• Disorder▼
  • Domain▼
  • PTM▼
  • Variation▼
  • Mutation▼
  • Interaction▼
  • Disease▼
  • Drug▼
  • Physicochemical▼
  • Function▼
  • Proteomics▼
  • Structure▼
  • Localization▼
  • Expression▼
  • Element▼
  • Methylation▼

LLPS-Amt-2273
AMTR_s00057p00019730

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW

Status: Unreviewed
Protein Name: Gamma-tubulin complex component
Gene Name: AMTR_s00057p00019730
Ensembl Gene: AMTR_s00057p00019730
Ensembl Protein: ERN16739
Organism: Amborella trichopoda
Taxa ID: 13333
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY


——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification

Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Centrosome/Spindle pole bodyPredicted from orthologs(View)

▼ FUNCTION

Gamma-tubulin complex is necessary for microtubule nucleation at the centrosome.

▼ CROSS REFERENCE

DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblERN16739ERN16739
UniProtU5D2S9, U5D2S9_AMBTC
GeneBankKI392405ERN16739.1

▼ SEQUENCE

Protein Sequence (FASTA)
1     MAFARKPGTA  QTLAQKLYNI  HSKSLPFAAP  ESELEICESK  LVQCLLRMMQ  GYSSLLFYWE  60
61    DRDKMFCIKN  AIHVNHLSKS  SLNSILHQFI  YGATCLRLVE  LFVKQVENSS  ARFPPTLKAF  120
121   TNSVSAKLKR  LRGIALKVEK  ESAGSSNETT  LTLLGLVKTL  SSVCSGAEYL  LQVVHGAIPH  180
181   NYFECTVPAG  EVAVHILDHL  YKKLNEVCLV  QGGEEEAYHT  LLALFVGSLQ  PLIEGLDSWL  240
241   YEGTLDDPFE  ELFFYANNSI  GVDDATFWEK  SYLMRPLRQR  KLNCAPIFEG  KSRASNKRGI  300
301   SDAESNVLSM  REKDGENYEI  VFCPLFIQRI  AKAIVSAGKS  LQLIRHIYGQ  SKNSMAGPSL  360
361   VKIDPLDGPT  AIQEEISQGD  TFLRESDSRY  GGRSYAWKMG  RLTLFEMFSV  SLVGLIGDDC  420
421   HIYKGISHQY  PWSFQIDQLC  ELFMNKTELE  GENGDSQRKN  WESLIVDIMW  QKDPHVHIKM  480
481   ERLSSQCEVE  DINGNIEDPL  QIHSFWPANP  AITACRNLLD  RSKESWDKLN  VSRSFYLPPL  540
541   NDWCLREAIF  GDSGLETNNV  DEFTEGTECI  KDKERISEAL  FSQLKGTNYI  LGFGIGKSEH  600
601   HHEQNDTRTL  ESLFPFPTLL  PCLTDYPNIS  QLLPYQKNST  LATRVLNWIE  SIELKVDFVG  660
661   KHILLKLMDG  WRLMDELGLL  RAIYLFGSGD  LLQQLLTVLF  DKLDRGEYWD  DDFELNTLLQ  720
721   ESIRNSADGM  LLSIPDSLVV  TISKHPARDG  EHALSPVSTP  KSSRNHSFGI  GALDPLQFTY  780
781   KVSWPLELIA  NQEAIKKYNQ  VMNFLMKVKR  AKFVLDKARR  WTWKDRGATN  INQKRHLLLE  840
841   QKLLHFVDAF  HQYVMDRVLH  SAWLELCEGM  ASAGSLDEVI  EVHESYILSV  QRQCFVAPDK  900
901   LWAMIASRIR  SILGLALDFH  SIQHTLCSGG  AAPAIKARCE  LEVDRVERQF  DECIAFLLRV  960
961   LSFKLNVGHF  PHLVDLVTRI  NYNYFYMSDT  GNLLTMPTSD  VSTSKPGQPN  RKNPPSHN  1018
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGCTTTTG  CAAGAAAGCC  TGGCACTGCC  CAAACTTTAG  CACAGAAGCT  TTATAACATT  60
61    CATTCGAAAA  GCCTTCCCTT  TGCAGCACCT  GAATCCGAAC  TAGAGATATG  CGAATCCAAA  120
121   CTGGTACAAT  GTCTCTTGCG  AATGATGCAA  GGATATTCGA  GCTTGCTGTT  CTACTGGGAA  180
181   GACAGGGATA  AGATGTTTTG  TATCAAGAAT  GCCATTCATG  TGAATCACTT  GTCAAAGTCA  240
241   AGTCTCAACA  GTATTCTTCA  TCAGTTTATT  TATGGGGCTA  CATGCTTGCG  GCTGGTAGAA  300
301   CTTTTTGTTA  AGCAGGTGGA  AAACTCTAGT  GCACGGTTTC  CTCCTACTTT  AAAGGCTTTC  360
361   ACAAATTCTG  TTTCTGCAAA  ACTCAAGAGA  TTACGTGGAA  TTGCTTTAAA  GGTGGAAAAA  420
421   GAATCAGCTG  GATCCTCTAA  TGAAACTACT  CTCACACTCC  TGGGATTGGT  GAAGACCTTA  480
481   TCGAGCGTAT  GTTCTGGCGC  AGAATACCTA  TTGCAAGTAG  TACATGGAGC  AATTCCTCAT  540
541   AATTACTTTG  AATGTACTGT  TCCAGCTGGT  GAAGTTGCAG  TTCATATCCT  TGACCATCTC  600
601   TATAAGAAAT  TAAATGAAGT  TTGTTTGGTG  CAAGGTGGTG  AGGAGGAAGC  ATATCATACG  660
661   CTATTAGCTT  TGTTTGTGGG  CAGTTTGCAG  CCACTTATAG  AGGGGCTAGA  TTCATGGCTT  720
721   TATGAGGGAA  CTCTGGATGA  TCCATTTGAG  GAGCTTTTCT  TTTATGCCAA  CAATTCAATT  780
781   GGGGTTGATG  ATGCGACATT  CTGGGAGAAG  AGCTATCTCA  TGCGCCCTTT  AAGACAGAGA  840
841   AAATTGAACT  GTGCTCCTAT  TTTTGAAGGG  AAATCCCGGG  CCTCCAACAA  GAGAGGTATC  900
901   TCAGATGCAG  AATCCAATGT  TCTATCTATG  AGAGAGAAAG  ATGGTGAGAA  TTACGAAATT  960
961   GTGTTTTGCC  CTCTTTTTAT  ACAACGCATA  GCCAAGGCCA  TTGTATCAGC  TGGGAAATCA  1020
1021  CTTCAGCTGA  TCCGCCATAT  TTATGGACAA  TCTAAAAACT  CAATGGCTGG  CCCCTCACTT  1080
1081  GTTAAAATAG  ATCCACTAGA  TGGCCCTACT  GCAATTCAAG  AGGAAATATC  TCAAGGTGAT  1140
1141  ACATTTCTTA  GAGAATCAGA  TAGTCGTTAT  GGAGGGAGGA  GTTATGCTTG  GAAGATGGGG  1200
1201  AGGTTGACTT  TGTTTGAGAT  GTTCTCTGTG  TCTCTGGTTG  GGCTAATTGG  TGATGACTGC  1260
1261  CACATATATA  AAGGCATTAG  TCATCAATAT  CCATGGTCCT  TTCAAATAGA  CCAGCTATGC  1320
1321  GAACTTTTCA  TGAACAAAAC  CGAATTGGAA  GGTGAAAATG  GTGACAGTCA  GAGGAAAAAC  1380
1381  TGGGAGAGTC  TCATAGTGGA  CATAATGTGG  CAAAAAGATC  CACATGTTCA  CATCAAAATG  1440
1441  GAACGATTGA  GCTCACAATG  TGAAGTTGAA  GATATCAATG  GCAATATAGA  AGACCCACTT  1500
1501  CAAATTCATT  CCTTTTGGCC  AGCAAACCCT  GCGATTACTG  CATGTAGAAA  TCTGCTTGAT  1560
1561  AGGAGCAAGG  AATCTTGGGA  TAAACTGAAT  GTGTCAAGAA  GCTTCTATCT  TCCTCCTCTA  1620
1621  AACGATTGGT  GCCTACGAGA  GGCTATTTTT  GGTGATTCAG  GTCTTGAAAC  CAATAATGTA  1680
1681  GATGAATTCA  CTGAAGGAAC  TGAATGTATC  AAGGACAAAG  AACGGATATC  TGAGGCATTA  1740
1741  TTCAGTCAAC  TAAAGGGTAC  AAATTATATT  CTTGGATTTG  GAATTGGAAA  ATCTGAACAC  1800
1801  CATCATGAAC  AGAACGACAC  GAGAACTTTA  GAATCTTTAT  TTCCTTTCCC  AACTCTTCTT  1860
1861  CCTTGCCTTA  CGGACTACCC  CAATATATCT  CAACTGTTAC  CTTACCAGAA  AAACAGCACC  1920
1921  CTTGCTACAA  GAGTTCTTAA  TTGGATTGAG  TCCATAGAGC  TAAAGGTGGA  TTTTGTGGGA  1980
1981  AAGCATATCT  TGCTGAAGCT  TATGGATGGC  TGGAGGCTGA  TGGATGAACT  TGGTCTACTT  2040
2041  CGTGCGATTT  ACTTGTTTGG  TTCTGGTGAC  CTGCTGCAGC  AGCTCTTGAC  TGTGCTTTTT  2100
2101  GATAAGCTAG  ATAGAGGGGA  GTATTGGGAT  GACGACTTTG  AATTAAACAC  ATTACTACAG  2160
2161  GAGTCCATAC  GGAACTCTGC  TGATGGGATG  CTTTTAAGTA  TCCCTGATTC  CTTAGTTGTC  2220
2221  ACTATCTCTA  AGCATCCAGC  TCGTGATGGT  GAACATGCTC  TAAGCCCCGT  TTCAACCCCA  2280
2281  AAGAGTAGCC  GCAACCACTC  TTTTGGCATT  GGTGCCCTTG  ATCCTCTTCA  ATTTACATAC  2340
2341  AAAGTGTCTT  GGCCCCTTGA  GCTCATAGCT  AATCAAGAGG  CTATTAAGAA  GTATAACCAG  2400
2401  GTTATGAATT  TCCTAATGAA  GGTGAAGCGT  GCAAAGTTTG  TTCTTGATAA  GGCTCGAAGG  2460
2461  TGGACATGGA  AGGATAGAGG  TGCTACAAAC  ATAAACCAGA  AGCGCCACTT  GTTACTGGAG  2520
2521  CAGAAGCTTC  TCCATTTTGT  GGATGCATTT  CACCAGTATG  TCATGGACAG  GGTGCTTCAT  2580
2581  AGTGCATGGC  TTGAGCTCTG  TGAGGGCATG  GCATCTGCAG  GTTCACTCGA  CGAGGTCATA  2640
2641  GAAGTGCATG  AATCCTATAT  ACTCTCTGTC  CAGAGGCAAT  GCTTTGTTGC  CCCTGACAAG  2700
2701  CTGTGGGCCA  TGATTGCGAG  CCGGATTAGG  AGCATACTTG  GGCTGGCTCT  CGATTTCCAC  2760
2761  TCCATACAGC  ACACTTTGTG  CAGCGGTGGG  GCTGCTCCTG  CTATAAAGGC  CAGGTGCGAG  2820
2821  TTGGAGGTTG  ATCGAGTCGA  GAGACAATTT  GATGAATGCA  TTGCATTTCT  TCTCCGGGTA  2880
2881  TTGTCCTTCA  AGCTCAATGT  GGGGCACTTC  CCTCATTTGG  TGGACTTGGT  AACCAGAATC  2940
2941  AATTACAATT  ACTTCTATAT  GTCTGATACC  GGCAACTTGC  TCACGATGCC  TACTTCTGAT  3000
3001  GTTTCTACAT  CCAAACCTGG  TCAACCGAAC  CGGAAGAATC  CTCCCTCCCA  TAATTGA  3057

▼ KEYWORD

ID
Family
Complete proteome
Cytoplasm
Cytoskeleton
Microtubule
Reference proteome

▼ GENE ONTOLOGY

ID
Classification
Description
Cellular Component
Cytoplasm
Cellular Component
Microtubule
Cellular Component
Microtubule organizing center
Cellular Component
Spindle pole
Molecular Function
Gamma-tubulin binding
Biological Process
Microtubule nucleation

▼ ORTHOLOGY

DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Orni-1805Oryza nivara71.855e-60 225
LLPS-Lep-1893Leersia perrieri68.958e-143 457
LLPS-Orm-1998Oryza meridionalis65.23e-82 295
LLPS-Pot-2495Populus trichocarpa62.670.0 628
LLPS-Viv-2060Vitis vinifera55.990.01041
LLPS-Coc-1105Corchorus capsularis52.970.0 842
LLPS-Thc-0364Theobroma cacao52.890.0 978
LLPS-Prp-1411Prunus persica52.540.0 973
LLPS-Mua-0402Musa acuminata52.010.0 974
LLPS-Mae-1776Manihot esculenta51.860.0 906
LLPS-Gor-2455Gossypium raimondii51.770.0 941
LLPS-Cus-1566Cucumis sativus51.730.0 950
LLPS-Met-1843Medicago truncatula51.240.0 899
LLPS-Glm-1777Glycine max50.720.0 931
LLPS-Via-0289Vigna angularis50.720.0 921
LLPS-Phv-1906Phaseolus vulgaris50.480.0 910
LLPS-Art-2111Arabidopsis thaliana50.450.0 858
LLPS-Nia-1879Nicotiana attenuata50.340.0 783
LLPS-Hea-0400Helianthus annuus50.10.0 890
LLPS-Vir-0601Vigna radiata50.10.0 919
LLPS-Hov-1589Hordeum vulgare49.850.0 598
LLPS-Arl-0498Arabidopsis lyrata49.550.0 840
LLPS-Sot-1761Solanum tuberosum49.180.0 887
LLPS-Brn-1804Brassica napus48.930.0 738
LLPS-Sol-1958Solanum lycopersicum48.50.0 868
LLPS-Org-0887Oryza glaberrima48.40.0 881
LLPS-Bro-1218Brassica oleracea48.280.0 812
LLPS-Ors-1238Oryza sativa48.20.0 877
LLPS-Php-0750Physcomitrella patens47.843e-141 460
LLPS-Brd-0022Brachypodium distachyon47.660.0 870
LLPS-Brr-0503Brassica rapa47.640.0 812
LLPS-Tra-1313Triticum aestivum47.60.0 880
LLPS-Sei-1615Setaria italica47.210.0 864
LLPS-Orbr-1410Oryza brachyantha47.010.0 861
LLPS-Orp-1850Oryza punctata46.750.0 856
LLPS-Orgl-0446Oryza glumaepatula46.450.0 826
LLPS-Sob-1633Sorghum bicolor46.390.0 844
LLPS-Ori-2333Oryza indica46.170.0 826
LLPS-Zem-2453Zea mays45.810.0 842
LLPS-Orb-1765Oryza barthii43.220.0 734
LLPS-Lac-1186Latimeria chalumnae33.18e-1377.0
LLPS-Leo-2101Lepisosteus oculatus31.632e-30 134
LLPS-Dar-2084Danio rerio30.722e-30 134
LLPS-Xim-2971Xiphophorus maculatus30.41e-24 115
LLPS-Asm-2558Astyanax mexicanus30.243e-29 130
LLPS-Gaa-1182Gasterosteus aculeatus29.884e-29 129
LLPS-Scf-4017Scleropages formosus29.528e-29 129
LLPS-Pof-2977Poecilia formosa29.521e-29 131
LLPS-Paa-2019Papio anubis29.332e-26 121
LLPS-Orl-0617Oryzias latipes29.176e-30 132
LLPS-Icp-4078Ictalurus punctatus29.138e-26 119
LLPS-Xet-3382Xenopus tropicalis29.064e-1687.8
LLPS-Pat-1453Pan troglodytes29.031e-26 122
LLPS-Pap-2482Pan paniscus29.031e-26 122
LLPS-Poa-3233Pongo abelii29.039e-27 122
LLPS-Nol-2033Nomascus leucogenys28.992e-27 124
LLPS-Eqc-1267Equus caballus28.982e-27 124
LLPS-Fia-1702Ficedula albicollis28.955e-26 120
LLPS-Hos-1867Homo sapiens28.952e-26 121
LLPS-Cea-1889Cercocebus atys28.744e-27 123
LLPS-Chs-3762Chlorocebus sabaeus28.744e-27 123
LLPS-Maf-2435Macaca fascicularis28.744e-27 123
LLPS-Mal-0739Mandrillus leucophaeus28.744e-27 123
LLPS-Man-1415Macaca nemestrina28.744e-27 123
LLPS-Scm-1801Scophthalmus maximus28.663e-29 130
LLPS-Gog-2647Gorilla gorilla28.652e-26 121
LLPS-Cap-3151Cavia porcellus28.629e-24 112
LLPS-Orn-0513Oreochromis niloticus28.535e-29 129
LLPS-Anc-1557Anolis carolinensis28.495e-24 113
LLPS-Mea-3511Mesocricetus auratus28.452e-27 124
LLPS-Pes-0888Pelodiscus sinensis28.452e-26 120
LLPS-Tag-2843Taeniopygia guttata28.459e-27 122
LLPS-Dio-2251Dipodomys ordii28.447e-26 119
LLPS-Fud-0049Fukomys damarensis28.361e-26 122
LLPS-Sah-0968Sarcophilus harrisii28.363e-25 117
LLPS-Mam-1113Macaca mulatta28.274e-25 117
LLPS-Aim-1877Ailuropoda melanoleuca28.171e-23 108
LLPS-Rhb-0102Rhinopithecus bieti28.153e-26 120
LLPS-Loa-2337Loxodonta africana28.155e-27 123
LLPS-Myl-4006Myotis lucifugus28.117e-27 122
LLPS-Orc-3317Oryctolagus cuniculus28.072e-26 121
LLPS-Mod-1098Monodelphis domestica28.077e-26 119
LLPS-Otg-1774Otolemur garnettii27.912e-27 124
LLPS-Tar-0780Takifugu rubripes27.95e-24 113
LLPS-Gaga-0774Gallus gallus27.895e-27 123
LLPS-Caj-0136Callithrix jacchus27.861e-26 122
LLPS-Mum-0737Mus musculus27.862e-27 124
LLPS-Ran-0340Rattus norvegicus27.861e-27 125
LLPS-Bot-1810Bos taurus27.864e-27 123
LLPS-Sus-3515Sus scrofa27.662e-22 108
LLPS-Urm-0034Ursus maritimus27.65e-27 123
LLPS-Aon-4379Aotus nancymaae27.579e-25 115
LLPS-Mup-2100Mustela putorius furo27.575e-27 123
LLPS-Ova-0968Ovis aries27.578e-27 122
LLPS-Cas-1414Carlito syrichta27.573e-27 123
LLPS-Caf-0514Canis familiaris27.576e-27 122
LLPS-Tum-1164Tuber melanosporum27.276e-1584.0
LLPS-Fec-4737Felis catus27.272e-26 121
LLPS-Ten-1815Tetraodon nigroviridis27.275e-28 126
LLPS-Coo-0572Colletotrichum orbiculare26.873e-1068.6
LLPS-Anp-2568Anas platyrhynchos26.759e-20 100
LLPS-Phn-0006Phaeosphaeria nodorum26.611e-1276.6
LLPS-Meg-2334Meleagris gallopavo26.434e-1997.8
LLPS-Cii-2056Ciona intestinalis26.423e-1791.3
LLPS-Asfu-0025Aspergillus fumigatus25.484e-1274.7
LLPS-Lem-0548Leptosphaeria maculans25.45e-1274.3
LLPS-Pyt-0400Pyrenophora teres25.46e-1273.9
LLPS-Pytr-0096Pyrenophora triticirepentis25.46e-1273.9
LLPS-Nec-0285Neurospora crassa25.212e-1069.3
LLPS-Abg-0209Absidia glauca25.02e-1275.5
LLPS-Asn-1120Aspergillus nidulans24.94e-1274.7
LLPS-Yal-0390Yarrowia lipolytica24.852e-1069.3
LLPS-Ict-3334Ictidomys tridecemlineatus24.766e-1790.9
LLPS-Cis-0860Ciona savignyi24.431e-1689.4
LLPS-Nef-0244Neosartorya fischeri24.331e-1070.1
LLPS-Trr-0381Trichoderma reesei24.151e-1070.1
LLPS-Trv-0038Trichoderma virens24.158e-1170.5
LLPS-Asc-1482Aspergillus clavatus23.747e-1067.4
LLPS-Ast-1215Aspergillus terreus23.483e-1068.2
LLPS-Sem-1241Selaginella moellendorffii23.111e-1070.1
LLPS-Drm-1761Drosophila melanogaster22.942e-1172.4