• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Caj-3503
RAPGEF6

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: Uncharacterized protein
Gene Name: RAPGEF6
Ensembl Gene: ENSCJAG00000014433.4
Ensembl Protein: ENSCJAP00000060186.1
Organism: Callithrix jacchus
Taxa ID: 9483
LLPS Type: LLPS regulator


▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Stress granule, Postsynaptic densityPredicted from orthologs(View)

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MNSPVDPGAR  QALRKKPPER  TPEDLNTIYS  YLHGMEILSN  LREHQLRLMS  ARARYERYSG  60
61    NQVLFCSETI  ARCWYILLSG  SVLVKDSMVL  PPCSFGKQFG  GKRGCDCLVL  EPSEMIVVEN  120
121   AKDNEDSILQ  REIPARQSRR  RFRKINYKGE  RQTITDDVEV  NSYLSLPADL  TKMHLTDNPH  180
181   PQVTHVSSSQ  SGCSIASDSG  SSSLSDIYQA  TESEVGDVDL  TRLPEGPVDS  EDDEEEDEEI  240
241   DRTDPLQGRD  LVRECLEKEP  ADKTDDDIEQ  LLEFMHQLPA  FANMTMSVRR  ELCSVMIFEV  300
301   VEQAGAVILE  DGQELDSWYV  ILNGTVEISH  PDGKVENLFM  GNSFGITPTL  DKQYMHGIVR  360
361   TKVDDCQFVC  IAQQDYWRIL  NHVEKNTHKV  EEEGEIVMVH  EHRELDRSGT  RKGHIVIKAT  420
421   PERLIMHLIE  EHSIVDPTYI  EDFLLTYRTF  LESPLDVGIK  LLEWFKIDSL  RDKVTRIVLL  480
481   WVNNHFNDFE  GDPAMTRFLE  EFEKNLEDTK  MNGHLRLLNI  ACAAKAKWRQ  VVLQKASRES  540
541   PLQFSLNGGS  EKGFGIFIEG  VEPGSKAADS  GLKRGDQIME  VNGQNFENIT  FMKALEILRN  600
601   NTHLALTVKT  NIFVFKELLC  RTEQEKSGVP  HIPKIAEKKS  NRHSIQHLPG  DIEQASQEKG  660
661   SKKVKANTVS  GGRNKIRKIL  DKTRFSILPP  KLFSDGGLSQ  SQDDSIVGTR  HCRHSLAIMP  720
721   IPGTLSSSSP  DLLQPTTSML  DFSNPSDIPD  QVIRVFKADQ  QSCYIIISKD  TTAKEVVCHA  780
781   VHEFGLTGAS  DTYSLCEVSV  TPEGVIKQRR  LPDQFSKLAD  RIQLSGRYYL  KNNMETETLC  840
841   SDEDAQELVK  EAQLSMLQLS  TIEVATQLSM  RDFDLFRNIE  PTEYIDDLFK  LNSKTGNSHL  900
901   KRFEDIVNQE  TFWVASEILT  EANQLKRMKI  IKHFIKIALH  CRECKNFNSM  FAIISGLNLA  960
961   SVARLRGTWE  KLPSKYEKHL  QDLQDIFDPS  RNMAKYRNIL  SSQSMQPPII  PLFPVVKKDM  1020
1021  TFLHEGNDSK  VDGLVNFEKL  RMISKEIRQV  VRMTSANMDP  AMMFRQRKKR  WRSLGSLSQG  1080
1081  STNSNMLDVQ  GGAHKKRARR  SSLLNAKKLY  EDAQMARKVR  QYLSSLDVET  DEERFQMMSL  1140
1141  QWEPAYGTLT  KNLSEKKSAK  SSEMSPVPMR  SAGQTSKVHL  HQPHRVSQVL  QVPAVNLYPI  1200
1201  RKKGQTKDPA  LNTSLPQKVL  GTTEEISGKK  HTEDTISVAS  SLHSSPPASP  QGSPHKGYTL  1260
1261  TPSAKSDNLS  DSSHSEISSR  SSIVSNCSVD  SMPAALQDER  CSTQALVIPE  STGALEKTEH  1320
1321  PSGIGDHSQH  GPGYTLLKPS  LIKCSAVSSS  VSSEEISHEH  IIIEAADSGR  GSWTSCSSSS  1380
1381  HDNFQSLPNP  KSWDFLNSYR  HTHLDDPIAE  VEPTDCEPYS  CPKSCSRTCG  QCKGSLETNQ  1440
1441  LRKSWASSSS  LSDTYEPNYG  TVKRRVLEST  PTESSEGLDP  KDATDTVYKT  VTSSTEKGLI  1500
1501  VYCVTSPKKD  DRYREPPPTP  PGYLGISLAD  LKEGPHPHLK  PPDYSVAVQR  SKMMHNSLSR  1560
1561  LPPASLGCNL  VACVPSKIVT  QPQRHNLQPS  HPKIADVTDA  DSEADENEQV  SAV  1613
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGAACTCAC  CCGTGGACCC  TGGCGCTAGG  CAGGCGTTGA  GGAAGAAGCC  ACCCGAGCGA  60
61    ACTCCCGAGG  ACTTAAATAC  TATTTATTCT  TATCTTCATG  GAATGGAAAT  ATTATCAAAT  120
121   CTCAGGGAAC  ATCAGCTTAG  ATTAATGTCT  GCAAGAGCAC  GCTATGAGAG  ATACAGTGGC  180
181   AATCAGGTTC  TCTTTTGTTC  AGAAACGATT  GCCAGATGTT  GGTACATCCT  GCTTTCTGGA  240
241   TCTGTGCTTG  TGAAAGACTC  CATGGTCTTG  CCTCCTTGCA  GTTTTGGTAA  GCAGTTTGGA  300
301   GGAAAAAGAG  GATGTGATTG  TCTTGTATTA  GAGCCTTCAG  AAATGATTGT  GGTAGAGAAT  360
361   GCCAAAGATA  ATGAAGATAG  TATTTTACAA  AGAGAAATTC  CTGCTAGACA  ATCTCGAAGA  420
421   AGATTTCGGA  AAATTAACTA  TAAAGGAGAG  CGCCAAACCA  TTACTGATGA  TGTGGAGGTA  480
481   AACAGCTATC  TTTCTCTTCC  AGCTGATCTT  ACCAAGATGC  ATCTCACAGA  CAACCCTCAT  540
541   CCACAGGTGA  CCCATGTGTC  TTCTAGTCAG  TCTGGTTGTA  GCATTGCCAG  TGACTCTGGA  600
601   AGCAGCAGTT  TATCTGATAT  CTATCAGGCT  ACAGAGAGTG  AGGTGGGAGA  TGTAGATTTG  660
661   ACACGTCTTC  CAGAAGGACC  TGTTGATTCT  GAGGATGACG  AAGAGGAAGA  TGAAGAGATT  720
721   GACAGAACAG  ATCCATTGCA  GGGACGAGAT  CTTGTTCGAG  AATGTCTTGA  AAAAGAGCCT  780
781   GCAGACAAAA  CTGATGATGA  CATTGAACAA  TTACTGGAGT  TTATGCACCA  GCTCCCTGCT  840
841   TTTGCAAACA  TGACCATGTC  TGTAAGGAGA  GAACTCTGCT  CGGTGATGAT  TTTTGAAGTG  900
901   GTAGAGCAGG  CTGGAGCTGT  TATTCTTGAA  GATGGGCAAG  AGCTTGACTC  ATGGTATGTT  960
961   ATTTTAAACG  GCACTGTAGA  AATCAGTCAT  CCAGATGGAA  AAGTTGAAAA  TTTGTTTATG  1020
1021  GGAAATAGTT  TTGGAATTAC  CCCCACTCTG  GATAAGCAGT  ACATGCATGG  AATTGTCAGG  1080
1081  ACTAAAGTAG  ATGATTGTCA  GTTTGTCTGC  ATAGCCCAGC  AAGATTATTG  GAGAATTTTA  1140
1141  AATCATGTGG  AAAAAAATAC  CCATAAAGTT  GAGGAAGAGG  GAGAAATTGT  TATGGTACAT  1200
1201  GAGCATCGTG  AACTAGACCG  GAGTGGAACC  CGGAAAGGAC  ACATTGTAAT  CAAGGCAACA  1260
1261  CCTGAGCGTC  TCATAATGCA  TTTAATAGAA  GAACATTCTA  TTGTGGATCC  AACTTATATA  1320
1321  GAAGATTTTC  TATTAACTTA  TAGGACATTT  CTTGAAAGTC  CTTTGGATGT  TGGAATCAAA  1380
1381  CTTTTGGAAT  GGTTTAAGAT  CGACAGCTTA  AGAGATAAGG  TGACGCGGAT  TGTATTATTA  1440
1441  TGGGTAAATA  ATCATTTTAA  TGATTTTGAA  GGTGACCCTG  CTATGACTCG  ATTTCTAGAA  1500
1501  GAATTTGAAA  AAAATCTGGA  AGATACGAAG  ATGAATGGTC  ATCTCCGGTT  ATTGAATATT  1560
1561  GCCTGTGCTG  CAAAGGCTAA  GTGGAGACAG  GTTGTGCTGC  AAAAGGCTTC  CCGTGAGTCC  1620
1621  CCTCTACAAT  TCAGCCTTAA  TGGAGGAAGT  GAGAAGGGAT  TTGGTATTTT  CATTGAAGGA  1680
1681  GTAGAACCTG  GGAGCAAAGC  CGCTGATTCA  GGACTGAAAC  GTGGTGATCA  GATTATGGAA  1740
1741  GTGAATGGAC  AAAACTTTGA  GAATATTACA  TTTATGAAAG  CCCTTGAAAT  TTTGAGGAAT  1800
1801  AATACTCATC  TTGCACTTAC  TGTAAAGACC  AACATTTTTG  TGTTCAAAGA  GTTACTTTGT  1860
1861  AGGACTGAAC  AAGAGAAATC  TGGTGTGCCT  CATATTCCAA  AAATTGCTGA  AAAAAAAAGT  1920
1921  AATCGCCATT  CTATCCAGCA  TCTTCCAGGA  GATATTGAAC  AGGCATCACA  AGAGAAAGGA  1980
1981  AGTAAGAAAG  TTAAAGCAAA  TACTGTTTCA  GGTGGAAGAA  ACAAAATCAG  GAAGATATTG  2040
2041  GATAAAACAC  GATTTAGTAT  CTTGCCTCCA  AAACTATTTA  GTGATGGAGG  CCTAAGCCAA  2100
2101  TCACAAGATG  ACAGCATTGT  GGGAACAAGG  CACTGTAGGC  ATAGTCTGGC  TATAATGCCC  2160
2161  ATTCCTGGAA  CACTTTCATC  CAGCAGCCCT  GATCTCCTGC  AGCCTACCAC  CAGTATGTTG  2220
2221  GATTTTTCCA  ATCCTTCAGA  TATTCCTGAT  CAAGTTATAA  GAGTTTTCAA  AGCGGATCAG  2280
2281  CAAAGTTGCT  ACATTATTAT  CAGTAAAGAC  ACTACAGCTA  AAGAAGTGGT  TTGTCATGCT  2340
2341  GTTCATGAAT  TTGGTTTGAC  CGGTGCATCC  GACACATATT  CTCTCTGTGA  AGTTTCTGTT  2400
2401  ACTCCTGAGG  GTGTCATAAA  ACAGAGAAGA  CTTCCAGATC  AGTTCTCCAA  ATTAGCTGAT  2460
2461  AGAATTCAAC  TCAGTGGAAG  GTATTATTTA  AAAAATAATA  TGGAAACAGA  AACCTTATGT  2520
2521  TCAGATGAAG  ATGCTCAAGA  ACTAGTTAAG  GAAGCCCAGC  TATCCATGCT  GCAGCTCAGT  2580
2581  ACCATTGAGG  TGGCCACCCA  GCTGTCAATG  AGGGATTTTG  ATTTGTTTCG  TAATATTGAG  2640
2641  CCAACTGAGT  ACATCGATGA  CCTTTTTAAG  TTAAATTCCA  AAACAGGAAA  TAGTCACTTG  2700
2701  AAGAGGTTTG  AGGACATTGT  AAACCAAGAG  ACATTCTGGG  TTGCCTCAGA  AATTTTAACT  2760
2761  GAAGCAAATC  AACTCAAACG  AATGAAGATT  ATTAAGCATT  TTATTAAAAT  TGCACTTCAT  2820
2821  TGTCGAGAAT  GTAAGAACTT  CAATTCCATG  TTTGCAATAA  TAAGTGGCTT  GAACCTGGCA  2880
2881  TCTGTAGCAC  GACTCAGAGG  TACTTGGGAA  AAGTTACCAA  GCAAATATGA  GAAACATCTT  2940
2941  CAAGATCTAC  AAGACATTTT  TGATCCATCT  AGAAACATGG  CAAAGTATAG  AAATATTCTT  3000
3001  AGTAGTCAAA  GTATGCAGCC  TCCAATTATT  CCACTCTTCC  CTGTTGTCAA  GAAAGATATG  3060
3061  ACATTTCTAC  ATGAGGGAAA  TGACTCCAAA  GTAGATGGTT  TAGTAAACTT  TGAGAAGTTA  3120
3121  AGAATGATTT  CCAAGGAAAT  CCGCCAAGTT  GTTCGAATGA  CTTCTGCTAA  CATGGACCCA  3180
3181  GCCATGATGT  TTCGACAGAG  GAAGAAGAGG  TGGCGGAGTC  TGGGATCACT  GAGTCAAGGA  3240
3241  AGCACAAATT  CGAACATGCT  GGATGTTCAG  GGAGGTGCTC  ACAAAAAAAG  GGCACGCCGC  3300
3301  AGCTCTCTCC  TTAATGCCAA  GAAGCTGTAT  GAGGATGCGC  AAATGGCAAG  GAAGGTGAGG  3360
3361  CAGTATCTTT  CTAGTCTGGA  TGTGGAGACA  GATGAGGAGA  GGTTCCAGAT  GATGTCATTA  3420
3421  CAGTGGGAGC  CTGCATATGG  TACCTTGACC  AAGAATTTAA  GTGAGAAAAA  ATCAGCCAAA  3480
3481  TCATCTGAAA  TGTCTCCAGT  GCCTATGAGA  TCAGCTGGCC  AAACAAGTAA  AGTCCACTTG  3540
3541  CATCAACCCC  ACAGAGTAAG  CCAGGTGCTT  CAGGTGCCAG  CTGTTAATTT  GTACCCCATC  3600
3601  AGGAAGAAGG  GACAAACAAA  AGACCCTGCA  TTGAATACAA  GTTTACCTCA  GAAAGTTTTA  3660
3661  GGAACAACTG  AAGAAATAAG  TGGTAAGAAG  CATACAGAAG  ACACTATTTC  TGTGGCATCA  3720
3721  TCTTTACATT  CTAGTCCTCC  TGCATCTCCT  CAAGGTTCCC  CTCACAAAGG  TTACACACTT  3780
3781  ACTCCATCAG  CTAAATCTGA  CAACTTGTCT  GACTCCAGCC  ATAGTGAGAT  TTCTTCACGG  3840
3841  TCCAGCATCG  TAAGCAATTG  TTCTGTTGAC  TCTATGCCTG  CAGCTCTACA  GGATGAACGG  3900
3901  TGTTCCACTC  AGGCCCTGGT  AATCCCTGAA  TCCACTGGGG  CATTGGAAAA  GACAGAGCAC  3960
3961  CCTTCAGGGA  TAGGAGATCA  TAGTCAGCAT  GGCCCTGGGT  ATACACTCTT  GAAGCCATCT  4020
4021  CTAATCAAGT  GTTCAGCTGT  CTCATCGTCT  GTGAGCAGTG  AAGAGATTTC  TCATGAGCAT  4080
4081  ATCATCATAG  AAGCAGCTGA  CAGTGGTCGT  GGAAGTTGGA  CTTCGTGTTC  AAGCAGCTCC  4140
4141  CATGACAACT  TCCAAAGCCT  TCCAAACCCA  AAAAGCTGGG  ATTTTTTGAA  CTCTTACAGA  4200
4201  CATACCCATT  TGGATGACCC  CATTGCTGAA  GTTGAACCCA  CTGACTGTGA  GCCCTATTCC  4260
4261  TGTCCTAAAA  GCTGCTCTAG  AACTTGTGGG  CAGTGTAAAG  GAAGCCTAGA  GACAAATCAG  4320
4321  TTGAGAAAGA  GTTGGGCCTC  CTCCAGTTCT  CTGTCTGACA  CGTATGAACC  AAACTATGGG  4380
4381  ACAGTTAAAC  GGAGAGTATT  GGAGAGCACC  CCAACCGAGT  CATCTGAAGG  CTTAGACCCC  4440
4441  AAGGATGCCA  CTGACACAGT  TTACAAAACT  GTCACATCAA  GTACAGAAAA  GGGCTTGATT  4500
4501  GAAAATGAAC  AAGTTTCAGC  AGTCTAG  4527

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Aon-1574Aotus nancymaae98.510.02979
LLPS-Gog-3303Gorilla gorilla98.220.01842
LLPS-Mal-3419Mandrillus leucophaeus97.580.02940
LLPS-Cea-4025Cercocebus atys97.580.02943
LLPS-Paa-1008Papio anubis97.520.02939
LLPS-Maf-0048Macaca fascicularis97.460.02937
LLPS-Man-2423Macaca nemestrina97.450.02922
LLPS-Chs-1779Chlorocebus sabaeus97.270.02933
LLPS-Nol-3968Nomascus leucogenys97.210.02928
LLPS-Hos-1215Homo sapiens97.210.02930
LLPS-Pat-2416Pan troglodytes97.210.02929
LLPS-Pap-4276Pan paniscus97.210.02930
LLPS-Dio-1131Dipodomys ordii96.730.01066
LLPS-Poa-3643Pongo abelii96.530.02894
LLPS-Caf-3973Canis familiaris94.420.02861
LLPS-Urm-1456Ursus maritimus94.30.02859
LLPS-Fec-1271Felis catus94.30.02853
LLPS-Aim-2828Ailuropoda melanoleuca94.240.02853
LLPS-Otg-3194Otolemur garnettii94.010.02804
LLPS-Loa-3336Loxodonta africana93.870.02830
LLPS-Ict-2155Ictidomys tridecemlineatus93.80.02838
LLPS-Sus-2130Sus scrofa93.70.02840
LLPS-Myl-0899Myotis lucifugus93.430.02841
LLPS-Mup-3773Mustela putorius furo93.20.02823
LLPS-Cas-3949Carlito syrichta93.060.02809
LLPS-Bot-0387Bos taurus92.970.02787
LLPS-Ova-2191Ovis aries92.450.02761
LLPS-Mea-2560Mesocricetus auratus91.880.02778
LLPS-Eqc-2184Equus caballus91.640.02820
LLPS-Cap-3381Cavia porcellus91.570.02725
LLPS-Mum-4505Mus musculus91.440.02757
LLPS-Ran-0254Rattus norvegicus90.830.02724
LLPS-Meg-3051Meleagris gallopavo82.610.02419
LLPS-Mod-2267Monodelphis domestica82.050.02454
LLPS-Anp-2560Anas platyrhynchos81.830.02417
LLPS-Gaga-3381Gallus gallus80.610.02315
LLPS-Fia-2379Ficedula albicollis79.820.02407
LLPS-Anc-2989Anolis carolinensis78.310.02374
LLPS-Lac-4007Latimeria chalumnae75.680.01971
LLPS-Scm-0249Scophthalmus maximus75.410.01812
LLPS-Xet-2684Xenopus tropicalis75.340.02122
LLPS-Scf-0553Scleropages formosus75.080.01822
LLPS-Leo-0471Lepisosteus oculatus75.060.01802
LLPS-Orn-2514Oreochromis niloticus74.860.01783
LLPS-Xim-0428Xiphophorus maculatus73.70.01776
LLPS-Orl-0675Oryzias latipes73.190.01753
LLPS-Ten-1247Tetraodon nigroviridis68.450.01694
LLPS-Pof-1906Poecilia formosa67.080.01846
LLPS-Orc-3237Oryctolagus cuniculus37.54e-0859.3
LLPS-Mam-3801Macaca mulatta37.047e-0858.2
LLPS-Rhb-3892Rhinopithecus bieti37.047e-0858.2
LLPS-Sah-0843Sarcophilus harrisii37.041e-0757.8
LLPS-Fud-3786Fukomys damarensis36.255e-0858.5
LLPS-Ora-2988Ornithorhynchus anatinus35.399e-20 100
LLPS-Tag-2175Taeniopygia guttata35.112e-0859.7
LLPS-Tut-1647Tursiops truncatus35.07e-0858.2
LLPS-Icp-4204Ictalurus punctatus34.832e-1999.8
LLPS-Mel-1234Melampsora laricipopulina34.652e-26 119
LLPS-Cii-1612Ciona intestinalis34.623e-1478.6
LLPS-Pes-2790Pelodiscus sinensis34.442e-19 100
LLPS-Dar-1776Danio rerio34.272e-1999.8
LLPS-Drm-2211Drosophila melanogaster32.281e-1897.1
LLPS-Lem-0425Leptosphaeria maculans32.053e-1895.9
LLPS-Crn-0074Cryptococcus neoformans32.03e-22 108
LLPS-Cis-2033Ciona savignyi31.613e-1685.1
LLPS-Phn-1165Phaeosphaeria nodorum31.438e-1894.4
LLPS-Cae-0531Caenorhabditis elegans31.43e-1689.4
LLPS-Fuv-0807Fusarium verticillioides31.341e-22 110
LLPS-Abg-1546Absidia glauca31.223e-26 122
LLPS-Pug-1028Puccinia graminis30.812e-22 109
LLPS-Ast-1255Aspergillus terreus29.323e-2099.0
LLPS-Scc-1518Schizosaccharomyces cryophilus29.23e-22 108
LLPS-Pytr-1321Pyrenophora triticirepentis28.432e-1380.1
LLPS-Blg-0225Blumeria graminis27.759e-1997.8
LLPS-Asni-0271Aspergillus niger27.686e-1894.0
LLPS-Scj-0622Schizosaccharomyces japonicus26.541e-1897.4