- PancanQTL
- OMIM
- DisGeNET
- ActiveDriverDB
PancanQTL  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS ID | Cancer | Trans/Cis | AA Position | AA residue | Chr | Position | Alt | Position | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs2291442 | PRAD | Cis | 1128 | T->M | Chr5 | 176017455 | C/T | Chr5:175810950-175815540:- | |||||||||||||||||||||||||||||||
| DisGeNET | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Disease Name | Score | Nof References | Nof SNPs | Source | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Malignant neoplasm of breast | 0.0005494535684262 | 2 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Liver neoplasms | 0.2 | 1 | 0 | CTD_human | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precancerous Conditions | 0.2 | 1 | 0 | CTD_human | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tumor Progression | 0.0002747267842131 | 1 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Carcinogenesis | 0.0002747267842131 | 1 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Breast Carcinoma | 0.0005494535684262 | 2 | 0 | BEFREE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mammary Neoplasms | 0.00273291246481375 | 1 | 0 | LHGDN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ActiveDriverDB | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Position | Ref | Alt | Cancer | Sample ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 110 | T | I | Pancancer | Comments: na brca tcga-b6-a0rl-01a-11d-a099-09 45378 29159 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 193 | L | I | Pancancer | Comments: na luad tcga-17-z016-01a-01w-0746-08 201132 128469 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||