- PancanQTL
- TumorFusions
- OMIM
- DisGeNET
- GWASdb
- ActiveDriverDB
PancanQTL  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS ID | Cancer | Trans/Cis | AA Position | AA residue | Chr | Position | Alt | Position | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs2072193 | LGG | Cis | 322 | S->R | Chr22 | 31533796 | C/G | Chr22:31608250-31676064:+ | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs16987136 | BRCA | Trans | 325 | E->G | Chr22 | 29534621 | A/G | Chr22:31608250-31676064:+ | |||||||||||||||||||||||||||||||
| TumorFusions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Cancer | Gene | Chr | Strand | Junction | Tier | Frame | Centrality | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| HNSC | ATXN10 | 22 | 1 | 46202839 | Tier1 | In-frame | 0.37759 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| BLCA | CDC45 | 22 | 1 | 19504050 | Tier1 | In-frame | 0.37584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| THYM | MED15 | 22 | 1 | 20891404 | Tier1 | In-frame | 0.37911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| BRCA | OSBP2 | 22 | 1 | 31266416 | Tier1 | Out-of-frame | 0.37897 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| BRCA | RUFY1 | 5 | 1 | 179007948 | Tier1 | In-frame | 0.38048 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| DisGeNET | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Disease Name | Score | Nof References | Nof SNPs | Source | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Azoospermia | 0.002407028523288 | 1 | 0 | GAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Colitis | 0.0002747267842131 | 1 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Colorectal Carcinoma | 0.0002747267842131 | 1 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Diabetic Nephropathy | 0.0002747267842131 | 1 | 1 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fibrosarcoma | 0.0002747267842131 | 1 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Male infertility | 0.002407028523288 | 1 | 0 | GAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kidney Failure, Chronic | 0.0002747267842131 | 1 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Liver Cirrhosis, Experimental | 0.2 | 1 | 0 | CTD_human | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Neoplasm Metastasis | 0.0002747267842131 | 1 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Neuroblastoma | 0.0002747267842131 | 1 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Neurofibromatosis 2 | 0.0002747267842131 | 1 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Oligospermia | 0.002407028523288 | 1 | 0 | GAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tobacco Use Disorder | 0.002407028523288 | 1 | 0 | GAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Carcinogenesis | 0.0002747267842131 | 1 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Central neuroblastoma | 0.0002747267842131 | 1 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fibrosarcoma metastatic | 0.0002747267842131 | 1 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Colorectal Cancer | 0.0002747267842131 | 1 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chronic kidney disease stage 5 | 0.0002747267842131 | 1 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GWASdb | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chr | Position | RS ID | Ref | Alt | P-value | P-value Text | Drug Name | Drug Annotation | HPO ID | References | |||||||||||||||||||||||||||||
| 22 | 31665862 | rs2413045 | A | G | 3.67E-05 | PACLITAXEL | ANTINEOPLASTIC AGENTS|RECEPTORS, EPH FAMILY | HPOID:0000763 | 23776197 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| 22 | 31675185 | rs4141404 | A | C | 3.00E-06 | PACLITAXEL | ANTINEOPLASTIC AGENTS|RECEPTORS, EPH FAMILY | HPOID:0000763 | 23776197 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ActiveDriverDB | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Position | Ref | Alt | Cancer | Sample ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 188 | G | V | Pancancer | Comments: na brca tcga-ar-a251-01a-12d-a167-09 43846 28168 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 182 | R | H | Pancancer | Comments: na gbm tcga-12-3650-01a-01d-1495-08 92182 59716 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 182 | R | H | Pancancer | Comments: na gbm tcga-76-6662-01a-11d-1845-08 103985 67455 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 24 | D | N | Pancancer | Comments: na hnsc tcga-cr-5248-01a-01d-2012-08 124046 80163 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 49 | E | K | Pancancer | Comments: na hnsc tcga-cr-5248-01a-01d-2012-08 124047 80164 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 135 | P | L | Pancancer | Comments: na hnsc tcga-cr-6471-01a-11d-1870-08 124481 80429 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 403 | P | L | Pancancer | Comments: na kirc tcga-b0-4945-01a-01d-1421-08 160889 103391 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 232 | L | P | Pancancer | Comments: na kirc tcga-cj-4894-01a-01d-1373-10 174681 111577 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 165 | N | K | Pancancer | Comments: na luad tcga-05-4389-01a-01d-1265-08 186346 118797 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 424 | M | V | Pancancer | Comments: na lusc tcga-39-5022-01a-21d-1817-08 286924 184564 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 280 | E | Q | Pancancer | Comments: na lusc tcga-60-2720-01a-01d-1522-08 299660 193021 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 304 | I | M | Pancancer | Comments: na ov tcga-25-1326-01a-01w-0492-08 330064 213504 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 274 | G | D | Pancancer | Comments: na ucec tcga-ap-a0lp-01a-12d-a10b-09 344178 222747 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 265 | R | C | Pancancer | Comments: na ucec tcga-ap-a0lt-01a-11w-a062-09 344717 223085 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 227 | R | Q | Pancancer | Comments: na ucec tcga-b5-a0k1-01a-11w-a062-09 350078 226530 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 265 | R | H | Pancancer | Comments: na ucec tcga-b5-a11y-01a-21d-a10m-09 355631 230106 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 397 | R | H | Pancancer | Comments: na ucec tcga-b5-a11y-01a-21d-a10m-09 355632 230107 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 628 | E | G | Pancancer | Comments: na ucec tcga-bg-a0m4-01a-11w-a10c-09 357205 231106 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 325 | I | V | Pancancer | Comments: na ucec tcga-d1-a16s-01a-11d-a12j-09 370258 239425 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 206 | T | M | Pancancer | Comments: na ucec tcga-d1-a17b-01a-22d-a12j-09 373662 241653 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 261 | R | C | Pancancer | Comments: na ucec tcga-d1-a17d-01a-12d-a12j-09 374109 241934 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||