• Disorder
  • Domain
  • PTM
  • Variation
  • Mutation
  • Interaction
  • Disease
  • Drug
  • Physicochemical
  • Function
  • Proteomics
  • Structure
  • Localization
  • Expression
  • Element
  • Methylation

LLPS-Amt-0787
AMTR_s00048p00224070

Integrated Annotations

▼ OVERVIEW


Status: Unreviewed
Protein Name: ATP-dependent DNA helicase
Gene Name: AMTR_s00048p00224070
Ensembl Gene: AMTR_s00048p00224070
Ensembl Protein: ERN15693
Organism: Amborella trichopoda
Taxa ID: 13333
LLPS Type: Others


▼ PROPERTY



——— Disorder propensity (calculated by IUPred2A)

▼ Classification


Condensates:
CondensateEvidenceOrthologs
Nucleolus, Stress granulePredicted from orthologs(View)

▼ CROSS REFERENCE


DatabaseNucleotide IDProtein ID
EnsemblERN15693ERN15693
UniProtU5D5R7, U5D5R7_AMBTC
GeneBankKI392502ERN15693.1

▼ SEQUENCE


Protein Sequence (FASTA)
1     MEDDILAELL  NVEEELEEVQ  GQIRVLISRQ  DKLYEKQSEL  KALLEACQGS  ESPSNAKVSA  60
61    PVENWAGSFE  WDKEVDDIRF  NVFGISEYRV  NQCEIINAVM  SGRDVLVIMA  AGGGKSLCYQ  120
121   LPAILRNGVA  LVVSPLLSLI  QDQVMGLSAL  GIPASMLTSN  TSKEDEKMIY  KALEKGEGEL  180
181   KILYVTPEKI  SKSKRFMSKL  EKCHHAGRLS  LISIDEAHCC  SQWGHDFRPD  YKNLSILKTQ  240
241   FPSVPMIALT  ATATQRVQTD  LMEMLHISKC  VKFVSTVNRP  NLFYEVREKS  SAAKVVIDEV  300
301   TDFICGSYPN  KESGIVYCFT  RKECEQVAKE  LRERGILADH  YHADMDANER  ERVHLRWSNN  360
361   RIQVIVGTVA  FGMGINKPDV  RFVIHHSLSK  SMETYYQESG  RAGRDGLPAD  CLLFFRPGDV  420
421   PRQSSMVFYE  NSGLQNLYDI  VRFCQSKRSC  RRNAFFHHFG  EPLQDCNGMC  DNCAHPTETK  480
481   EVDASTQAKI  IVSLLKEMQE  NDQRATMLQL  VDKLKVNSRG  SGGATPTIPD  LKREELEQLI  540
541   VQLVLDRVLK  EEFQHTAYST  NAYVTIGPLW  KQLVQGKKMV  KLEISVNSRG  SRTNIKAVKC  600
601   KHLAGLELKL  DDFRKELSSC  HGGIFPHAVL  STQQISTLST  ERPDSLEQLE  KLIGKTKTEK  660
661   YGERILDCIR  QYVETEVPNG  SVKEGDSIQH  RPTKRAKTKK  ALINIDTSED  EQC  713
Nucleotide CDS Sequence (FASTA)
1     ATGGAAGACG  ACATCTTAGC  AGAGCTGCTA  AATGTAGAGG  AAGAGTTAGA  GGAGGTTCAA  60
61    GGCCAAATAA  GGGTGCTGAT  TAGTCGGCAG  GACAAGTTGT  ATGAGAAACA  ATCAGAGTTG  120
121   AAGGCATTAT  TAGAAGCATG  TCAAGGTTCT  GAGAGCCCTT  CCAATGCCAA  GGTATCAGCC  180
181   CCTGTGGAAA  ATTGGGCAGG  TTCATTTGAG  TGGGACAAGG  AAGTGGATGA  TATCCGTTTC  240
241   AATGTATTTG  GGATATCTGA  GTACCGTGTA  AACCAATGCG  AGATTATTAA  TGCAGTCATG  300
301   AGTGGGAGAG  ACGTTCTTGT  GATAATGGCT  GCAGGGGGTG  GTAAAAGCCT  TTGTTACCAA  360
361   CTTCCAGCCA  TTCTTCGCAA  TGGAGTGGCA  CTTGTAGTCA  GTCCTCTGCT  ATCCCTTATT  420
421   CAAGATCAGG  TAATGGGGCT  GTCTGCTTTA  GGCATCCCAG  CTAGCATGCT  TACTTCAAAT  480
481   ACTAGCAAAG  AAGATGAAAA  GATGATATAT  AAGGCCCTTG  AGAAAGGTGA  GGGAGAGCTG  540
541   AAGATTTTGT  ATGTTACACC  AGAGAAGATA  TCAAAGAGCA  AAAGGTTCAT  GTCTAAGCTT  600
601   GAAAAATGCC  ATCATGCTGG  CCGGCTTTCT  CTTATCTCAA  TTGATGAGGC  ACATTGCTGC  660
661   AGTCAATGGG  GGCATGACTT  CCGTCCTGAT  TACAAGAATC  TCAGCATTTT  AAAGACTCAG  720
721   TTTCCCAGTG  TTCCAATGAT  TGCTCTGACT  GCAACTGCCA  CTCAAAGGGT  CCAAACTGAC  780
781   CTAATGGAGA  TGTTGCATAT  TTCAAAATGT  GTTAAGTTTG  TGAGCACAGT  GAACAGACCC  840
841   AATCTTTTCT  ATGAGGTAAG  AGAAAAGTCA  TCTGCTGCAA  AGGTGGTCAT  TGATGAAGTC  900
901   ACAGATTTTA  TATGTGGCTC  TTATCCAAAT  AAGGAATCTG  GAATAGTTTA  TTGTTTCACT  960
961   CGAAAGGAGT  GTGAGCAGGT  TGCCAAGGAA  TTACGCGAAC  GGGGGATATT  GGCTGATCAT  1020
1021  TATCATGCAG  ATATGGATGC  TAATGAGCGT  GAACGTGTCC  ATCTACGTTG  GAGCAATAAC  1080
1081  CGTATTCAGG  TCATTGTGGG  CACGGTGGCA  TTTGGTATGG  GAATCAACAA  ACCGGATGTT  1140
1141  AGGTTTGTCA  TTCATCATAG  CTTAAGCAAA  TCTATGGAGA  CATATTACCA  GGAAAGTGGC  1200
1201  CGAGCTGGAC  GTGATGGCCT  TCCTGCAGAT  TGTTTATTGT  TTTTCAGGCC  TGGCGATGTT  1260
1261  CCCAGGCAGA  GCTCAATGGT  CTTTTATGAG  AACTCAGGAT  TGCAAAATCT  CTATGATATA  1320
1321  GTCCGTTTTT  GCCAGTCTAA  AAGAAGCTGC  CGGCGGAATG  CTTTCTTTCA  CCATTTTGGA  1380
1381  GAGCCTTTAC  AAGATTGCAA  TGGGATGTGT  GACAACTGTG  CTCATCCAAC  TGAGACTAAG  1440
1441  GAAGTGGATG  CCTCTACCCA  AGCAAAAATC  ATTGTCTCAT  TACTGAAGGA  GATGCAAGAG  1500
1501  AATGACCAAA  GGGCTACCAT  GTTGCAATTG  GTGGATAAGT  TGAAGGTCAA  CTCTAGGGGT  1560
1561  TCAGGTGGTG  CAACTCCTAC  AATTCCTGAT  CTAAAGAGAG  AGGAACTGGA  GCAACTGATT  1620
1621  GTGCAGCTTG  TTTTAGATCG  AGTTTTGAAA  GAAGAATTTC  AGCATACAGC  CTATTCCACA  1680
1681  AATGCCTATG  TTACTATTGG  ACCTCTGTGG  AAGCAATTAG  TACAAGGGAA  AAAGATGGTT  1740
1741  AAGCTTGAAA  TTTCTGTCAA  CTCAAGAGGA  AGTAGAACAA  ATATAAAAGC  GGTGAAATGC  1800
1801  AAACACTTGG  CTGGCCTCGA  ATTAAAGCTT  GACGATTTTC  GGAAGGAGCT  CTCTTCATGT  1860
1861  CATGGAGGAA  TATTTCCTCA  TGCGGTTTTG  TCCACGCAAC  AAATTAGCAC  GCTCAGCACT  1920
1921  GAGAGGCCAG  ATTCCTTAGA  GCAGTTGGAG  AAGCTTATTG  GAAAGACGAA  GACAGAGAAA  1980
1981  TATGGTGAAA  GGATTCTTGA  TTGTATCCGA  CAGTATGTAG  AAACAGAGGT  ACCCAATGGC  2040
2041  TCTGTAAAGG  AAGGGGACAG  TATCCAACAC  AGACCGACCA  AGAGAGCAAA  GACCAAGAAG  2100
2101  GCTCTCATTA  ATATCGATAC  TAGCGAAGAC  GAACAATGTT  GA  2142

▼ ORTHOLOGY


DrLLPS IDOrganismIdentityE-valueScore
LLPS-Ors-0549Oryza sativa77.270.0 793
LLPS-Hov-0602Hordeum vulgare75.979e-172 504
LLPS-Orbr-1419Oryza brachyantha75.00.0 753
LLPS-Viv-1305Vitis vinifera73.950.01055
LLPS-Glm-2721Glycine max73.40.01019
LLPS-Prp-2291Prunus persica73.380.01038
LLPS-Via-1356Vigna angularis72.290.01024
LLPS-Phv-1869Phaseolus vulgaris71.940.01028
LLPS-Mae-0454Manihot esculenta71.450.0 992
LLPS-Pot-2088Populus trichocarpa70.880.01001
LLPS-Nia-1588Nicotiana attenuata70.660.01010
LLPS-Vir-1241Vigna radiata70.650.01008
LLPS-Sob-2238Sorghum bicolor70.190.0 996
LLPS-Thc-0270Theobroma cacao70.110.0 990
LLPS-Mua-1189Musa acuminata70.030.0 999
LLPS-Gor-0993Gossypium raimondii69.680.0 985
LLPS-Hea-1257Helianthus annuus69.350.01001
LLPS-Brd-1480Brachypodium distachyon69.260.0 994
LLPS-Cus-0643Cucumis sativus69.150.0 988
LLPS-Tra-2465Triticum aestivum69.020.0 984
LLPS-Brr-0388Brassica rapa68.620.0 976
LLPS-Arl-0343Arabidopsis lyrata68.580.0 983
LLPS-Bro-1463Brassica oleracea68.470.0 968
LLPS-Orp-0853Oryza punctata68.380.0 967
LLPS-Met-0968Medicago truncatula68.350.0 966
LLPS-Art-2209Arabidopsis thaliana68.190.0 982
LLPS-Sei-2146Setaria italica67.090.0 941
LLPS-Ori-1339Oryza indica66.30.0 972
LLPS-Orni-1795Oryza nivara66.240.0 946
LLPS-Dac-0814Daucus carota65.520.0 908
LLPS-Orgl-2145Oryza glumaepatula63.310.0 862
LLPS-Lep-0190Leersia perrieri62.590.0 912
LLPS-Php-2318Physcomitrella patens61.970.0 866
LLPS-Orb-1361Oryza barthii61.570.0 866
LLPS-Zem-2548Zea mays60.750.0 858
LLPS-Orr-0578Oryza rufipogon60.380.0 894
LLPS-Orm-0035Oryza meridionalis59.430.0 831
LLPS-Sem-1555Selaginella moellendorffii56.490.0 798
LLPS-Anc-2934Anolis carolinensis51.285e-155 464
LLPS-Anp-2602Anas platyrhynchos47.661e-174 522
LLPS-Cogr-0207Colletotrichum graminicola47.63e-118 394
LLPS-Sus-1431Sus scrofa47.54e-170 514
LLPS-Chr-0193Chlamydomonas reinhardtii47.427e-164 504
LLPS-Meg-0109Meleagris gallopavo47.335e-173 518
LLPS-Gog-3773Gorilla gorilla47.314e-170 510
LLPS-Eqc-3050Equus caballus47.144e-170 514
LLPS-Caf-1671Canis familiaris46.964e-171 513
LLPS-Orc-1601Oryctolagus cuniculus46.952e-170 511
LLPS-Otg-0205Otolemur garnettii46.91e-170 511
LLPS-Pap-1037Pan paniscus46.882e-168 506
LLPS-Cas-1316Carlito syrichta46.771e-168 506
LLPS-Cap-2374Cavia porcellus46.773e-172 516
LLPS-Pes-2468Pelodiscus sinensis46.711e-167 504
LLPS-Myl-0236Myotis lucifugus46.594e-169 508
LLPS-Ova-3422Ovis aries46.591e-170 511
LLPS-Loa-1565Loxodonta africana46.593e-170 511
LLPS-Aim-3295Ailuropoda melanoleuca46.439e-168 504
LLPS-Urm-0289Ursus maritimus46.432e-167 503
LLPS-Mup-0467Mustela putorius furo46.283e-168 506
LLPS-Orn-0936Oreochromis niloticus46.112e-151 462
LLPS-Gag-1152Gaeumannomyces graminis46.15e-115 385
LLPS-Bot-0334Bos taurus46.067e-170 509
LLPS-Trr-0471Trichoderma reesei46.059e-118 393
LLPS-Lac-0268Latimeria chalumnae45.996e-164 494
LLPS-Fus-0592Fusarium solani45.952e-120 397
LLPS-Gaga-3610Gallus gallus45.922e-168 506
LLPS-Pat-2577Pan troglodytes45.787e-168 509
LLPS-Cii-2179Ciona intestinalis45.744e-154 466
LLPS-Fec-1030Felis catus45.714e-165 498
LLPS-Fud-3858Fukomys damarensis45.72e-171 513
LLPS-Dio-2926Dipodomys ordii45.72e-165 498
LLPS-Tag-1461Taeniopygia guttata45.693e-172 516
LLPS-Hos-1527Homo sapiens45.611e-170 511
LLPS-Cea-3644Cercocebus atys45.447e-171 512
LLPS-Aon-4260Aotus nancymaae45.441e-170 511
LLPS-Chs-3063Chlorocebus sabaeus45.448e-171 512
LLPS-Paa-4432Papio anubis45.442e-170 511
LLPS-Rhb-2329Rhinopithecus bieti45.441e-170 511
LLPS-Nol-0385Nomascus leucogenys45.445e-170 510
LLPS-Poa-3063Pongo abelii45.444e-166 500
LLPS-Asfu-1400Aspergillus fumigatus45.372e-121 403
LLPS-Fuo-1286Fusarium oxysporum45.354e-117 374
LLPS-Fia-0679Ficedula albicollis45.36e-172 514
LLPS-Mal-4124Mandrillus leucophaeus45.278e-171 510
LLPS-Mum-1280Mus musculus45.267e-167 502
LLPS-Nef-0625Neosartorya fischeri45.253e-121 402
LLPS-Ast-1197Aspergillus terreus45.257e-123 405
LLPS-Beb-0545Beauveria bassiana45.243e-113 380
LLPS-Asm-2074Astyanax mexicanus45.164e-151 466
LLPS-Cae-0596Caenorhabditis elegans45.144e-150 458
LLPS-Maf-1801Macaca fascicularis45.096e-169 507
LLPS-Man-0087Macaca nemestrina45.096e-169 507
LLPS-Mam-3119Macaca mulatta45.096e-169 507
LLPS-Mod-0792Monodelphis domestica44.821e-169 509
LLPS-Asc-1356Aspergillus clavatus44.817e-115 384
LLPS-Asf-1250Aspergillus flavus44.815e-120 399
LLPS-Asn-0800Aspergillus nidulans44.782e-118 394
LLPS-Caj-0991Callithrix jacchus44.754e-171 513
LLPS-Abg-1311Absidia glauca44.734e-115 377
LLPS-Ran-0957Rattus norvegicus44.637e-171 511
LLPS-Orl-2649Oryzias latipes44.63e-146 454
LLPS-Mao-0972Magnaporthe oryzae44.571e-110 373
LLPS-Gaa-3818Gasterosteus aculeatus44.546e-151 461
LLPS-Cog-1252Colletotrichum gloeosporioides44.543e-118 395
LLPS-Coo-1136Colletotrichum orbiculare44.517e-116 387
LLPS-Sah-1589Sarcophilus harrisii44.416e-166 499
LLPS-Pof-0107Poecilia formosa44.392e-158 480
LLPS-Pyt-0308Pyrenophora teres44.22e-119 398
LLPS-Scf-1939Scleropages formosus44.193e-152 464
LLPS-Ved-1017Verticillium dahliae44.127e-113 379
LLPS-Tar-1269Takifugu rubripes44.043e-144 444
LLPS-Cis-1080Ciona savignyi43.887e-164 492
LLPS-Aso-1138Aspergillus oryzae43.874e-125 399
LLPS-Ict-2465Ictidomys tridecemlineatus43.551e-148 453
LLPS-Xim-1152Xiphophorus maculatus43.363e-152 464
LLPS-Ten-3478Tetraodon nigroviridis43.362e-146 449
LLPS-Crn-0949Cryptococcus neoformans43.233e-104 351
LLPS-Pytr-0324Pyrenophora triticirepentis43.21e-121 402
LLPS-Brn-0455Brassica napus42.985e-119 390
LLPS-Coc-0983Corchorus capsularis42.84e-117 385
LLPS-Phn-1193Phaeosphaeria nodorum42.535e-116 388
LLPS-Org-1337Oryza glaberrima42.513e-105 340
LLPS-Scm-1967Scophthalmus maximus42.51e-148 455
LLPS-Dar-0893Danio rerio42.298e-147 451
LLPS-Dos-0939Dothistroma septosporum42.231e-120 395
LLPS-Icp-1032Ictalurus punctatus42.051e-139 437
LLPS-Nec-1405Neurospora crassa42.024e-112 380
LLPS-Tru-0741Triticum urartu41.593e-103 341
LLPS-Osl-0071Ostreococcus lucimarinus40.813e-117 367
LLPS-Zyt-1008Zymoseptoria tritici40.292e-118 374
LLPS-Mea-1020Mesocricetus auratus40.18e-134 416
LLPS-Trv-0207Trichoderma virens39.891e-116 390
LLPS-Usm-0151Ustilago maydis39.744e-122 389
LLPS-Pug-0045Puccinia graminis39.354e-124 395
LLPS-Lem-0851Leptosphaeria maculans38.849e-116 388
LLPS-Chc-1036Chondrus crispus38.336e-105 349
LLPS-Xet-2938Xenopus tropicalis38.231e-117 391
LLPS-Leo-0934Lepisosteus oculatus37.932e-111 357
LLPS-Spr-1169Sporisorium reilianum36.362e-119 383
LLPS-Sac-1100Saccharomyces cerevisiae36.35e-107 361
LLPS-Asg-1289Ashbya gossypii34.944e-104 352