• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Brn-2892

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Ensembl Gene: GSBRNA2T00154166001
Ensembl Protein: CDX92404
Organism: Brassica napus
Taxa ID: 3708
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Stress granulePredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblCDX92404CDX92404

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MAETEGSLAD  DREVIGGFET  KSPWKTTASP  VETVDAPVMG  AHSWPALADA  QQPRPKNLPT  60
61    AAPPSKSIPA  SIPAPAQGVA  GQGKSKGGGK  GNPAHKNLSG  RHSKPGPKSN  QSGPPPPPPP  120
121   YVMHGVPYHP  SPFPPMVPPP  HATGPDFPYA  PYPPYPVPGA  PVAESGNEKK  AQASPLPPVL  180
181   PAPQGDHPGQ  PWQDQRGFGP  RNMPHGAAGP  RNFVRPPFMG  QAPGFMVGPG  SGFPGPVYYL  240
241   PVPPPGAIRG  YPLRYAPYPV  NQADSSGNFL  EYFSALSPSL  LVNWVAPHLA  MLTICVFLPF  300
301   FSDENLQNDK  YLISLMDKQE  GWVPIKIIAD  FKRVKMMTMD  VEFIVYALGY  SSSVEVQGEK  360
361   IRRRDEWAKW  VPASKRSDSE  EKVGDNDGDS  PESTTSRDNS  EKQSNDTSKP  TACSSEVQGA  420
421   QPSRTDANGS  DILKSSSSEQ  RNMDDLSTDF  SNTFLLDEEI  DLEHKSPRRS  GLSVCKRIED  480
481   EDDDIAVDDH  DHDIQKLVIV  TQNSERSDGT  GISGTKAKNI  PKELASTIND  GLYYFEQELK  540
541   KNRPGRKKNN  SHLDSRDGKV  KGGGLNIKLG  ENSAANGGEE  HSIRRKQNKG  THKNQMAHVR  600
601   RFFSGNTRNH  GAVSESPPSS  SIGFFFGSTP  PDSHGHRLSK  LSSSPQYSLS  GSSPPVGSLP  660
661   KSFPHFQHPS  HQLLEENGFK  QEKYLKYRKR  CLNERKKLGS  GCSEEMNHLY  RFWSYFLRET  720
721   FVPSMYEDFQ  KFALEDAAGN  YNYGLECLFR  FYSYGLEKQF  DEDLYKDFEQ  LTLDFYHKGN  780
781   LYGLEKYWAF  HHYRGQKEPI  KKHPELEKLL  KEEYRSLDDF  RAKDSVTSQK  ENKSH  835
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGCGGAGA  CTGAGGGATC  ATTGGCCGAT  GATCGAGAAG  TGATCGGCGG  TTTCGAGACT  60
61    AAGTCTCCAT  GGAAAACAAC  TGCTTCTCCT  GTGGAAACCG  TCGACGCTCC  GGTAATGGGT  120
121   GCTCACTCGT  GGCCTGCTCT  CGCCGACGCG  CAGCAACCGC  GTCCTAAGAA  TCTTCCGACG  180
181   GCGGCTCCGC  CGTCTAAATC  CATTCCGGCC  TCAATCCCAG  CTCCTGCTCA  GGGTGTAGCT  240
241   GGTCAAGGGA  AGTCTAAGGG  TGGTGGAAAG  GGCAACCCTG  CGCACAAGAA  TCTATCTGGC  300
301   CGTCATTCAA  AGCCAGGCCC  GAAGAGCAAC  CAAAGTGGTC  CTCCTCCTCC  CCCTCCTCCT  360
361   TACGTGATGC  ACGGTGTACC  TTATCATCCC  TCTCCTTTTC  CACCAATGGT  GCCTCCCCCG  420
421   CATGCTACTG  GTCCAGATTT  TCCGTATGCT  CCTTATCCTC  CTTACCCGGT  TCCCGGAGCT  480
481   CCTGTTGCAG  AGTCTGGCAA  TGAGAAGAAA  GCTCAAGCTT  CCCCTCTTCC  ACCTGTTTTG  540
541   CCAGCTCCTC  AGGGAGACCA  CCCTGGACAG  CCTTGGCAGG  ATCAGAGGGG  GTTTGGCCCC  600
601   AGGAACATGC  CACATGGCGC  TGCTGGACCG  AGGAATTTCG  TGAGACCTCC  GTTTATGGGA  660
661   CAAGCTCCTG  GGTTCATGGT  TGGTCCAGGT  TCAGGATTTC  CCGGGCCTGT  ATACTATTTG  720
721   CCGGTTCCAC  CCCCTGGAGC  TATTAGAGGT  TATCCTCTAC  GTTATGCTCC  ATACCCTGTT  780
781   AACCAGGCTG  ACTCCTCTGG  GAATTTCTTG  GAATATTTCT  CTGCGTTGAG  TCCATCTTTG  840
841   CTAGTTAATT  GGGTGGCACC  TCATCTTGCC  ATGCTCACCA  TATGTGTATT  TCTTCCTTTT  900
901   TTCAGTGATG  AAAACCTTCA  GAATGATAAG  TACCTCATAT  CCTTGATGGA  TAAACAAGAA  960
961   GGATGGGTTC  CCATAAAAAT  TATAGCTGAC  TTCAAAAGGG  TTAAGATGAT  GACGATGGAT  1020
1021  GTAGAGTTTA  TTGTCTATGC  GTTGGGATAT  TCTAGTTCTG  TTGAAGTGCA  GGGTGAGAAG  1080
1081  ATACGCAGGC  GAGACGAGTG  GGCTAAGTGG  GTTCCTGCAT  CTAAAAGGTC  AGACTCTGAG  1140
1141  GAAAAAGTTG  GAGACAATGA  CGGAGATTCC  CCAGAGAGTA  CAACAAGCAG  AGATAACTCT  1200
1201  GAAAAACAGT  CAAATGATAC  TTCAAAGCCT  ACTGCGTGCT  CTTCAGAGGT  ACAGGGAGCT  1260
1261  CAGCCATCAA  GAACCGATGC  TAATGGAAGT  GATATCCTGA  AATCATCATC  AAGCGAACAA  1320
1321  AGAAATATGG  ATGACTTGTC  AACCGATTTT  TCAAATACTT  TCTTGCTTGA  TGAGGAAATA  1380
1381  GATCTGGAGC  ATAAAAGCCC  TAGAAGGAGT  GGACTTTCCG  TGTGCAAAAG  AATTGAGGAT  1440
1441  GAAGACGATG  ATATTGCTGT  TGATGATCAT  GATCATGATA  TTCAGAAACT  TGTAATTGTC  1500
1501  ACCCAGAATA  GTGAGAGAAG  TGATGGCACT  GGAATCAGTG  GGACAAAAGC  AAAAAACATT  1560
1561  CCTAAGGAGC  TTGCCTCCAC  TATAAACGAC  GGTCTTTACT  ACTTTGAGCA  GGAGCTGAAA  1620
1621  AAGAATCGAC  CTGGTCGTAA  GAAGAACAAT  TCCCATTTAG  ATAGCAGAGA  TGGAAAAGTG  1680
1681  AAAGGCGGAG  GACTGAACAT  TAAACTAGGT  GAAAATTCCG  CAGCGAATGG  AGGTGAAGAG  1740
1741  CATAGTATTA  GGAGGAAGCA  AAATAAGGGA  ACCCACAAAA  ATCAAATGGC  CCATGTACGG  1800
1801  AGGTTCTTTT  CCGGCAACAC  AAGGAACCAT  GGGGCTGTTT  CTGAAAGTCC  GCCTAGTAGC  1860
1861  TCCATTGGAT  TTTTCTTTGG  TTCTACACCA  CCAGACAGTC  ATGGCCACAG  GCTTTCAAAA  1920
1921  TTGAGTTCAT  CACCACAGTA  CTCTCTCTCT  GGCAGCAGTC  CACCTGTGGG  GTCTTTACCA  1980
1981  AAATCATTTC  CACATTTTCA  ACATCCGAGC  CACCAACTGC  TTGAAGAGAA  TGGGTTTAAG  2040
2041  CAAGAAAAGT  ACTTGAAGTA  TCGCAAGCGG  TGCTTAAACG  AAAGAAAGAA  GCTGGGCAGC  2100
2101  GGATGCAGTG  AGGAAATGAA  TCATTTGTAC  CGATTCTGGT  CGTATTTCCT  CAGAGAAACG  2160
2161  TTTGTTCCGT  CTATGTATGA  AGATTTCCAG  AAGTTTGCTC  TTGAGGATGC  AGCTGGCAAT  2220
2221  TACAACTATG  GGTTGGAGTG  TCTCTTTAGG  TTCTATAGCT  ATGGCCTGGA  GAAGCAATTC  2280
2281  GATGAAGACC  TTTACAAGGA  CTTTGAGCAG  CTAACACTTG  ACTTCTACCA  CAAGGGTAAC  2340
2341  CTATATGGCT  TGGAGAAATA  TTGGGCTTTC  CACCATTACC  GAGGGCAAAA  AGAACCGATA  2400
2401  AAGAAGCACC  CTGAGCTAGA  GAAGCTACTG  AAGGAAGAAT  ACCGCAGCTT  AGATGATTTC  2460
2461  CGAGCCAAGG  ATTCAGTGAC  CAGCCAAAAA  GAAAACAAGT  CTCACTGA  2508

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Brr-0623Brassica rapa99.040.01319
LLPS-Bro-2181Brassica oleracea90.780.01172
LLPS-Glm-0188Glycine max82.425e-75 268
LLPS-Via-0768Vigna angularis79.394e-72 260
LLPS-Php-1444Physcomitrella patens75.762e-63 236
LLPS-Arl-0308Arabidopsis lyrata72.460.0 882
LLPS-Art-0526Arabidopsis thaliana72.350.0 904
LLPS-Aon-0707Aotus nancymaae70.974e-0655.1
LLPS-Leo-1357Lepisosteus oculatus66.417e-51 197
LLPS-Sem-0536Selaginella moellendorffii65.151e-55 196
LLPS-Chr-1462Chlamydomonas reinhardtii64.932e-49 193
LLPS-Orn-3979Oreochromis niloticus64.122e-49 192
LLPS-Scf-0263Scleropages formosus63.363e-49 192
LLPS-Xet-2325Xenopus tropicalis63.361e-48 190
LLPS-Ten-1290Tetraodon nigroviridis63.366e-48 188
LLPS-Tag-0224Taeniopygia guttata63.288e-48 187
LLPS-Tar-0062Takifugu rubripes62.61e-47 187
LLPS-Gaa-1651Gasterosteus aculeatus62.61e-46 184
LLPS-Gaga-1109Gallus gallus62.62e-48 190
LLPS-Fia-1179Ficedula albicollis62.62e-48 188
LLPS-Scm-1143Scophthalmus maximus62.66e-48 188
LLPS-Orl-3431Oryzias latipes61.831e-47 187
LLPS-Anc-0727Anolis carolinensis61.839e-48 187
LLPS-Pes-0139Pelodiscus sinensis61.837e-47 184
LLPS-Anp-1379Anas platyrhynchos61.651e-46 183
LLPS-Mua-1100Musa acuminata61.591e-86 286
LLPS-Xim-1846Xiphophorus maculatus61.072e-47 187
LLPS-Drm-0140Drosophila melanogaster61.073e-47 187
LLPS-Lac-0056Latimeria chalumnae61.071e-47 187
LLPS-Pof-3020Poecilia formosa61.072e-47 187
LLPS-Sei-1987Setaria italica60.471e-54 197
LLPS-Asm-1611Astyanax mexicanus60.318e-47 185
LLPS-Meg-0675Meleagris gallopavo59.853e-46 182
LLPS-Amt-1490Amborella trichopoda59.52e-85 300
LLPS-Dac-1572Daucus carota57.617e-96 326
LLPS-Icp-0522Ictalurus punctatus56.711e-52 203
LLPS-Dar-2707Danio rerio56.445e-53 188
LLPS-Urm-0841Ursus maritimus56.256e-49 191
LLPS-Osl-0461Ostreococcus lucimarinus55.159e-51 181
LLPS-Ora-2269Ornithorhynchus anatinus55.03e-48 189
LLPS-Sah-1571Sarcophilus harrisii55.05e-48 188
LLPS-Mod-0649Monodelphis domestica55.04e-48 188
LLPS-Abg-1123Absidia glauca54.221e-48 189
LLPS-Sus-1050Sus scrofa53.765e-50 194
LLPS-Cis-0991Ciona savignyi53.383e-41 156
LLPS-Ran-3456Rattus norvegicus53.189e-50 193
LLPS-Ova-1245Ovis aries53.181e-49 192
LLPS-Aim-0238Ailuropoda melanoleuca53.181e-49 193
LLPS-Mal-1782Mandrillus leucophaeus53.182e-49 192
LLPS-Paa-1658Papio anubis53.181e-49 194
LLPS-Tut-0747Tursiops truncatus53.182e-49 192
LLPS-Bot-3533Bos taurus53.181e-49 194
LLPS-Dio-0487Dipodomys ordii53.184e-48 188
LLPS-Gog-3400Gorilla gorilla53.182e-49 192
LLPS-Caj-0477Callithrix jacchus53.181e-49 194
LLPS-Fud-1014Fukomys damarensis53.181e-49 192
LLPS-Chs-0909Chlorocebus sabaeus53.182e-49 192
LLPS-Mum-3276Mus musculus53.188e-50 194
LLPS-Maf-0108Macaca fascicularis53.182e-49 193
LLPS-Mea-0420Mesocricetus auratus53.188e-50 194
LLPS-Cea-1357Cercocebus atys53.181e-49 194
LLPS-Cas-2072Carlito syrichta53.189e-50 194
LLPS-Nol-1508Nomascus leucogenys53.182e-49 192
LLPS-Ict-3529Ictidomys tridecemlineatus53.182e-49 192
LLPS-Cap-1464Cavia porcellus53.181e-49 192
LLPS-Eqc-0061Equus caballus53.185e-50 195
LLPS-Caf-3818Canis familiaris53.181e-49 193
LLPS-Mam-2636Macaca mulatta53.181e-49 192
LLPS-Otg-1208Otolemur garnettii53.181e-49 193
LLPS-Rhb-3457Rhinopithecus bieti53.182e-49 192
LLPS-Orc-1707Oryctolagus cuniculus53.189e-50 194
LLPS-Fec-0037Felis catus53.181e-49 194
LLPS-Hos-0754Homo sapiens53.182e-49 192
LLPS-Pap-2097Pan paniscus53.182e-49 192
LLPS-Pat-1197Pan troglodytes53.181e-49 193
LLPS-Loa-0611Loxodonta africana53.181e-49 193
LLPS-Man-0034Macaca nemestrina53.182e-49 192
LLPS-Thc-0370Theobroma cacao52.735e-174 533
LLPS-Cus-0715Cucumis sativus52.245e-1066.6
LLPS-Mup-0099Mustela putorius furo51.451e-49 193
LLPS-Met-1440Medicago truncatula51.412e-140 446
LLPS-Coc-0314Corchorus capsularis51.391e-1584.7
LLPS-Gor-1853Gossypium raimondii50.913e-169 521
LLPS-Poa-3071Pongo abelii50.872e-49 189
LLPS-Pot-2678Populus trichocarpa50.76e-1169.3
LLPS-Lep-1269Leersia perrieri50.35e-71 257
LLPS-Myl-3149Myotis lucifugus50.291e-47 187
LLPS-Nia-0978Nicotiana attenuata50.224e-141 447
LLPS-Prp-1586Prunus persica50.09e-159 494
LLPS-Orm-0437Oryza meridionalis49.855e-68 248
LLPS-Viv-0247Vitis vinifera49.673e-153 480
LLPS-Ori-0034Oryza indica49.561e-67 247
LLPS-Org-0891Oryza glaberrima49.561e-67 247
LLPS-Ors-1391Oryza sativa49.568e-68 247
LLPS-Mae-0575Manihot esculenta49.251e-0965.5
LLPS-Orgl-1238Oryza glumaepatula48.971e-68 250
LLPS-Orni-0342Oryza nivara48.971e-68 249
LLPS-Orb-0284Oryza barthii48.971e-68 250
LLPS-Orr-1213Oryza rufipogon48.971e-68 249
LLPS-Cii-0677Ciona intestinalis48.756e-42 164
LLPS-Cae-0410Caenorhabditis elegans48.71e-35 150
LLPS-Sol-2150Solanum lycopersicum48.681e-1482.0
LLPS-Tra-1206Triticum aestivum48.671e-69 253
LLPS-Hea-0174Helianthus annuus48.611e-1582.4
LLPS-Orbr-2021Oryza brachyantha48.517e-67 244
LLPS-Phv-0047Phaseolus vulgaris47.793e-136 435
LLPS-Vir-1942Vigna radiata46.825e-132 425
LLPS-Sot-0337Solanum tuberosum46.742e-1481.6
LLPS-Brd-0041Brachypodium distachyon46.592e-65 241
LLPS-Scp-0599Schizosaccharomyces pombe46.275e-0653.5
LLPS-Spr-0947Sporisorium reilianum45.715e-0964.3
LLPS-Orp-1418Oryza punctata44.815e-53 202
LLPS-Hov-1064Hordeum vulgare44.53e-70 255
LLPS-Usm-0983Ustilago maydis44.292e-0759.3
LLPS-Scc-0040Schizosaccharomyces cryophilus44.127e-0756.2
LLPS-Sob-0456Sorghum bicolor43.938e-53 202
LLPS-Pyt-1123Pyrenophora teres41.562e-0758.9
LLPS-Zem-1278Zea mays40.541e-0965.5
LLPS-Nef-0467Neosartorya fischeri38.897e-1067.0
LLPS-Tum-1010Tuber melanosporum38.181e-1172.8
LLPS-Scs-0939Sclerotinia sclerotiorum38.162e-0862.4
LLPS-Fuv-0525Fusarium verticillioides37.787e-0860.5
LLPS-Asfu-0353Aspergillus fumigatus37.043e-0965.1
LLPS-Zyt-0520Zymoseptoria tritici36.171e-0966.2
LLPS-Mel-1042Melampsora laricipopulina36.146e-0860.8
LLPS-Asc-1350Aspergillus clavatus34.263e-0862.0
LLPS-Yal-1588Yarrowia lipolytica34.074e-0757.4