AmyPro ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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AmyPro ID | PDBs | References | Category | Prion | Parent protein | Mutations | Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||
AP00016 | 4R0P, 2NWD, 1IY4, 1W08, 1IOC, 1LOZ, 1LYY, 1OUA, 4I0C, 1OP9 | 15361882; 17468747; 16859705 | Pathogenic | No | - | - | RCELARTLKR, IFQINS, LANWMCLAKW |
SMART ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Domain | Start | End | E-value | Type | Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Signal_peptide | 1 | 18 | 0 | INTRINSIC | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:Lys | 19 | 146 | 3.7e-59 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
LYZ1 | 19 | 147 | 4.75506039322552e-99 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Signal_peptide | 1 | 18 | 0 | INTRINSIC | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:Lys | 19 | 146 | 2.5e-59 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
LYZ1 | 19 | 147 | 4.75506039322552e-99 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Signal_peptide | 1 | 18 | 0 | INTRINSIC | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:Lys | 19 | 146 | 3.1e-59 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
LYZ1 | 19 | 147 | 4.75506039322552e-99 | SMART | Visible|ok |
InterPro ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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InterPro ID | Name | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IPR001916 | Glyco_hydro_22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IPR019799 | Glyco_hydro_22_CS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IPR000974 | Glyco_hydro_22_lys | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IPR023346 | Lysozyme-like_dom_sf | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IPR030056 | Lysozyme_C |
CDD ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Hit Type | PSSM-ID | From | To | E-value | Bitscore | Accession | Short Name | Incomplete | Superfamily | ||||||||||||||||||||||||||||||
Specific | 340383 | 19 | 146 | 1.29408e-84 | 243.327 | Cd16897 | LYZ_C | - | Cl00222 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Superfamily | 350962 | 19 | 146 | 1.29408e-84 | 243.327 | Cl00222 | Lyz_like superfamily | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Specific | 197612 | 19 | 147 | 1.5863e-84 | 243.35 | Smart00263 | LYZ1 | - | Cl00222 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Specific | 333808 | 19 | 142 | 3.90612e-74 | 216.894 | Pfam00062 | Lys | - | Cl00222 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 340357 | 19 | 144 | 2.43619e-66 | 197.022 | Cd00119 | LYZ | - | Cl00222 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 340385 | 19 | 144 | 7.4927e-52 | 160.463 | Cd16899 | LYZ_C_invert | - | Cl00222 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 340384 | 21 | 142 | 2.69085e-46 | 146.425 | Cd16898 | LYZ_LA | - | Cl00222 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 340360 | 45 | 117 | 3.33273e-11 | 55.1301 | Cd00442 | Lyz_like | - | Cl00222 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 340368 | 50 | 82 | 0.00049118 | 37.1138 | Cd13400 | LT_IagB_like | C | Cl00222 |
Gene3D ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CATH SUPERFAMILY CODE | Start-End | E-value | Domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1.10.530.10 | 19-89 | 2.6e-33 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1.10.530.10 | 91-148 | 7e-22 |