• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Brn-1899
BnaC09g40690D

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: BnaC09g40690D protein
Gene Name: BnaC09g40690D, GSBRNA2T00094865001
Ensembl Gene: GSBRNA2T00094865001
Ensembl Protein: CDY16942
Organism: Brassica napus
Taxa ID: 3708
LLPS Type: LLPS regulator


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Nucleolus, P-bodyPredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblCDY16942CDY16942
UniProtA0A078FW05, A0A078FW05_BRANA
GeneBankLK032068CDY16942.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MADGEIQFLR  GYELRLLRCT  VSIPSSDSPP  EIHLLDESQS  ETHPHDSLIK  SLLSLIEAGD  60
61    YLGALASDAA  RVILGDAELE  LVDSVESAER  VYSEVLDKVE  SFVVNDSSDE  IDKARRAVVV  120
121   MCLAISSAFW  FTRCNLTGPT  DGSVKCSLPF  KVSESKELVE  WENWAKIQLM  SAGSDLLGKF  180
181   SNLQHLVFAR  MLLLKLKDLL  FETTATQTFE  LRSVSWWLVR  VLLIHQRVLH  ERSSSLFEML  240
241   QVYMAEALDH  FGALEKVESY  WSTMLLQGEV  SSLTSTIHLE  ACVLQYIYGR  IDPCRLQLES  300
301   AKAASNLEFS  VSGAFGFRTI  HQVDPKAQMV  LIAKTSSSNG  DVMLASSKAD  VGPYEAWGVE  360
361   APEVYMTPKL  VNDESESGKD  SATLKPVEQA  MILAQCLLIE  RGSRHNEMQR  WDMAPYIEAI  420
421   DSQKSSYFVL  RRFCDLLRVR  WESTRGRTKG  RALEMMGKLV  EAINKSDPGA  SQRIPLCYAV  480
481   HLPTIPALRK  EYGELLVSCG  LVGEAITIFE  SLELWDNLIN  CYCLLGKKSA  AVDLINAQLS  540
541   ERPNDPRLWC  SLGDVTIDDS  CYEKALEVSN  DKSVRAKRAL  ARSAYNRGDF  EKSKMLWYAA  600
601   MALNSLYPDG  WFALGAAALK  ARDVQKALDS  FTFAVQLDPD  NGEAWNNIAC  LHMIKKKSKE  660
661   SFIAFKEALK  FKRDSWQMWE  NFSHVAMDVG  NIDQAFEAIQ  KILSMSKNKR  VDVVLLDRIM  720
721   TELENRNSAS  SLSVETEASS  DESTESKPRA  ATPAETQRHL  ELLGKIIQQI  VRTESTSEIW  780
781   GLYARWSRIK  GDLMVCSEAL  LKQVRSYQGS  ELWKDKERFK  KFARASLELC  RVYMEISLST  840
841   GSKRELFSAE  MHLRNTIKQA  TVSFPESEEL  KKLESCLEEV  RNALKKCEET  TNTKT  895
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGCCGACG  GCGAAATTCA  ATTCCTACGC  GGTTACGAGC  TCCGTCTCCT  CCGATGCACC  60
61    GTATCTATCC  CCTCCTCGGA  TTCTCCTCCC  GAGATCCATT  TGCTCGACGA  ATCCCAATCC  120
121   GAAACCCATC  CACACGACTC  TCTTATAAAG  TCTCTCTTGT  CCTTGATCGA  AGCTGGAGAC  180
181   TACCTCGGAG  CTCTGGCCTC  GGACGCTGCT  AGGGTAATAC  TCGGCGACGC  CGAGCTGGAA  240
241   CTAGTTGACT  CGGTTGAATC  GGCGGAACGA  GTTTACTCCG  AGGTTCTCGA  CAAGGTCGAG  300
301   TCCTTCGTGG  TGAACGATTC  GTCGGATGAA  ATCGATAAGG  CTCGCCGTGC  TGTTGTGGTG  360
361   ATGTGCTTAG  CAATCTCGTC  TGCGTTTTGG  TTCACTCGCT  GTAATTTGAC  GGGGCCGACA  420
421   GATGGATCAG  TGAAATGTTC  GTTGCCGTTT  AAAGTATCAG  AAAGTAAGGA  GTTAGTTGAA  480
481   TGGGAGAACT  GGGCAAAGAT  TCAGCTCATG  TCTGCTGGCT  CTGACTTGCT  TGGGAAGTTT  540
541   TCAAATCTTC  AGCACTTAGT  TTTTGCTAGG  ATGCTTCTGT  TGAAGTTGAA  AGATTTGCTG  600
601   TTCGAGACAA  CTGCAACCCA  AACATTTGAA  CTAAGGAGTG  TTTCATGGTG  GCTTGTCAGA  660
661   GTTCTACTTA  TTCATCAGAG  AGTTCTACAC  GAGCGATCTT  CATCTTTGTT  TGAGATGTTG  720
721   CAAGTCTATA  TGGCTGAAGC  TCTTGACCAT  TTTGGAGCCT  TGGAGAAAGT  TGAAAGCTAT  780
781   TGGTCTACCA  TGTTGCTACA  AGGCGAAGTT  TCATCCTTAA  CCTCAACCAT  ACATCTGGAA  840
841   GCATGTGTGC  TGCAGTATAT  TTATGGACGG  ATTGATCCCT  GTCGGTTACA  GCTTGAATCT  900
901   GCTAAAGCAG  CATCAAACCT  CGAGTTCTCT  GTTAGTGGGG  CTTTTGGATT  TCGTACGATT  960
961   CACCAAGTCG  ACCCAAAGGC  ACAAATGGTA  TTGATAGCCA  AAACTAGTTC  ATCCAATGGG  1020
1021  GACGTGATGT  TGGCCTCTAG  TAAAGCTGAT  GTTGGACCTT  ATGAGGCTTG  GGGAGTTGAA  1080
1081  GCACCTGAAG  TATACATGAC  TCCCAAACTA  GTGAACGACG  AGAGTGAATC  TGGCAAAGAT  1140
1141  TCTGCGACCT  TAAAACCAGT  CGAACAGGCA  ATGATTTTGG  CTCAGTGCCT  TTTAATTGAA  1200
1201  CGAGGTAGTC  GGCACAATGA  GATGCAAAGA  TGGGATATGG  CTCCATATAT  TGAGGCGATT  1260
1261  GATTCTCAAA  AGTCATCATA  TTTTGTTCTA  CGGCGTTTCT  GTGACTTACT  ACGTGTCCGG  1320
1321  TGGGAATCAA  CTCGGGGTCG  TACAAAGGGA  CGCGCCCTGG  AGATGATGGG  TAAACTGGTT  1380
1381  GAAGCTATCA  ACAAGAGCGA  TCCTGGAGCA  TCACAAAGAA  TCCCTTTATG  CTACGCAGTC  1440
1441  CATCTCCCCA  CCATTCCTGC  TTTAAGAAAG  GAATACGGTG  AGCTACTGGT  GAGTTGCGGT  1500
1501  TTGGTTGGGG  AAGCAATCAC  AATATTTGAG  AGCCTGGAGT  TGTGGGACAA  TCTAATTAAC  1560
1561  TGCTACTGCC  TTCTGGGAAA  GAAATCAGCG  GCTGTAGATC  TCATCAATGC  GCAGCTTTCT  1620
1621  GAGCGGCCAA  ATGACCCAAG  ATTATGGTGT  TCACTTGGTG  ATGTTACGAT  TGATGACTCA  1680
1681  TGTTATGAAA  AAGCCCTGGA  AGTGTCAAAT  GATAAGTCAG  TTCGTGCTAA  GCGCGCTCTT  1740
1741  GCTCGTAGCG  CATACAATCG  CGGTGATTTT  GAGAAGTCAA  AGATGTTGTG  GTATGCTGCA  1800
1801  ATGGCGTTGA  ATTCTCTGTA  CCCGGATGGT  TGGTTTGCTC  TTGGTGCTGC  TGCGTTGAAG  1860
1861  GCCAGGGATG  TTCAAAAGGC  ACTCGATTCA  TTTACTTTTG  CTGTTCAACT  CGATCCTGAC  1920
1921  AATGGAGAGG  CCTGGAACAA  CATTGCTTGT  CTGCATATGA  TTAAGAAGAA  GAGCAAAGAA  1980
1981  TCATTCATCG  CATTCAAAGA  AGCGCTTAAA  TTCAAGCGAG  ATAGCTGGCA  GATGTGGGAG  2040
2041  AACTTCAGCC  ATGTAGCTAT  GGATGTGGGA  AATATTGATC  AGGCCTTTGA  AGCTATACAA  2100
2101  AAGATACTGA  GCATGAGCAA  AAACAAGAGG  GTTGATGTTG  TTTTACTGGA  CCGTATAATG  2160
2161  ACAGAGTTAG  AAAATAGGAA  TTCAGCATCG  TCTTTATCGG  TTGAAACTGA  AGCTTCTTCT  2220
2221  GATGAATCAA  CGGAGTCAAA  ACCGCGTGCT  GCAACACCAG  CTGAAACTCA  GCGTCACTTA  2280
2281  GAGTTGCTTG  GGAAGATTAT  TCAGCAGATT  GTCCGAACAG  AAAGTACATC  TGAAATATGG  2340
2341  GGATTGTATG  CAAGATGGAG  TAGAATCAAA  GGAGATCTTA  TGGTATGCAG  CGAGGCATTG  2400
2401  CTGAAACAAG  TGCGCTCATA  TCAGGGATCA  GAACTGTGGA  AAGACAAAGA  GCGTTTCAAG  2460
2461  AAGTTTGCAA  GAGCATCGTT  GGAGCTTTGC  AGAGTCTACA  TGGAGATCTC  ACTGTCCACA  2520
2521  GGAAGCAAGC  GAGAGCTCTT  TAGTGCTGAG  ATGCATTTGA  GGAACACAAT  CAAACAGGCG  2580
2581  ACAGTGAGCT  TCCCGGAAAG  TGAGGAATTG  AAGAAGCTCG  AAAGTTGCCT  TGAGGAGGTG  2640
2641  AGAAATGCTC  TGAAGAAGTG  TGAAGAGACT  ACAAATACGA  AAACATGA  2688

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Bro-1616Brassica oleracea97.770.01717
LLPS-Brr-1482Brassica rapa96.210.01689
LLPS-Arl-0604Arabidopsis lyrata87.860.01545
LLPS-Art-1487Arabidopsis thaliana86.210.01533
LLPS-Mua-0341Musa acuminata64.782e-136 421
LLPS-Via-1748Vigna angularis61.933e-163 490
LLPS-Gor-0748Gossypium raimondii61.310.01057
LLPS-Prp-0593Prunus persica60.160.01068
LLPS-Coc-0938Corchorus capsularis60.140.01021
LLPS-Thc-0057Theobroma cacao59.350.01041
LLPS-Mae-0355Manihot esculenta58.160.0 762
LLPS-Viv-0224Vitis vinifera57.270.01008
LLPS-Cus-1505Cucumis sativus56.380.0 984
LLPS-Pot-0669Populus trichocarpa55.030.0 955
LLPS-Phv-0194Phaseolus vulgaris54.860.0 904
LLPS-Tru-0262Triticum urartu54.820.0 694
LLPS-Sol-1487Solanum lycopersicum54.650.0 899
LLPS-Glm-1994Glycine max54.040.0 921
LLPS-Met-1594Medicago truncatula53.670.0 954
LLPS-Nia-0551Nicotiana attenuata53.560.0 890
LLPS-Vir-0695Vigna radiata53.17e-147 449
LLPS-Sob-0886Sorghum bicolor52.560.0 771
LLPS-Sei-1860Setaria italica52.165e-74 248
LLPS-Hea-0317Helianthus annuus51.920.0 849
LLPS-Dac-0908Daucus carota51.890.0 607
LLPS-Ors-0584Oryza sativa51.650.0 754
LLPS-Ori-0448Oryza indica50.20.0 717
LLPS-Orni-1235Oryza nivara50.20.0 716
LLPS-Tra-2530Triticum aestivum49.380.0 766
LLPS-Orr-0512Oryza rufipogon49.310.0 675
LLPS-Zem-1550Zea mays49.050.0 761
LLPS-Amt-1771Amborella trichopoda48.250.0 836
LLPS-Brd-0232Brachypodium distachyon48.040.0 760
LLPS-Lep-0339Leersia perrieri47.660.0 737
LLPS-Orp-0089Oryza punctata45.550.0 695
LLPS-Orgl-0730Oryza glumaepatula45.430.0 716
LLPS-Orm-0552Oryza meridionalis44.250.0 664
LLPS-Sem-1966Selaginella moellendorffii42.977e-92 303
LLPS-Php-0123Physcomitrella patens40.440.0 623
LLPS-Beb-0219Beauveria bassiana34.132e-1172.4
LLPS-Chr-0028Chlamydomonas reinhardtii33.624e-80 287
LLPS-Fuv-0915Fusarium verticillioides31.861e-0863.2
LLPS-Ved-0091Verticillium dahliae31.865e-0757.8
LLPS-Fuo-0491Fusarium oxysporum30.976e-0861.2
LLPS-Cym-0411Cyanidioschyzon merolae28.81e-33 144
LLPS-Chc-0141Chondrus crispus28.08e-48 184
LLPS-Osl-0346Ostreococcus lucimarinus27.797e-78 278
LLPS-Usm-0175Ustilago maydis27.361e-20 102
LLPS-Asfu-1200Aspergillus fumigatus27.327e-40 163
LLPS-Icp-3390Ictalurus punctatus27.272e-51 198
LLPS-Abg-1112Absidia glauca27.191e-62 231
LLPS-Sac-0544Saccharomyces cerevisiae26.918e-22 105
LLPS-Nef-0905Neosartorya fischeri26.774e-34 145
LLPS-Asg-0516Ashbya gossypii26.732e-21 105
LLPS-Dio-0692Dipodomys ordii26.568e-58 216
LLPS-Drm-0036Drosophila melanogaster26.54e-0861.6
LLPS-Scj-0515Schizosaccharomyces japonicus26.456e-51 196
LLPS-Scp-1572Schizosaccharomyces pombe26.381e-48 189
LLPS-Asm-0636Astyanax mexicanus26.285e-51 197
LLPS-Cas-1780Carlito syrichta26.152e-56 213
LLPS-Cap-0486Cavia porcellus26.111e-56 214
LLPS-Leo-2337Lepisosteus oculatus25.936e-58 217
LLPS-Orn-0083Oreochromis niloticus25.918e-51 194
LLPS-Ora-2907Ornithorhynchus anatinus25.855e-56 210
LLPS-Cis-1238Ciona savignyi25.843e-46 181
LLPS-Orc-2696Oryctolagus cuniculus25.88e-58 217
LLPS-Scf-1944Scleropages formosus25.797e-0963.9
LLPS-Gaa-0501Gasterosteus aculeatus25.792e-0965.5
LLPS-Scm-0352Scophthalmus maximus25.693e-57 215
LLPS-Crn-0153Cryptococcus neoformans25.671e-44 178
LLPS-Eqc-3729Equus caballus25.666e-55 208
LLPS-Orl-2606Oryzias latipes25.647e-56 211
LLPS-Myl-1240Myotis lucifugus25.63e-58 218
LLPS-Chs-0402Chlorocebus sabaeus25.453e-58 218
LLPS-Aon-0113Aotus nancymaae25.366e-57 214
LLPS-Pat-0898Pan troglodytes25.361e-56 214
LLPS-Pap-1751Pan paniscus25.361e-56 213
LLPS-Scc-0662Schizosaccharomyces cryophilus25.358e-47 184
LLPS-Bot-0830Bos taurus25.346e-0964.3
LLPS-Xim-2432Xiphophorus maculatus25.347e-0964.3
LLPS-Aim-3525Ailuropoda melanoleuca25.346e-0964.3
LLPS-Mup-1187Mustela putorius furo25.346e-0964.3
LLPS-Ova-0901Ovis aries25.346e-0964.3
LLPS-Paa-0172Papio anubis25.346e-0964.3
LLPS-Mal-2811Mandrillus leucophaeus25.346e-0964.3
LLPS-Ran-4374Rattus norvegicus25.345e-0964.7
LLPS-Sus-0665Sus scrofa25.345e-0964.3
LLPS-Sah-1825Sarcophilus harrisii25.346e-0964.3
LLPS-Cea-2433Cercocebus atys25.346e-0964.3
LLPS-Maf-2649Macaca fascicularis25.346e-0964.3
LLPS-Mum-0851Mus musculus25.345e-0964.7
LLPS-Caj-2799Callithrix jacchus25.345e-0964.7
LLPS-Fud-0743Fukomys damarensis25.346e-0964.3
LLPS-Gog-1259Gorilla gorilla25.346e-0964.3
LLPS-Mam-0381Macaca mulatta25.346e-0964.3
LLPS-Poa-0722Pongo abelii25.346e-0964.3
LLPS-Caf-1095Canis familiaris25.346e-0964.3
LLPS-Ict-2707Ictidomys tridecemlineatus25.346e-0964.3
LLPS-Xet-1946Xenopus tropicalis25.343e-0862.4
LLPS-Loa-2516Loxodonta africana25.346e-0964.3
LLPS-Man-0094Macaca nemestrina25.346e-0964.3
LLPS-Fec-1049Felis catus25.346e-0964.3
LLPS-Mod-0520Monodelphis domestica25.345e-0964.3
LLPS-Lac-1934Latimeria chalumnae25.344e-0964.7
LLPS-Hos-1005Homo sapiens25.346e-0964.3
LLPS-Dar-0700Danio rerio25.347e-0963.9
LLPS-Pof-2718Poecilia formosa25.347e-0963.9
LLPS-Urm-1458Ursus maritimus25.346e-0964.3
LLPS-Rhb-2817Rhinopithecus bieti25.346e-0963.9
LLPS-Otg-3012Otolemur garnettii25.345e-0964.7
LLPS-Nol-3365Nomascus leucogenys25.244e-57 215
LLPS-Gas-0439Galdieria sulphuraria25.181e-49 191
LLPS-Cae-0209Caenorhabditis elegans25.151e-33 143
LLPS-Ten-0635Tetraodon nigroviridis24.975e-39 160
LLPS-Tar-1785Takifugu rubripes24.891e-0863.2
LLPS-Tag-1341Taeniopygia guttata24.895e-0861.2
LLPS-Anc-3138Anolis carolinensis24.892e-0862.8
LLPS-Gaga-0471Gallus gallus24.892e-0862.4
LLPS-Anp-0166Anas platyrhynchos24.892e-0862.4
LLPS-Meg-1199Meleagris gallopavo24.892e-0862.4
LLPS-Fia-1439Ficedula albicollis24.895e-0861.2
LLPS-Pes-0504Pelodiscus sinensis24.892e-0862.4
LLPS-Asc-0133Aspergillus clavatus24.462e-32 140
LLPS-Cii-1346Ciona intestinalis24.352e-0759.3
LLPS-Zyt-0751Zymoseptoria tritici24.153e-37 155
LLPS-Mea-0193Mesocricetus auratus24.113e-0655.5
LLPS-Asn-0345Aspergillus nidulans24.051e-27 124
LLPS-Tut-0183Tursiops truncatus23.983e-0862.0
LLPS-Miv-0545Microbotryum violaceum23.891e-28 127
LLPS-Tum-0202Tuber melanosporum23.824e-41 167
LLPS-Mel-0233Melampsora laricipopulina23.751e-43 175
LLPS-Put-0172Puccinia triticina23.682e-1687.8
LLPS-Lem-0707Leptosphaeria maculans23.476e-36 151
LLPS-Kop-0201Komagataella pastoris23.432e-1791.7
LLPS-Ast-0639Aspergillus terreus23.47e-30 132
LLPS-Asf-0278Aspergillus flavus23.235e-28 125
LLPS-Spr-0401Sporisorium reilianum23.21e-26 122
LLPS-Pug-0590Puccinia graminis23.042e-33 142
LLPS-Aso-0228Aspergillus oryzae23.015e-28 125
LLPS-Dos-1070Dothistroma septosporum23.014e-37 155
LLPS-Pyt-1190Pyrenophora teres22.793e-35 149
LLPS-Orb-1855Oryza barthii22.774e-0861.6
LLPS-Phn-0255Phaeosphaeria nodorum22.568e-34 144
LLPS-Yal-0993Yarrowia lipolytica22.321e-21 105
LLPS-Org-0954Oryza glaberrima22.272e-0655.8
LLPS-Orbr-2220Oryza brachyantha22.273e-0758.5
LLPS-Trr-0343Trichoderma reesei22.223e-1481.6
LLPS-Mao-0362Magnaporthe oryzae21.97e-1273.9
LLPS-Pytr-0365Pyrenophora triticirepentis21.871e-1999.0
LLPS-Trv-1498Trichoderma virens21.852e-1275.5
LLPS-Fus-1292Fusarium solani21.83e-1275.1
LLPS-Coo-0783Colletotrichum orbiculare21.41e-0656.6
LLPS-Blg-0399Blumeria graminis21.233e-26 120
LLPS-Scs-0512Sclerotinia sclerotiorum20.422e-1998.2