e-143 455
LLPS-Urm-3321Ursus maritimus60.995e-144 457
LLPS-Fec-1967Felis catus60.664e-144 457
LLPS-Ict-4548Ictidomys tridecemlineatus60.444e-142 452
LLPS-Sus-2291Sus scrofa60.441e-142 454
LLPS-Cea-3192Cercocebus atys60.343e-140 447
LLPS-Rhb-2704Rhinopithecus bieti60.166e-142 452
LLPS-Man-4280Macaca nemestrina60.168e-142 452
LLPS-Mam-3242Macaca mulatta60.167e-142 452
LLPS-Eqc-1995Equus caballus60.165e-142 452
LLPS-Maf-1830Macaca fascicularis60.168e-142 452
LLPS-Mal-0495Mandrillus leucophaeus60.167e-142 452
LLPS-Paa-3437Papio anubis60.169e-142 452
LLPS-Caf-2302Canis familiaris59.891e-140 449
LLPS-Chs-1119Chlorocebus sabaeus59.895e-140 447
LLPS-Mup-3937Mustela putorius furo59.173e-140 447
LLPS-Ora-3418Ornithorhynchus anatinus58.658e-140 446
LLPS-Orn-1666Oreochromis niloticus54.890.0 912
LLPS-Gaa-3560Gasterosteus aculeatus53.590.0 898
LLPS-Scm-3790Scophthalmus maximus53.510.0 866
LLPS-Leo-2476Lepisosteus oculatus53.160.0 921
LLPS-Ten-3385Tetraodon nigroviridis53.050.0 866
LLPS-Tar-2184Takifugu rubripes52.680.0 878
LLPS-Scf-2615Scleropages formosus52.140.0 863
LLPS-Orl-4106Oryzias latipes51.410.0 868
LLPS-Xim-2275Xiphophorus maculatus49.890.0 769
LLPS-Pof-3040Poecilia formosa49.50.0 761
LLPS-Poa-1619Pongo abelii49.192e-101 343
LLPS-Pes-2964Pelodiscus sinensis48.20.0 818
LLPS-Sah-1827Sarcophilus harrisii48.110.0 814
LLPS-Mod-1395Monodelphis domestica47.50.0 803
LLPS-Cii-0290Ciona intestinalis47.162e-95 310
LLPS-Meg-3219Meleagris gallopavo46.990.0 761
LLPS-Gaga-1985Gallus gallus46.880.0 752
LLPS-Cas-0660Carlito syrichta45.870.0 761
LLPS-Myl-3431Myotis lucifugus45.870.0 769
LLPS-Gog-2701Gorilla gorilla45.780.0 758
LLPS-Nol-1688Nomascus leucogenys45.730.0 757
LLPS-Hos-3059Homo sapiens45.680.0 761
LLPS-Pat-1246Pan troglodytes45.680.0 761
LLPS-Pap-4158Pan paniscus45.680.0 761
LLPS-Aim-0892Ailuropoda melanoleuca45.520.0 755
LLPS-Cap-2277Cavia porcellus45.480.0 773
LLPS-Fud-3479Fukomys damarensis45.350.0 764
LLPS-Bot-0901Bos taurus45.320.0 738
LLPS-Ova-2883Ovis aries45.280.0 727
LLPS-Caj-3726Callithrix jacchus44.980.0 746
LLPS-Aon-4645Aotus nancymaae42.350.0 652
LLPS-Asf-0930Aspergillus flavus37.654e-25 114
LLPS-Fuo-0459Fusarium oxysporum35.336e-29 127
LLPS-Put-1069Puccinia triticina33.863e-26 115
LLPS-Abg-0376Absidia glauca33.73e-46 183
LLPS-Beb-1213Beauveria bassiana31.691e-40 165
LLPS-Fus-1393Fusarium solani31.43e-38 158
LLPS-Zyt-1165Zymoseptoria tritici31.079e-45 170
LLPS-Lep-1000Leersia perrieri31.033e-34 142
LLPS-Fuv-0627Fusarium verticillioides30.642e-37 154
LLPS-Scs-0617Sclerotinia sclerotiorum30.558e-40 163
LLPS-Gag-0169Gaeumannomyces graminis30.552e-35 148
LLPS-Coo-1455Colletotrichum orbiculare30.519e-34 144
LLPS-Ori-0149Oryza indica30.328e-34 144
LLPS-Orp-0232Oryza punctata30.268e-34 144
LLPS-Trv-1297Trichoderma virens30.262e-37 155
LLPS-Trr-0957Trichoderma reesei30.149e-37 152
LLPS-Ors-1237Oryza sativa30.127e-34 143
LLPS-Org-1017Oryza glaberrima30.125e-34 144
LLPS-Orr-0339Oryza rufipogon30.126e-34 143
LLPS-Orni-0828Oryza nivara30.127e-34 143
LLPS-Orb-0644Oryza barthii30.129e-34 143
LLPS-Aso-1559Aspergillus oryzae30.095e-35 147
LLPS-Cog-0821Colletotrichum gloeosporioides30.065e-36 150
LLPS-Dos-1331Dothistroma septosporum29.919e-34 143
LLPS-Tra-1582Triticum aestivum29.851e-32 139
LLPS-Pyt-1651Pyrenophora teres29.779e-35 146
LLPS-Pytr-0041Pyrenophora triticirepentis29.745e-35 147
LLPS-Scc-1196Schizosaccharomyces cryophilus29.724e-27 122
LLPS-Crn-1165Cryptococcus neoformans29.711e-36 152
LLPS-Gas-0693Galdieria sulphuraria29.633e-29 129
LLPS-Kop-0893Komagataella pastoris29.552e-30 132
LLPS-Brd-1416Brachypodium distachyon29.52e-33 142
LLPS-Sob-1420Sorghum bicolor29.213e-33 141
LLPS-Asn-1340Aspergillus nidulans29.22e-33 142
LLPS-Drm-1280Drosophila melanogaster29.182e-35 147
LLPS-Ved-1379Verticillium dahliae29.122e-34 145
LLPS-Arl-1598Arabidopsis lyrata29.111e-29 130
LLPS-Lem-1410Leptosphaeria maculans29.115e-33 141
LLPS-Scj-0766Schizosaccharomyces japonicus29.022e-26 120
LLPS-Tum-1091Tuber melanosporum29.022e-32 139
LLPS-Brr-0324Brassica rapa28.962e-27 123
LLPS-Phn-1305Phaeosphaeria nodorum28.934e-31 135
LLPS-Cae-0658Caenorhabditis elegans28.926e-35 147
LLPS-Nef-0251Neosartorya fischeri28.913e-33 141
LLPS-Asni-0692Aspergillus niger28.915e-33 141
LLPS-Gor-0952Gossypium raimondii28.91e-31 137
LLPS-Mua-0513Musa acuminata28.893e-32 139
LLPS-Nia-1775Nicotiana attenuata28.867e-32 137
LLPS-Art-2047Arabidopsis thaliana28.865e-28 125
LLPS-Zem-0175Zea mays28.824e-32 138
LLPS-Scp-0636Schizosaccharomyces pombe28.821e-22 108
LLPS-Sei-2317Setaria italica28.723e-33 141
LLPS-Bro-0748Brassica oleracea28.663e-27 122
LLPS-Brn-2471Brassica napus28.663e-27 122
LLPS-Mae-0827Manihot esculenta28.651e-30 130
LLPS-Spr-1296Sporisorium reilianum28.656e-25 115
LLPS-Blg-1251Blumeria graminis28.651e-32 140
LLPS-Sac-0901Saccharomyces cerevisiae28.616e-31 134
LLPS-Cogr-0528Colletotrichum graminicola28.51e-36 152
LLPS-Viv-0555Vitis vinifera28.411e-32 136
LLPS-Nec-0319Neurospora crassa28.414e-33 141
LLPS-Hov-0444Hordeum vulgare28.382e-33 142
LLPS-Prp-0484Prunus persica28.322e-30 133
LLPS-Via-2137Vigna angularis28.292e-31 136
LLPS-Met-1322Medicago truncatula28.251e-32 139
LLPS-Thc-0230Theobroma cacao28.249e-32 137
LLPS-Ast-1025Aspergillus terreus28.212e-34 145
LLPS-Otg-0221Otolemur garnettii28.26e-31 134
LLPS-Xet-0003Xenopus tropicalis28.22e-32 139
LLPS-Ran-3387Rattus norvegicus28.29e-31 134
LLPS-Hea-2416Helianthus annuus28.189e-31 134
LLPS-Amt-1260Amborella trichopoda28.172e-32 139
LLPS-Sem-0489Selaginella moellendorffii28.152e-31 135
LLPS-Asg-0442Ashbya gossypii28.123e-30 132
LLPS-Pot-1416Populus trichocarpa28.098e-30 130
LLPS-Osl-1295Ostreococcus lucimarinus28.063e-28 125
LLPS-Vir-0780Vigna radiata28.01e-32 140
LLPS-Phv-1389Phaseolus vulgaris27.953e-32 138
LLPS-Chr-0745Chlamydomonas reinhardtii27.953e-29 130
LLPS-Coc-0959Corchorus capsularis27.894e-32 139
LLPS-Asc-0018Aspergillus clavatus27.761e-33 143
LLPS-Glm-2569Glycine max27.711e-31 137
LLPS-Orgl-1376Oryza glumaepatula27.687e-27 122
LLPS-Dac-2259Daucus carota27.664e-27 119
LLPS-Asfu-0124Aspergillus fumigatus27.624e-30 131
LLPS-Php-1346Physcomitrella patens27.69e-30 130
LLPS-Mao-0216Magnaporthe oryzae27.552e-22 107
LLPS-Tut-0027Tursiops truncatus27.459e-24 112
LLPS-Cis-0626Ciona savignyi27.377e-28 125
LLPS-Usm-1235Ustilago maydis27.334e-24 113
LLPS-Cym-0624Cyanidioschyzon merolae27.123e-25 116
LLPS-Mea-3453Mesocricetus auratus27.116e-26 118
LLPS-Sol-2408Solanum lycopersicum27.017e-30 131
LLPS-Miv-0020Microbotryum violaceum26.054e-32 138
LLPS-Chc-0363Chondrus crispus25.743e-24 113
LLPS-Mel-1111Melampsora laricipopulina25.683e-27 122