• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Brn-2826
BnaA03g52370D

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: BnaA03g52370D protein
Gene Name: BnaA03g52370D, GSBRNA2T00077839001
Ensembl Gene: GSBRNA2T00130696001
Ensembl Protein: CDX68950
Organism: Brassica napus
Taxa ID: 3708
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Stress granule, OthersPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblCDX68950CDX68950
UniProtA0A078FKS2, A0A078FKS2_BRANA
GeneBankLK032035CDY13519.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MNSNGGDKEK  KKLGNGVVGI  LAETVNKWER  RTPLTPSHCA  RLLHGGKDRT  GVSRIVVQPS  60
61    AKRIHHDALY  EDVGCEVSDD  LSDCGLILGI  KQPELEMILP  ERAYAFFSHT  HKAQKENMPL  120
121   LDKILSERVT  LYDYELIVGD  HGKRLLAFGQ  YAGRAGLVDF  LHGLGQRYLS  LGYSTPFLSL  180
181   GSSYMYSSLA  AAKAAVISVG  EEIASQGLPL  GICPLVFVFT  GTGNVSLGAQ  EIFELLPHTF  240
241   VEPSKLPELF  VKDKGVGQNG  KSTKRVHHVY  GCIITSQDMV  EHQDPSKPFD  KADYYVHPEH  300
301   YNPVFHEKIA  PYTSVLVNCM  YWEKRFPRLL  STKQLQDLTA  KACPLVGICD  ITCDIGGSIE  360
361   FVNRATLIDS  PFFRFNPTNN  SYYQDMDGDG  LLCMAVDILP  TEFAKEASQH  FGDILSEFVG  420
421   SLASMTEVSD  LPAHLKRACI  SYRGELTSLY  EYIPRMRKSD  PEETQDNITN  GASNQRTYNI  480
481   LVSLSGHLFD  KFLINEALDM  IEAAGGSFHL  AKCEIGQSAD  AESYSELEVG  ADDRKVLDQI  540
541   IDSLTRLANP  DDEEDYISPR  RESNKISLKI  GKVQQENEEK  PEEMTKRSSV  LILGAGRVCR  600
601   PAAEFLASVR  NISSQQWYKT  YLGGEQRDVR  VIVASLYLKD  AKETVEGMPE  VEAVQLDVSD  660
661   SESLLKYVSE  VDVVLSLLPA  SCHASVAKTC  IELKKHLITA  SYVDDETSGL  HEKAKHAGIT  720
721   ILGEMGLDPG  IDHMMAMKMI  NEAHIRKGKV  KSFTSYCGGL  PSPAAANNPL  AYKFSWNPAG  780
781   AIRAGRNPAK  YKSNGDIIHV  DGEDLYDSAT  RFRVPNLPAF  ALECLPNRNS  LVYGEHYGIE  840
841   REASTIFRFS  MIMATLSKLG  FFDNEANQLL  SSGQKITFGS  LLSNILRKDG  ESVEALDGEE  900
901   EISKRILKLG  HSKESAATAA  KTIVFLGYNE  EREIPSLCKS  VFGATCYLME  EKLAYSGNEQ  960
961   DMVLLHHEVE  VEFPGSKRTE  KHSATLLEFG  EIKNGQMTTA  MAKTVGIPAA  IGALLLIEDK  1020
1021  IKTRGVLRPL  EPEVYLPALD  ILQAYGIKLM  EKTE  1054
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGAATTCAA  ATGGCGGTGA  TAAGGAGAAG  AAGAAGCTAG  GGAATGGAGT  TGTGGGGATT  60
61    CTAGCTGAAA  CCGTAAACAA  ATGGGAGAGA  AGAACACCAT  TGACACCATC  TCATTGCGCT  120
121   CGCCTTTTAC  ACGGTGGCAA  AGACAGAACC  GGAGTTTCAC  GCATTGTGGT  TCAGCCATCT  180
181   GCAAAGCGTA  TCCATCACGA  TGCCTTGTAC  GAAGACGTAG  GTTGTGAAGT  CTCTGATGAT  240
241   TTGTCTGACT  GTGGACTTAT  ACTCGGAATC  AAACAACCTG  AGCTAGAAAT  GATTCTTCCA  300
301   GAGAGAGCAT  ATGCTTTCTT  CTCCCACACT  CACAAGGCAC  AGAAAGAAAA  CATGCCTTTG  360
361   TTGGATAAAA  TTCTATCTGA  GAGAGTGACG  TTGTATGATT  ATGAGCTCAT  TGTTGGGGAT  420
421   CATGGGAAAA  GACTATTAGC  ATTTGGTCAA  TATGCAGGAA  GAGCTGGTCT  TGTTGACTTC  480
481   TTACATGGTC  TAGGACAAAG  ATATCTAAGT  TTAGGATACT  CAACGCCTTT  CCTCTCGCTA  540
541   GGGTCATCCT  ATATGTATTC  ATCATTGGCT  GCAGCAAAAG  CTGCTGTGAT  CTCTGTTGGC  600
601   GAAGAGATTG  CAAGCCAGGG  ACTGCCATTA  GGAATCTGCC  CTCTTGTGTT  TGTCTTCACT  660
661   GGGACAGGAA  ACGTTTCTCT  TGGGGCTCAA  GAGATTTTCG  AGCTTCTTCC  ACACACCTTT  720
721   GTTGAACCGA  GCAAGCTTCC  TGAACTGTTT  GTAAAAGACA  AAGGAGTTGG  TCAAAATGGA  780
781   AAATCAACAA  AGAGAGTCCA  TCATGTATAT  GGTTGTATCA  TTACAAGCCA  AGACATGGTT  840
841   GAACACCAAG  ATCCATCAAA  GCCGTTTGAC  AAAGCTGACT  ATTATGTACA  CCCGGAACAC  900
901   TACAATCCAG  TTTTCCATGA  AAAGATCGCC  CCTTATACAT  CAGTTCTTGT  GAACTGTATG  960
961   TACTGGGAGA  AGAGGTTTCC  TCGTCTTCTG  AGCACTAAAC  AGCTTCAAGA  TTTAACAGCA  1020
1021  AAAGCATGTC  CACTAGTGGG  AATATGTGAT  ATAACTTGTG  ATATAGGTGG  CTCCATTGAG  1080
1081  TTTGTTAACC  GAGCTACTTT  AATAGACTCC  CCTTTCTTTA  GGTTTAATCC  CACGAACAAT  1140
1141  TCATACTATC  AAGACATGGA  TGGTGATGGT  CTACTATGCA  TGGCCGTTGA  CATTCTACCA  1200
1201  ACAGAATTTG  CAAAAGAGGC  ATCCCAGCAT  TTTGGAGATA  TTCTTTCAGA  GTTTGTTGGT  1260
1261  AGTTTGGCTT  CCATGACTGA  AGTTTCTGAT  CTACCGGCAC  ACCTGAAGAG  GGCTTGCATA  1320
1321  AGCTATAGAG  GAGAGTTGAC  ATCTTTGTAT  GAGTATATTC  CACGTATGAG  GAAGTCTGAT  1380
1381  CCAGAAGAGA  CTCAAGATAA  CATCACCAAC  GGAGCTTCCA  ACCAGAGAAC  ATACAACATA  1440
1441  TTGGTATCTC  TAAGTGGACA  CCTGTTTGAT  AAGTTTCTAA  TAAACGAAGC  TCTCGATATG  1500
1501  ATCGAAGCTG  CCGGTGGCTC  ATTTCATTTG  GCTAAATGTG  AAATAGGACA  AAGCGCAGAT  1560
1561  GCTGAGTCAT  ACTCAGAACT  CGAAGTTGGT  GCGGATGATA  GGAAAGTATT  GGATCAAATA  1620
1621  ATTGATTCAT  TAACTCGATT  AGCTAATCCA  GATGATGAAG  AAGACTATAT  ATCTCCACGT  1680
1681  AGAGAATCAA  ATAAGATTTC  ACTGAAGATT  GGAAAAGTCC  AGCAAGAAAA  CGAAGAGAAG  1740
1741  CCCGAAGAAA  TGACAAAGAG  ATCATCGGTT  TTGATTCTTG  GCGCTGGACG  TGTGTGTCGT  1800
1801  CCAGCTGCTG  AGTTCCTAGC  TTCGGTCAGA  AACATTTCGT  CACAGCAATG  GTATAAAACT  1860
1861  TATTTGGGAG  GAGAACAAAG  AGATGTTCGT  GTGATTGTTG  CATCTCTTTA  TCTTAAGGAT  1920
1921  GCCAAAGAGA  CGGTTGAAGG  TATGCCAGAA  GTGGAAGCAG  TTCAGTTAGA  TGTGTCAGAT  1980
1981  AGTGAAAGCC  TCCTTAAGTA  TGTCTCTGAG  GTTGATGTTG  TTCTAAGTTT  ATTACCGGCA  2040
2041  AGTTGTCATG  CTTCTGTAGC  AAAGACATGC  ATTGAGCTGA  AGAAGCATCT  TATCACTGCT  2100
2101  AGCTATGTTG  ATGATGAAAC  GTCCGGGTTA  CATGAGAAAG  CTAAGCATGC  TGGGATTACA  2160
2161  ATTCTTGGCG  AAATGGGACT  GGACCCTGGA  ATCGATCACA  TGATGGCAAT  GAAAATGATC  2220
2221  AACGAGGCAC  ATATCAGAAA  GGGTAAAGTG  AAGTCTTTCA  CCTCTTACTG  TGGTGGCCTT  2280
2281  CCCTCTCCTG  CTGCAGCAAA  TAATCCATTA  GCATATAAAT  TTAGCTGGAA  TCCTGCTGGA  2340
2341  GCAATCCGAG  CTGGCCGTAA  CCCTGCCAAA  TACAAAAGCA  ACGGCGACAT  AATACATGTT  2400
2401  GATGGGGAGG  ATCTGTATGA  TTCAGCCACA  AGATTCAGAG  TACCTAACCT  TCCAGCTTTT  2460
2461  GCATTGGAGT  GTCTCCCAAA  CCGAAACTCC  TTGGTTTACG  GGGAACATTA  TGGCATTGAG  2520
2521  AGGGAAGCAT  CAACTATATT  CCGGTTTAGT  ATGATCATGG  CAACACTTTC  AAAACTCGGA  2580
2581  TTCTTTGACA  ATGAAGCAAA  TCAACTACTC  TCCAGTGGAC  AGAAGATTAC  GTTTGGTTCT  2640
2641  CTTCTAAGTA  ACATTCTTAG  GAAGGATGGA  GAATCTGTAG  AGGCTCTAGA  CGGAGAAGAA  2700
2701  GAGATCAGCA  AGAGGATTTT  AAAGCTTGGA  CATTCTAAGG  AGAGTGCAGC  CACAGCTGCT  2760
2761  AAAACAATTG  TATTCTTGGG  GTACAACGAA  GAGAGGGAGA  TTCCTTCATT  GTGTAAAAGT  2820
2821  GTGTTTGGTG  CAACTTGCTA  CCTAATGGAA  GAGAAGCTAG  CCTATTCCGG  AAATGAGCAG  2880
2881  GACATGGTGC  TTCTGCATCA  CGAAGTAGAA  GTGGAGTTCC  CTGGAAGCAA  ACGTACAGAG  2940
2941  AAGCACAGTG  CGACTCTCTT  GGAGTTTGGG  GAAATCAAGA  ACGGGCAAAT  GACGACTGCT  3000
3001  ATGGCCAAGA  CCGTTGGGAT  CCCTGCAGCT  ATTGGAGCTT  TGTTGTTAAT  TGAAGACAAG  3060
3061  ATCAAGACAA  GAGGAGTGTT  AAGGCCTCTT  GAACCTGAGG  TTTATTTGCC  AGCTTTGGAT  3120
3121  ATATTGCAAG  CATATGGTAT  AAAACTGATG  GAGAAGACAG  AATGA  3165

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Brr-1903Brassica rapa95.930.02010
LLPS-Bro-2404Brassica oleracea95.850.02026
LLPS-Arl-0214Arabidopsis lyrata90.750.01910
LLPS-Art-2691Arabidopsis thaliana89.510.01887
LLPS-Coc-1578Corchorus capsularis73.30.01555
LLPS-Thc-1337Theobroma cacao72.510.01538
LLPS-Prp-1695Prunus persica71.560.01508
LLPS-Gor-2285Gossypium raimondii71.270.01514
LLPS-Mae-2037Manihot esculenta70.620.01502
LLPS-Glm-2570Glycine max70.430.01465
LLPS-Vir-1853Vigna radiata70.270.01195
LLPS-Phv-2371Phaseolus vulgaris69.670.01454
LLPS-Met-2459Medicago truncatula69.040.01454
LLPS-Viv-0341Vitis vinifera68.980.01466
LLPS-Nia-0838Nicotiana attenuata67.460.01386
LLPS-Sol-0844Solanum lycopersicum66.540.01361
LLPS-Cus-1459Cucumis sativus65.940.01399
LLPS-Orni-2191Oryza nivara65.60.01325
LLPS-Mua-1804Musa acuminata65.510.01358
LLPS-Pot-2743Populus trichocarpa65.110.0 978
LLPS-Orbr-0863Oryza brachyantha64.590.01328
LLPS-Brd-0114Brachypodium distachyon64.560.01325
LLPS-Lep-0254Leersia perrieri64.550.01327
LLPS-Hea-1064Helianthus annuus64.470.01333
LLPS-Hov-1693Hordeum vulgare64.460.01274
LLPS-Sob-0761Sorghum bicolor64.410.01317
LLPS-Amt-2051Amborella trichopoda63.940.01335
LLPS-Sei-0383Setaria italica63.70.01324
LLPS-Tra-2497Triticum aestivum63.660.01309
LLPS-Orm-2104Oryza meridionalis63.620.01269
LLPS-Orr-1990Oryza rufipogon63.430.01262
LLPS-Orp-0095Oryza punctata63.360.01228
LLPS-Orgl-1420Oryza glumaepatula63.340.01259
LLPS-Zem-2005Zea mays63.050.01294
LLPS-Dac-2403Daucus carota63.02e-166 503
LLPS-Via-2357Vigna angularis62.857e-91 305
LLPS-Sot-2132Solanum tuberosum61.481e-148 458
LLPS-Orb-1673Oryza barthii61.020.01249
LLPS-Ors-2106Oryza sativa59.560.0 583
LLPS-Tru-1338Triticum urartu58.390.01171
LLPS-Ori-1153Oryza indica52.361e-60 211
LLPS-Sem-1906Selaginella moellendorffii52.240.01014
LLPS-Php-0020Physcomitrella patens50.00.0 944
LLPS-Mod-2952Monodelphis domestica40.733e-93 325
LLPS-Gaga-2415Gallus gallus40.396e-95 329
LLPS-Meg-0612Meleagris gallopavo40.392e-94 327
LLPS-Sah-3730Sarcophilus harrisii40.35e-92 321
LLPS-Asm-3375Astyanax mexicanus40.178e-93 323
LLPS-Fia-0972Ficedula albicollis39.968e-95 328
LLPS-Anp-0230Anas platyrhynchos39.872e-96 333
LLPS-Scf-2384Scleropages formosus39.834e-91 318
LLPS-Myl-2684Myotis lucifugus39.529e-91 315
LLPS-Pes-1239Pelodiscus sinensis39.529e-90 316
LLPS-Tut-0576Tursiops truncatus39.441e-90 317
LLPS-Ict-2834Ictidomys tridecemlineatus39.442e-90 316
LLPS-Eqc-0933Equus caballus39.362e-88 310
LLPS-Orc-2443Oryctolagus cuniculus39.312e-89 313
LLPS-Dar-3262Danio rerio39.182e-89 314
LLPS-Lac-3110Latimeria chalumnae38.898e-90 315
LLPS-Orn-1255Oreochromis niloticus38.884e-87 307
LLPS-Cap-3328Cavia porcellus38.792e-88 311
LLPS-Loa-2823Loxodonta africana38.792e-90 316
LLPS-Ten-2880Tetraodon nigroviridis38.744e-89 313
LLPS-Fud-2787Fukomys damarensis38.583e-89 313
LLPS-Dio-3903Dipodomys ordii38.545e-90 315
LLPS-Icp-3664Ictalurus punctatus38.543e-88 310
LLPS-Cis-0670Ciona savignyi38.464e-82 293
LLPS-Pof-2054Poecilia formosa38.444e-74 268
LLPS-Paa-0290Papio anubis38.359e-89 311
LLPS-Maf-4191Macaca fascicularis38.351e-88 311
LLPS-Chs-3324Chlorocebus sabaeus38.351e-88 311
LLPS-Cea-2251Cercocebus atys38.356e-89 312
LLPS-Mam-3636Macaca mulatta38.351e-88 311
LLPS-Man-1611Macaca nemestrina38.351e-88 311
LLPS-Rhb-1757Rhinopithecus bieti38.351e-88 310
LLPS-Otg-0028Otolemur garnettii38.31e-88 311
LLPS-Poa-4218Pongo abelii38.233e-88 310
LLPS-Sus-1928Sus scrofa38.152e-89 313
LLPS-Caj-2441Callithrix jacchus38.151e-88 311
LLPS-Cas-3012Carlito syrichta38.152e-88 311
LLPS-Nol-0339Nomascus leucogenys38.153e-88 310
LLPS-Hos-2972Homo sapiens38.152e-88 311
LLPS-Pat-4305Pan troglodytes38.152e-88 310
LLPS-Pap-3331Pan paniscus38.152e-88 311
LLPS-Mum-3857Mus musculus38.011e-87 308
LLPS-Mea-4549Mesocricetus auratus38.015e-88 309
LLPS-Xim-1485Xiphophorus maculatus37.972e-87 308
LLPS-Ova-0261Ovis aries37.952e-90 316
LLPS-Xet-3251Xenopus tropicalis37.938e-87 306
LLPS-Leo-2488Lepisosteus oculatus37.887e-89 312
LLPS-Fec-1173Felis catus37.836e-89 313
LLPS-Orl-3593Oryzias latipes37.82e-86 305
LLPS-Tar-3912Takifugu rubripes37.668e-88 309
LLPS-Scm-0471Scophthalmus maximus37.532e-85 302
LLPS-Gas-1261Galdieria sulphuraria37.233e-170 531
LLPS-Nef-1410Neosartorya fischeri36.971e-71 250
LLPS-Bot-2514Bos taurus36.885e-90 315
LLPS-Asc-1035Aspergillus clavatus36.637e-70 245
LLPS-Aim-1045Ailuropoda melanoleuca36.614e-91 318
LLPS-Cae-1134Caenorhabditis elegans36.581e-90 317
LLPS-Mal-1235Mandrillus leucophaeus36.578e-75 270
LLPS-Asfu-0145Aspergillus fumigatus36.558e-71 248
LLPS-Urm-1841Ursus maritimus36.556e-91 318
LLPS-Gaa-2275Gasterosteus aculeatus36.364e-80 286
LLPS-Tum-0114Tuber melanosporum36.253e-67 238
LLPS-Mup-3605Mustela putorius furo36.134e-51 197
LLPS-Yal-0941Yarrowia lipolytica36.066e-67 237
LLPS-Ran-2578Rattus norvegicus36.055e-77 277
LLPS-Caf-4401Canis familiaris36.01e-89 313
LLPS-Aso-0055Aspergillus oryzae35.922e-71 250
LLPS-Asf-0577Aspergillus flavus35.922e-71 250
LLPS-Cii-0635Ciona intestinalis35.864e-66 235
LLPS-Zyt-1496Zymoseptoria tritici35.832e-73 255
LLPS-Drm-2125Drosophila melanogaster35.673e-86 305
LLPS-Mel-0105Melampsora laricipopulina35.563e-54 206
LLPS-Gog-4376Gorilla gorilla35.544e-75 271
LLPS-Phn-1245Phaeosphaeria nodorum35.512e-64 230
LLPS-Aon-4530Aotus nancymaae35.43e-73 266
LLPS-Asn-0521Aspergillus nidulans35.297e-66 234
LLPS-Pyt-1260Pyrenophora teres35.286e-68 240
LLPS-Pug-1132Puccinia graminis35.237e-65 238
LLPS-Kop-0453Komagataella pastoris35.171e-66 236
LLPS-Asni-1178Aspergillus niger35.023e-69 244
LLPS-Coo-0725Colletotrichum orbiculare34.991e-65 233
LLPS-Pytr-1295Pyrenophora triticirepentis34.869e-69 243
LLPS-Asg-1155Ashbya gossypii34.858e-62 222
LLPS-Scp-0234Schizosaccharomyces pombe34.812e-69 244
LLPS-Lem-1525Leptosphaeria maculans34.86e-69 243
LLPS-Cogr-0792Colletotrichum graminicola34.741e-58 213
LLPS-Beb-1185Beauveria bassiana34.676e-58 211
LLPS-Blg-0145Blumeria graminis34.669e-62 222
LLPS-Fus-0046Fusarium solani34.661e-64 231
LLPS-Cog-0652Colletotrichum gloeosporioides34.613e-67 237
LLPS-Sac-0209Saccharomyces cerevisiae34.468e-64 228
LLPS-Nec-1096Neurospora crassa34.12e-69 244
LLPS-Dos-1377Dothistroma septosporum34.038e-69 243
LLPS-Scc-1050Schizosaccharomyces cryophilus33.972e-64 230
LLPS-Scj-1539Schizosaccharomyces japonicus33.952e-65 233
LLPS-Map-0517Magnaporthe poae33.547e-61 220
LLPS-Mao-1618Magnaporthe oryzae33.541e-64 230
LLPS-Ora-3254Ornithorhynchus anatinus33.337e-59 223
LLPS-Trr-1071Trichoderma reesei33.266e-61 220
LLPS-Abg-1606Absidia glauca33.122e-63 227
LLPS-Anc-0753Anolis carolinensis33.114e-143 459
LLPS-Gag-1501Gaeumannomyces graminis32.992e-58 213
LLPS-Ast-1170Aspergillus terreus32.991e-55 205
LLPS-Put-0051Puccinia triticina32.775e-58 216
LLPS-Usm-0092Ustilago maydis32.675e-55 209
LLPS-Trv-1209Trichoderma virens32.628e-56 206
LLPS-Spr-0597Sporisorium reilianum32.47e-54 206
LLPS-Crn-1186Cryptococcus neoformans32.391e-54 208
LLPS-Fuv-0400Fusarium verticillioides32.351e-55 205
LLPS-Fuo-1432Fusarium oxysporum32.359e-56 206
LLPS-Miv-1340Microbotryum violaceum31.871e-57 217
LLPS-Ved-0176Verticillium dahliae30.81e-54 201