• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Coc-2269
CCACVL1_11335

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: Putative nuclear matrix constituent protein 1-like protein-like protein
Gene Name: CCACVL1_11335
Ensembl Gene: CCACVL1_11335
Ensembl Protein: OMO83566
Organism: Corchorus capsularis
Taxa ID: 210143
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
NucleolusPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblOMO83566OMO83566
UniProtA0A1R3ILY5, A0A1R3ILY5_COCAP
GeneBankAWWV01009854OMO83566.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MGIAGKFSGE  MDNRSSSGSG  DMFTPQRKTW  GGLTPKPPTN  AKTGEKGKTV  AFLDDPRKLP  60
61    PPPVVSLSSP  LNVGLEDEGM  EDWRWFKEAG  LLDEASLERR  DHEALVERLS  KIEQELHNYQ  120
121   YNMGLLLIEK  KEWTSKCEEL  KRELAEAEEI  LRREQAAHLI  AFSEVQKREE  NLAKALAVEK  180
181   QCVADLEKAL  RDIQEEHAQV  KLSSDTKLAN  ATAIVAEIER  KSAEVEEKML  AADAKLAEVN  240
241   RKSSELDMKL  REMEARESVL  QRERLSLTAE  REAHQETFYK  QREELNEWEK  KLNKGEERLS  300
301   ELRRILNLRE  EKVNENDRLL  KQKERSLEEA  QSKIDISTFK  LKEMEDDVSK  RLADLVTKEE  360
361   EAESMRSILE  AKQKDLAAFE  EMLTTRERVE  IQKLVDEQRG  ILDAKLQEFE  LELKEKRKSV  420
421   DEELESKVQE  VKQQEAEIHH  KQEKLKKQEQ  SLDKKLERVK  EREKDLEVRL  KTVKDREKFV  480
481   KTEEKRLELE  KEQLYSAKES  LQALKDEIDK  IGAETNQQEL  RIREESQKLK  LTEEERKEHI  540
541   RLQSELKQQI  DNCRRQEELL  MKEHEDLKQQ  RERFEKEWEI  LDEKRAEITM  KQKEIVEEME  600
601   KLEKLRHSEE  ERLKKEDHVM  QDYICREKES  IRLQKESFEA  TMKHEKSVLL  EEAQNERIKM  660
661   LQDFELQKMN  LETEYQNRFD  QMQKDLQDRI  VAFEEAKDRE  LANLRCSKED  CEREMEEIRS  720
721   QRYAVEREKQ  EVALNRNKLK  EQQQEMRKDI  DELGIVSSRL  KDQRQQFIRE  RHSFLEFVEK  780
781   HKSCKDCGEK  TRDFVLSNFQ  LPDAEDREIV  PLTRLADELL  QNRQGYLDGS  GVTNFKGSPE  840
841   AYSQYPESAG  RMSWLRKCTS  KILSISPTKR  NESKAEESGV  LTAKESGGNI  HVEVEAPSLK  900
901   IQSDSINNQL  LQSDNIREVD  NSSGPSLSID  HSYIDSKVQE  LPEDSQQSDQ  KSGRRKRGRK  960
961   PKSGPHRTRS  VKAVVEDAKL  FLGGSPEEPE  PSESVQPHDI  SHVHEEFAGT  STHSEKGLHN  1020
1021  NGRKRQQPQN  SKVTDSEMDA  ADSEVHCDSI  PAGGRRKRRQ  TVALGLQTPG  EKRYNLRRPK  1080
1081  TMVTATAAQA  ASDVLKTTED  ADGGGGEGGG  IDIENRKSDL  VQVAISKSVE  IIEDKFKAGD  1140
1141  VDDNANVAKS  VGNVELSEEV  NGSGSAENGD  EDQSGSTMNE  EEEDYGDETE  QPGEVSIGKK  1200
1201  IWTFFTS  1207
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGGGATAG  CGGGAAAGTT  CAGCGGCGAA  ATGGACAATA  GAAGCAGCTC  CGGTTCTGGT  60
61    GATATGTTCA  CGCCTCAAAG  GAAGACGTGG  GGTGGATTAA  CGCCGAAGCC  ACCCACTAAC  120
121   GCTAAGACTG  GTGAGAAGGG  AAAAACCGTT  GCATTCCTCG  ATGATCCGAG  GAAACTGCCA  180
181   CCACCACCTG  TTGTTTCGCT  TAGCAGCCCA  TTGAATGTGG  GATTGGAAGA  TGAGGGAATG  240
241   GAGGACTGGA  GGTGGTTCAA  AGAAGCTGGC  TTGTTGGATG  AAGCCTCCTT  GGAAAGGAGG  300
301   GACCATGAAG  CCCTTGTTGA  AAGGCTCTCT  AAGATTGAAC  AGGAGCTTCA  CAACTACCAA  360
361   TATAATATGG  GGCTTCTCCT  CATTGAGAAA  AAAGAATGGA  CATCAAAATG  TGAAGAACTG  420
421   AAGCGAGAAC  TTGCTGAAGC  CGAGGAGATC  CTCAGACGTG  AGCAAGCAGC  ACACTTGATC  480
481   GCCTTTTCTG  AAGTTCAAAA  GCGAGAGGAA  AACTTGGCAA  AAGCCTTGGC  TGTTGAAAAA  540
541   CAATGTGTGG  CAGATCTTGA  AAAGGCATTA  CGTGATATCC  AAGAAGAGCA  TGCCCAAGTC  600
601   AAGCTTAGTT  CTGACACAAA  GTTGGCTAAT  GCGACCGCAA  TAGTTGCTGA  GATTGAAAGA  660
661   AAATCCGCAG  AGGTGGAAGA  AAAGATGCTT  GCTGCTGATG  CTAAGCTTGC  AGAGGTAAAT  720
721   CGGAAAAGTT  CCGAGTTGGA  CATGAAACTG  CGAGAGATGG  AGGCTCGTGA  AAGTGTGCTT  780
781   CAAAGAGAGC  GTCTTTCCTT  AACTGCAGAA  CGAGAAGCAC  ATCAAGAAAC  TTTTTATAAA  840
841   CAGAGGGAAG  AGTTGAATGA  GTGGGAGAAG  AAACTAAACA  AAGGAGAAGA  GAGGTTGTCT  900
901   GAGCTTAGGA  GAATACTCAA  TTTGAGGGAG  GAAAAGGTCA  ATGAGAATGA  TAGGCTTCTC  960
961   AAGCAGAAAG  AGAGGAGCCT  TGAAGAGGCA  CAAAGTAAGA  TTGATATATC  AACCTTCAAG  1020
1021  TTAAAGGAGA  TGGAAGATGA  TGTAAGCAAA  CGACTTGCTG  ACTTGGTTAC  AAAAGAGGAG  1080
1081  GAAGCTGAGT  CCATGAGAAG  TATTCTGGAA  GCAAAACAGA  AGGATCTAGC  TGCATTTGAA  1140
1141  GAAATGCTTA  CTACTAGAGA  AAGGGTGGAG  ATACAAAAAC  TTGTTGATGA  GCAAAGGGGT  1200
1201  ATTCTAGATG  CTAAATTGCA  GGAGTTTGAG  TTGGAACTGA  AAGAAAAGAG  GAAGTCTGTT  1260
1261  GATGAGGAAT  TAGAAAGCAA  GGTACAAGAA  GTGAAGCAGC  AGGAAGCTGA  AATTCACCAC  1320
1321  AAGCAGGAAA  AGTTGAAAAA  GCAAGAACAA  TCATTGGATA  AGAAGTTGGA  GAGAGTGAAG  1380
1381  GAGAGAGAAA  AGGATCTTGA  GGTGAGGTTG  AAAACTGTCA  AGGACAGAGA  GAAATTTGTA  1440
1441  AAAACTGAGG  AGAAAAGGTT  GGAGTTGGAA  AAGGAACAAC  TCTACTCTGC  TAAAGAGAGC  1500
1501  TTGCAAGCTC  TTAAAGATGA  GATTGATAAG  ATAGGGGCTG  AAACTAATCA  GCAAGAATTA  1560
1561  CGGATTCGTG  AGGAGTCTCA  AAAGCTTAAA  TTAACTGAAG  AGGAGAGGAA  GGAACACATC  1620
1621  CGTTTGCAGT  CAGAATTGAA  ACAGCAGATA  GATAACTGCA  GACGTCAGGA  GGAGTTGCTT  1680
1681  ATGAAGGAAC  ATGAAGATCT  GAAACAGCAA  AGGGAAAGAT  TTGAGAAAGA  GTGGGAAATT  1740
1741  TTGGATGAAA  AAAGAGCCGA  AATTACCATG  AAACAAAAGG  AAATTGTTGA  AGAAATGGAA  1800
1801  AAGTTAGAAA  AGTTGCGACA  TTCCGAAGAA  GAAAGGTTGA  AGAAAGAGGA  TCATGTTATG  1860
1861  CAAGATTATA  TTTGTAGGGA  GAAGGAATCG  ATCAGGCTGC  AAAAAGAATC  ATTTGAAGCC  1920
1921  ACAATGAAGC  ATGAGAAGTC  GGTTTTACTA  GAAGAGGCTC  AGAATGAGCG  CATTAAGATG  1980
1981  CTTCAAGATT  TTGAACTGCA  AAAGATGAAT  CTTGAAACTG  AATACCAGAA  TAGGTTTGAT  2040
2041  CAAATGCAGA  AAGATCTGCA  GGATAGGATT  GTTGCATTTG  AGGAGGCGAA  GGATAGAGAA  2100
2101  CTTGCTAATC  TCAGATGCTC  TAAAGAAGAT  TGTGAGAGGG  AAATGGAAGA  AATACGATCT  2160
2161  CAAAGGTATG  CTGTAGAAAG  GGAAAAACAG  GAAGTTGCAC  TTAATAGGAA  TAAGCTAAAA  2220
2221  GAGCAGCAGC  AGGAAATGCG  AAAGGACATT  GATGAACTTG  GTATCGTTAG  CAGCAGGCTC  2280
2281  AAGGATCAAC  GGCAACAGTT  TATCCGTGAA  AGACATAGCT  TCCTCGAATT  TGTTGAGAAG  2340
2341  CACAAGTCTT  GTAAGGACTG  CGGAGAAAAA  ACAAGGGACT  TTGTGCTCTC  TAACTTCCAA  2400
2401  CTACCTGATG  CTGAGGATAG  GGAAATTGTT  CCTCTTACAA  GACTAGCTGA  TGAACTCCTA  2460
2461  CAGAATCGCC  AAGGTTATTT  AGATGGTTCT  GGTGTTACAA  ATTTTAAAGG  ATCTCCTGAA  2520
2521  GCTTATTCAC  AGTATCCAGA  ATCTGCTGGA  CGCATGTCTT  GGCTTCGCAA  ATGCACTTCA  2580
2581  AAGATCTTAA  GTATTTCACC  AACTAAGAGA  AATGAAAGTA  AAGCTGAAGA  GTCTGGTGTG  2640
2641  CTTACTGCTA  AGGAATCAGG  AGGGAATATT  CATGTAGAGG  TAGAAGCACC  ATCTTTAAAG  2700
2701  ATTCAAAGTG  ACTCTATTAA  CAACCAATTG  CTCCAATCTG  ATAACATTAG  AGAGGTGGAC  2760
2761  AATTCATCTG  GTCCATCCTT  GTCCATTGAT  CATAGCTACA  TTGATAGTAA  GGTGCAAGAA  2820
2821  CTTCCTGAAG  ATTCTCAGCA  GTCAGACCAG  AAGAGTGGTC  GCCGCAAACG  TGGGAGAAAA  2880
2881  CCTAAATCTG  GACCGCATCG  GACACGCTCC  GTGAAGGCTG  TAGTTGAAGA  TGCAAAACTA  2940
2941  TTTCTTGGTG  GAAGTCCAGA  AGAGCCTGAG  CCTAGTGAGA  GTGTGCAACC  ACATGACATT  3000
3001  AGCCATGTCC  ATGAAGAATT  TGCTGGTACT  TCTACTCATT  CTGAGAAGGG  ACTACACAAC  3060
3061  AATGGAAGAA  AGCGGCAACA  ACCCCAAAAT  TCCAAAGTCA  CAGACAGCGA  GATGGATGCT  3120
3121  GCAGATAGTG  AAGTTCATTG  CGATAGTATT  CCAGCTGGTG  GGCGAAGGAA  GAGGCGGCAA  3180
3181  ACTGTTGCTC  TAGGCCTCCA  AACTCCAGGG  GAAAAACGAT  ACAATCTCAG  GCGACCTAAG  3240
3241  ACTATGGTTA  CAGCTACAGC  GGCACAAGCC  GCATCTGATG  TGCTGAAGAC  TACGGAGGAC  3300
3301  GCTGATGGTG  GTGGTGGGGA  AGGAGGAGGT  ATTGATATTG  AGAACAGAAA  ATCTGATTTG  3360
3361  GTGCAGGTGG  CAATATCGAA  AAGTGTGGAG  ATAATTGAAG  ACAAGTTCAA  AGCAGGCGAT  3420
3421  GTTGATGACA  ATGCCAATGT  GGCAAAGTCA  GTCGGGAATG  TCGAATTGAG  TGAAGAAGTA  3480
3481  AATGGTTCCG  GTTCCGCTGA  AAATGGTGAT  GAAGATCAGA  GTGGCAGCAC  AATGAATGAA  3540
3541  GAGGAGGAAG  ACTATGGTGA  CGAGACAGAG  CAACCGGGTG  AAGTCTCAAT  AGGAAAGAAA  3600
3601  ATCTGGACCT  TTTTTACCTC  ATGA  3624

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Thc-1493Theobroma cacao79.470.01570
LLPS-Gor-2180Gossypium raimondii70.640.01385
LLPS-Viv-0612Vitis vinifera53.190.0 891
LLPS-Pot-0420Populus trichocarpa52.780.0 895
LLPS-Mae-1225Manihot esculenta49.920.0 837
LLPS-Glm-0301Glycine max46.840.0 743
LLPS-Dac-2455Daucus carota45.310.0 585
LLPS-Bro-2468Brassica oleracea44.594e-128 424
LLPS-Brr-0691Brassica rapa44.590.0 613
LLPS-Brn-2262Brassica napus44.332e-129 428
LLPS-Phv-0285Phaseolus vulgaris43.880.0 687
LLPS-Art-1597Arabidopsis thaliana43.280.0 654
LLPS-Hea-1748Helianthus annuus39.661e-179 566
LLPS-Nia-1566Nicotiana attenuata31.352e-61 231
LLPS-Sol-1603Solanum lycopersicum30.087e-59 224
LLPS-Tra-1420Triticum aestivum29.74e-60 228
LLPS-Sot-0825Solanum tuberosum29.191e-59 226
LLPS-Met-1401Medicago truncatula28.021e-56 218