- Disorder▼
- Domain▼
- PTM▼
- Variation▼
- Mutation▼
- Interaction▼
- Disease▼
- Drug▼
- Physicochemical▼
- Function▼
- Proteomics▼
- Structure▼
- Localization▼
- Expression▼
- Element▼
- Methylation▼
- SMART
- Pfam
- InterPro
- LCReXXXplorer
- CDD
- PRINTS
- PROSITE
- Gene3D
SMART  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Domain | Start | End | E-value | Type | Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WD40 | 41 | 80 | 1.20851608158174e-07 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam:WD40 | 42 | 80 | 2.5e-06 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WD40 | 85 | 124 | 1.54047595740805 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WD40 | 130 | 170 | 0.156013077760371 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam:WD40 | 132 | 170 | 0.00068 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WD40 | 191 | 230 | 1.10931310817255 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WD40 | 317 | 358 | 35.5019673771806 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| InterPro ID | Name | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPR030141 | ARC1B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPR017383 | ARPC1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPR015943 | WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPR001680 | WD40_repeat | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPR017986 | WD40_repeat_dom | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPR036322 | WD40_repeat_dom_sf | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LCR-eXXXplorer | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Start | End | Method | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 309 | 321 | SEG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CDD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Hit Type | PSSM-ID | From | To | E-value | Bitscore | Accession | Short Name | Incomplete | Superfamily | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Non-specific | 238121 | 45 | 264 | 3.9291e-16 | 77.7604 | Cd00200 | WD40 | - | Cl29593 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Superfamily | 356469 | 45 | 264 | 3.9291e-16 | 77.7604 | Cl29593 | WD40 superfamily | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Non-specific | 238121 | 4 | 265 | 1.36758e-13 | 70.0564 | Cd00200 | WD40 | - | Cl29593 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Non-specific | 238121 | 9 | 226 | 3.09639e-13 | 69.286 | Cd00200 | WD40 | N | Cl29593 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Non-specific | 238121 | 10 | 170 | 1.90234e-12 | 66.9748 | Cd00200 | WD40 | N | Cl29593 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Multi-dom | 225201 | 12 | 234 | 1.03553e-12 | 68.9619 | COG2319 | WD40 | N | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Multi-dom | 225201 | 2 | 262 | 4.5744e-12 | 66.6507 | COG2319 | WD40 | NC | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Multi-dom | 225201 | 4 | 264 | 1.27467e-10 | 62.4135 | COG2319 | WD40 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Multi-dom | 225201 | 9 | 171 | 1.68192e-10 | 62.0283 | COG2319 | WD40 | N | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Multi-dom | 197651 | 41 | 79 | 2.63406e-06 | 43.455 | Smart00320 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Multi-dom | 334060 | 42 | 79 | 6.18362e-05 | 39.6523 | Pfam00400 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PRINTS ID | Identifier | Description | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PR00320 | GPROTEINBRPT | G protein beta WD-40 repeat signature | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CATH SUPERFAMILY CODE | Start-End | E-value | Domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2.130.10.10 | 1-372 | 1.8e-177 | YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||