• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Brn-2789
BnaA05g31040D

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: BnaA05g31040D protein
Gene Name: BnaA05g31040D, GSBRNA2T00027091001
Ensembl Gene: GSBRNA2T00120068001
Ensembl Protein: CDY05249
Organism: Brassica napus
Taxa ID: 3708
LLPS Type: Regulator


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Stress granulePredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblCDY05249CDY05249
UniProtA0A078GDU2, A0A078GDU2_BRANA
GeneBankLK032162CDY24705.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MAFKPFGKDV  GPAMSSKPSS  FTTFGASDPT  QSTSDSPIQP  PTYQNHSGYA  GRSFGPGGIQ  60
61    SGPPIQRAPS  PSASQNPSPS  GGYSSPAMNR  TSPPVAFQNP  SHSSGQSYRP  GGTQRSPGPV  120
121   NVHWGPEAFP  RPIPSVRPYQ  FPGVQRSYNS  SRKTEQGLAE  CYRPTLNPQF  GHDESRNFQK  180
181   DHSERSLATS  SASTSHTLSR  SGTDVVEIGR  SQDSKRKSRS  DVLPDRSLGV  SRRNHSPGSG  240
241   FGIGRLVDDF  QQSSSQTWIR  SPSSADNNPV  RSRINPNRLI  HQEQSPSSSF  PYAHEAAEIQ  300
301   EATKRKSSAI  APSDSFLHNN  PVFSQDDTRR  SSTSPPGTKS  FMLSRSSDSQ  FTGQSPLSPP  360
361   FYPVEDDIQG  NSFLSQSFTE  GEEQARAKRL  ARFKGELDPV  PARPESNRDV  LKGDALSDFE  420
421   SSEQPSLIVG  LCPDMCPESE  RGEREKKGDL  DHYERVDGDR  NQTSKSLAVK  KYTRTAEREA  480
481   ILIRPMPILQ  NTMEYLLSYR  PYNENFLGMY  NFLWDRMRAI  RMDLRMQHIF  NREAITLLEQ  540
541   MIRLHIIAMH  ELCEYTKGEG  FSEGFDAHLN  IEQMNKTSVE  LFQMYDDHRK  GGTTIPTEKE  600
601   FRGYYALLKL  DKHPGYKVEP  SELSLDLANM  TPEIRQTSEV  LFARSVARAG  RTGNFIAFFR  660
661   LARKASYLQA  CLMHAHFSRL  RTHALTSLHA  GLLNNQGLPV  SDTSKWIGME  EEDIEALLEY  720
721   HGFSIKVFEE  PYMVKANKGY  QQETPPPQSL  KKQTSLRLVD  KVMTDSKTSL  LLEEDKPVRT  780
781   SVINPVRPSD  VKPAVDQQNR  NHFTPAGEFH  SPGFPQAESL  NLKKQPNGGH  TSTSPAEIKF  840
841   PFAEHMQTNL  VPGSILQQKS  PTRVENISAL  EESVPEAAMT  VTLEEGFDDI  EQEDEDGHED  900
901   ITSQYEEEVA  KAKLKLIIRL  WKRWSSRQSE  LRERRQLAAA  AALNSLTLGT  PIRLSKTDRA  960
961   CGEFDIDQAM  KRRFEEREKS  WSRLNISDVV  ADILVERNPD  SKCIWWKVIL  CTQIKSVDSS  1020
1021  SQDTHSAASR  WLSSKLIPDT  EHSISDDNLL  FSSPGVSVWN  KWVASGSDSD  SRCCLSVARD  1080
1081  VEADNDPRGA  SAVLFLASKS  IPLNLQREHL  NRILESVPNR  SLLPLLVLTS  SSNGESQASP  1140
1141  SFLSLITPRR  DTKFVFSAIR  G  1161
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGCGTTTA  AGCCTTTCGG  GAAAGATGTA  GGACCGGCGA  TGAGCTCCAA  GCCGTCGTCG  60
61    TTTACAACGT  TCGGCGCTTC  TGATCCTACT  CAATCCACCA  GTGATTCTCC  GATTCAGCCA  120
121   CCGACATATC  AAAACCATTC  AGGGTATGCA  GGACGATCTT  TTGGACCAGG  TGGTATTCAA  180
181   AGTGGTCCTC  CAATCCAGCG  AGCACCGTCT  CCTTCAGCTT  CTCAAAACCC  TTCACCCTCT  240
241   GGTGGTTACT  CTAGTCCTGC  AATGAATCGA  ACATCACCAC  CTGTGGCTTT  TCAAAATCCC  300
301   TCACACTCCT  CAGGACAATC  TTACCGACCT  GGTGGAACTC  AGAGGAGCCC  CGGACCTGTC  360
361   AATGTACATT  GGGGTCCAGA  AGCTTTTCCA  CGCCCAATCC  CCTCTGTGAG  ACCTTACCAA  420
421   TTTCCTGGAG  TTCAGAGATC  GTATAATAGC  AGTAGGAAGA  CAGAGCAGGG  TTTGGCGGAG  480
481   TGCTACAGGC  CTACTTTAAA  TCCTCAGTTT  GGGCATGATG  AATCTAGGAA  TTTCCAAAAG  540
541   GATCATAGTG  AACGTAGTCT  AGCCACGTCT  TCAGCTAGTA  CATCACACAC  TCTTTCCAGA  600
601   AGTGGAACTG  ATGTTGTTGA  GATTGGTCGA  TCACAAGATT  CAAAAAGGAA  AAGTCGTTCA  660
661   GATGTTCTTC  CTGATCGGAG  TTTAGGGGTT  TCTCGAAGAA  ACCATTCGCC  AGGATCAGGT  720
721   TTTGGGATTG  GCAGATTGGT  AGATGATTTC  CAGCAGTCAT  CTAGTCAAAC  TTGGATACGC  780
781   TCTCCCTCTT  CCGCGGACAA  TAATCCGGTG  AGGTCGAGGA  TCAATCCCAA  TCGGTTGATC  840
841   CATCAGGAAC  AGAGCCCAAG  CTCTTCATTC  CCTTATGCAC  ATGAAGCAGC  TGAAATCCAG  900
901   GAAGCCACAA  AAAGAAAATC  TTCGGCTATA  GCACCTTCTG  ATAGTTTTCT  TCACAACAAC  960
961   CCTGTATTTT  CTCAAGATGA  TACTCGAAGG  TCATCGACAT  CTCCTCCTGG  CACAAAGTCA  1020
1021  TTTATGCTTT  CAAGAAGCTC  AGATTCCCAA  TTTACTGGGC  AGTCTCCTCT  ATCTCCACCT  1080
1081  TTTTATCCAG  TGGAGGATGA  TATCCAGGGA  AACTCTTTTC  TTTCTCAAAG  CTTTACTGAA  1140
1141  GGAGAAGAGC  AAGCCAGGGC  AAAGAGACTG  GCCCGCTTCA  AGGGTGAACT  GGACCCTGTT  1200
1201  CCAGCCCGAC  CTGAATCAAA  TAGGGATGTC  CTCAAGGGAG  ATGCTTTGTC  TGATTTTGAA  1260
1261  AGCTCGGAGC  AGCCTTCTCT  TATCGTTGGA  TTATGCCCTG  ACATGTGTCC  TGAGTCAGAA  1320
1321  CGGGGGGAGC  GTGAAAAGAA  GGGTGACTTG  GACCATTATG  AGCGTGTGGA  TGGAGATAGG  1380
1381  AACCAGACGA  GCAAATCCCT  TGCTGTGAAG  AAATATACCA  GGACGGCGGA  GCGAGAAGCC  1440
1441  ATTTTGATAC  GACCCATGCC  AATCCTGCAG  AATACTATGG  AATATTTGCT  GAGTTACCGC  1500
1501  CCTTACAATG  AAAACTTTCT  TGGCATGTAT  AATTTCCTAT  GGGATAGGAT  GAGAGCTATT  1560
1561  CGAATGGATC  TAAGAATGCA  ACATATATTC  AACCGAGAAG  CTATTACTTT  ACTGGAGCAA  1620
1621  ATGATAAGAC  TTCACATCAT  TGCAATGCAT  GAGCTATGTG  AATATACTAA  AGGAGAGGGC  1680
1681  TTTTCGGAGG  GGTTTGATGC  ACACCTGAAT  ATTGAGCAGA  TGAACAAGAC  ATCTGTTGAG  1740
1741  TTGTTTCAAA  TGTATGATGA  TCACAGGAAG  GGAGGAACAA  CTATTCCTAC  AGAAAAAGAG  1800
1801  TTCCGTGGCT  ATTATGCTCT  TCTCAAACTC  GACAAGCACC  CTGGCTACAA  GGTTGAACCG  1860
1861  TCTGAGCTTT  CTCTTGATCT  TGCCAACATG  ACTCCAGAAA  TAAGGCAAAC  TTCAGAAGTT  1920
1921  CTCTTTGCCC  GCAGTGTAGC  CAGAGCTGGT  AGAACTGGCA  ACTTCATTGC  CTTCTTTCGC  1980
1981  CTCGCACGAA  AAGCAAGTTA  TCTTCAAGCA  TGTCTAATGC  ATGCTCATTT  TTCAAGGCTA  2040
2041  AGAACTCATG  CGCTTACTTC  TCTGCACGCG  GGTCTCCTAA  ATAATCAGGG  TCTCCCAGTT  2100
2101  TCAGATACTT  CAAAGTGGAT  AGGGATGGAG  GAAGAGGACA  TAGAAGCCCT  GCTGGAGTAC  2160
2161  CATGGATTTT  CGATAAAAGT  GTTTGAAGAG  CCATACATGG  TAAAGGCAAA  TAAAGGATAT  2220
2221  CAACAGGAAA  CACCGCCTCC  TCAAAGTCTT  AAGAAACAAA  CATCACTGCG  TCTAGTTGAT  2280
2281  AAAGTAATGA  CCGATTCCAA  GACTTCCCTC  TTACTGGAGG  AGGACAAGCC  AGTGAGGACA  2340
2341  TCTGTTATAA  ATCCAGTGCG  GCCATCTGAT  GTAAAACCAG  CAGTAGATCA  ACAAAACCGA  2400
2401  AATCACTTTA  CACCGGCTGG  TGAATTTCAT  TCTCCTGGAT  TTCCTCAAGC  TGAATCCTTG  2460
2461  AATTTGAAGA  AACAACCTAA  TGGCGGCCAC  ACTAGTACAT  CTCCCGCGGA  AATTAAATTT  2520
2521  CCATTTGCAG  AGCATATGCA  AACGAATCTT  GTGCCCGGTT  CTATTTTGCA  ACAAAAGTCT  2580
2581  CCAACGCGTG  TAGAAAACAT  ATCTGCTTTG  GAAGAATCAG  TACCTGAAGC  TGCGATGACT  2640
2641  GTTACCTTGG  AAGAGGGTTT  CGATGACATT  GAACAGGAAG  ACGAGGATGG  ACATGAGGAC  2700
2701  ATCACAAGTC  AGTATGAAGA  GGAAGTGGCG  AAGGCTAAGC  TCAAGTTGAT  CATAAGATTA  2760
2761  TGGAAGCGGT  GGTCTTCACG  TCAAAGTGAA  TTGCGGGAGC  GTCGACAGTT  AGCTGCAGCT  2820
2821  GCTGCACTGA  ATTCTCTAAC  CCTGGGCACT  CCTATCCGAC  TCAGCAAAAC  TGATAGGGCG  2880
2881  TGCGGTGAGT  TTGACATTGA  TCAAGCGATG  AAGAGGAGAT  TTGAAGAACG  GGAAAAATCA  2940
2941  TGGTCAAGGC  TGAATATTTC  AGATGTGGTT  GCTGATATAT  TAGTCGAAAG  GAATCCTGAC  3000
3001  TCAAAATGCA  TATGGTGGAA  GGTCATCCTA  TGTACTCAGA  TTAAATCAGT  TGACTCATCA  3060
3061  AGTCAAGATA  CACATTCAGC  AGCCAGTCGA  TGGTTATCAT  CAAAGCTTAT  CCCTGACACA  3120
3121  GAACATAGTA  TCTCCGATGA  TAATCTACTG  TTTTCATCTC  CCGGTGTGTC  GGTATGGAAT  3180
3181  AAATGGGTTG  CAAGTGGGTC  TGATTCAGAT  TCCAGATGCT  GTCTCTCAGT  AGCTAGGGAT  3240
3241  GTAGAAGCTG  ATAATGATCC  ACGTGGTGCA  AGTGCAGTTC  TCTTCCTTGC  ATCTAAAAGC  3300
3301  ATCCCTCTGA  ATCTCCAGAG  AGAACATCTT  AACCGCATTC  TCGAATCAGT  ACCTAACCGT  3360
3361  TCACTCCTTC  CCCTTCTCGT  TCTAACCAGC  TCAAGCAATG  GAGAAAGCCA  AGCTTCACCG  3420
3421  TCGTTTCTAT  CGCTAATTAC  TCCCAGAAGG  GACACGAAGT  TCGTTTTTTC  AGCGATTCGC  3480
3481  GGCTAA  3486

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Brr-2883Brassica rapa82.830.01865
LLPS-Bro-1978Brassica oleracea70.860.01515
LLPS-Arl-2198Arabidopsis lyrata69.130.01523
LLPS-Art-2475Arabidopsis thaliana67.060.01437
LLPS-Mua-0413Musa acuminata66.023e-177 562
LLPS-Sob-0261Sorghum bicolor63.552e-162 533
LLPS-Ori-0294Oryza indica62.654e-162 529
LLPS-Orni-1888Oryza nivara62.658e-161 530
LLPS-Orm-1697Oryza meridionalis62.657e-161 530
LLPS-Orr-0861Oryza rufipogon62.658e-161 530
LLPS-Orgl-1702Oryza glumaepatula62.411e-159 526
LLPS-Tra-2749Triticum aestivum62.262e-159 525
LLPS-Cus-1873Cucumis sativus61.970.0 597
LLPS-Tru-0539Triticum urartu61.889e-161 526
LLPS-Lep-0004Leersia perrieri61.544e-167 545
LLPS-Orp-1746Oryza punctata61.292e-164 540
LLPS-Brd-0031Brachypodium distachyon61.252e-160 528
LLPS-Orb-0053Oryza barthii60.561e-161 530
LLPS-Org-2231Oryza glaberrima60.561e-160 529
LLPS-Prp-2361Prunus persica60.040.0 581
LLPS-Thc-2473Theobroma cacao58.810.0 610
LLPS-Zem-2111Zea mays58.31e-154 513
LLPS-Gor-1315Gossypium raimondii57.760.0 586
LLPS-Vir-1622Vigna radiata51.460.0 730
LLPS-Via-0947Vigna angularis51.390.0 726
LLPS-Amt-1775Amborella trichopoda51.060.0 663
LLPS-Glm-1996Glycine max50.780.0 738
LLPS-Sei-2294Setaria italica50.595e-162 532
LLPS-Coc-2102Corchorus capsularis50.390.0 758
LLPS-Phv-1960Phaseolus vulgaris50.360.0 717
LLPS-Viv-1007Vitis vinifera49.950.0 781
LLPS-Dac-0008Daucus carota49.820.0 725
LLPS-Hea-2238Helianthus annuus48.610.0 677
LLPS-Mae-2436Manihot esculenta48.40.0 779
LLPS-Met-0009Medicago truncatula47.490.0 736
LLPS-Sem-0728Selaginella moellendorffii40.626e-152 496
LLPS-Rhb-3336Rhinopithecus bieti39.271e-28 129
LLPS-Gog-0052Gorilla gorilla38.811e-43 178
LLPS-Nol-0172Nomascus leucogenys38.812e-43 177
LLPS-Hos-4004Homo sapiens38.811e-43 178
LLPS-Mup-3484Mustela putorius furo38.435e-44 179
LLPS-Paa-3803Papio anubis38.061e-43 177
LLPS-Mal-0740Mandrillus leucophaeus38.061e-43 177
LLPS-Cea-3802Cercocebus atys38.061e-43 178
LLPS-Maf-4607Macaca fascicularis38.061e-43 178
LLPS-Mam-1130Macaca mulatta38.061e-43 178
LLPS-Poa-3088Pongo abelii38.062e-43 177
LLPS-Man-0563Macaca nemestrina38.066e-44 179
LLPS-Pap-0848Pan paniscus38.061e-43 178
LLPS-Pat-3265Pan troglodytes38.061e-43 178
LLPS-Php-1648Physcomitrella patens37.52e-53 202
LLPS-Sus-2212Sus scrofa37.411e-42 174
LLPS-Bot-3679Bos taurus37.279e-42 172
LLPS-Orbr-1103Oryza brachyantha36.721e-46 178
LLPS-Xet-2457Xenopus tropicalis36.367e-43 175
LLPS-Lac-0331Latimeria chalumnae36.013e-42 173
LLPS-Anc-2575Anolis carolinensis35.928e-46 185
LLPS-Meg-2202Meleagris gallopavo35.922e-44 180
LLPS-Dar-1073Danio rerio35.661e-41 172
LLPS-Myl-1122Myotis lucifugus35.63e-44 180
LLPS-Gaa-1815Gasterosteus aculeatus35.521e-42 174
LLPS-Pot-1587Populus trichocarpa35.494e-50 189
LLPS-Mum-3480Mus musculus35.287e-44 179
LLPS-Anp-2300Anas platyrhynchos35.287e-44 178
LLPS-Mea-2374Mesocricetus auratus34.957e-44 179
LLPS-Urm-3053Ursus maritimus34.953e-43 176
LLPS-Fia-3726Ficedula albicollis34.951e-43 177
LLPS-Otg-3519Otolemur garnettii34.953e-42 173
LLPS-Hov-0558Hordeum vulgare34.753e-43 169
LLPS-Fec-3785Felis catus34.637e-44 179
LLPS-Pes-3289Pelodiscus sinensis34.634e-42 173
LLPS-Ova-2900Ovis aries34.521e-41 171
LLPS-Aim-4403Ailuropoda melanoleuca34.35e-43 176
LLPS-Ran-2952Rattus norvegicus34.37e-44 179
LLPS-Cap-4536Cavia porcellus34.31e-42 175
LLPS-Caf-2593Canis familiaris34.35e-43 176
LLPS-Tag-0920Taeniopygia guttata34.34e-42 173
LLPS-Ict-2972Ictidomys tridecemlineatus34.33e-43 176
LLPS-Cas-2687Carlito syrichta34.35e-44 179
LLPS-Dio-2550Dipodomys ordii33.986e-44 179
LLPS-Caj-3919Callithrix jacchus33.982e-41 171
LLPS-Fud-3055Fukomys damarensis33.986e-42 172
LLPS-Eqc-0228Equus caballus33.981e-42 175
LLPS-Orc-3302Oryctolagus cuniculus33.982e-43 177
LLPS-Gas-1215Galdieria sulphuraria33.871e-38 161
LLPS-Tar-1752Takifugu rubripes33.646e-43 176
LLPS-Mod-1280Monodelphis domestica33.562e-40 166
LLPS-Ora-1706Ornithorhynchus anatinus33.551e-38 162
LLPS-Orl-0592Oryzias latipes33.534e-42 173
LLPS-Spr-0767Sporisorium reilianum33.532e-28 129
LLPS-Nia-2164Nicotiana attenuata33.434e-41 162
LLPS-Sah-4036Sarcophilus harrisii33.332e-42 174
LLPS-Cym-1002Cyanidioschyzon merolae33.337e-31 136
LLPS-Sot-1070Solanum tuberosum33.129e-42 164
LLPS-Scf-2651Scleropages formosus33.011e-41 172
LLPS-Leo-2294Lepisosteus oculatus32.841e-44 181
LLPS-Asm-0995Astyanax mexicanus32.81e-41 171
LLPS-Icp-0674Ictalurus punctatus32.583e-42 173
LLPS-Asfu-1357Aspergillus fumigatus32.311e-25 119
LLPS-Chc-0238Chondrus crispus31.791e-35 151
LLPS-Zyt-0915Zymoseptoria tritici31.656e-22 103
LLPS-Aso-1346Aspergillus oryzae31.62e-23 108
LLPS-Osl-1256Ostreococcus lucimarinus31.591e-52 206
LLPS-Sol-1460Solanum lycopersicum31.582e-39 158
LLPS-Beb-1323Beauveria bassiana31.562e-24 115
LLPS-Usm-1513Ustilago maydis31.531e-24 116
LLPS-Scm-1043Scophthalmus maximus31.446e-42 172
LLPS-Asn-1451Aspergillus nidulans31.422e-27 125
LLPS-Asc-0444Aspergillus clavatus31.46e-26 120
LLPS-Dos-1481Dothistroma septosporum31.122e-21 102
LLPS-Cae-1604Caenorhabditis elegans30.679e-27 122
LLPS-Asni-1492Aspergillus niger30.672e-27 125
LLPS-Ast-1560Aspergillus terreus30.664e-23 111
LLPS-Nef-1376Neosartorya fischeri30.611e-26 122
LLPS-Drm-0360Drosophila melanogaster30.482e-26 121
LLPS-Sac-0065Saccharomyces cerevisiae30.459e-22 106
LLPS-Pug-1217Puccinia graminis30.381e-25 119
LLPS-Miv-1486Microbotryum violaceum30.264e-28 127
LLPS-Xim-2812Xiphophorus maculatus30.254e-42 173
LLPS-Pof-1922Poecilia formosa30.144e-42 173
LLPS-Mel-0273Melampsora laricipopulina30.137e-1890.5
LLPS-Scj-1444Schizosaccharomyces japonicus30.031e-30 135
LLPS-Tum-1547Tuber melanosporum29.622e-25 119
LLPS-Asf-1578Aspergillus flavus29.533e-24 114
LLPS-Pyt-1508Pyrenophora teres29.451e-20 103
LLPS-Pytr-1617Pyrenophora triticirepentis29.251e-20 103
LLPS-Coo-1122Colletotrichum orbiculare29.212e-1896.3
LLPS-Put-1105Puccinia triticina29.183e-26 120
LLPS-Crn-1248Cryptococcus neoformans29.02e-1173.2
LLPS-Abg-0642Absidia glauca28.858e-23 110
LLPS-Cogr-1332Colletotrichum graminicola28.774e-20 101
LLPS-Scp-0900Schizosaccharomyces pombe28.752e-28 127
LLPS-Scc-1247Schizosaccharomyces cryophilus28.612e-31 137
LLPS-Trr-0542Trichoderma reesei28.377e-1997.4
LLPS-Fus-1227Fusarium solani28.321e-21 106
LLPS-Cog-1458Colletotrichum gloeosporioides28.281e-1896.3
LLPS-Fuv-1512Fusarium verticillioides28.225e-21 104
LLPS-Fuo-1448Fusarium oxysporum28.223e-21 104
LLPS-Trv-1344Trichoderma virens28.034e-1893.6
LLPS-Phn-1009Phaeosphaeria nodorum27.696e-1894.4
LLPS-Yal-0258Yarrowia lipolytica27.339e-1893.6
LLPS-Nec-1138Neurospora crassa27.227e-23 110
LLPS-Lem-1226Leptosphaeria maculans27.071e-1999.8
LLPS-Kop-0249Komagataella pastoris26.736e-1790.9
LLPS-Mao-0521Magnaporthe oryzae26.656e-1274.7
LLPS-Ved-1393Verticillium dahliae26.591e-1792.8
LLPS-Orn-0319Oreochromis niloticus26.221e-1892.8
LLPS-Chs-0309Chlorocebus sabaeus25.995e-1067.4
LLPS-Tut-0908Tursiops truncatus25.783e-0861.2
LLPS-Loa-0978Loxodonta africana25.481e-0656.6
LLPS-Asg-1049Ashbya gossypii24.746e-1997.8
LLPS-Blg-0409Blumeria graminis24.654e-1791.7
LLPS-Ten-1136Tetraodon nigroviridis23.873e-1582.8