SMART ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Domain | Start | End | E-value | Type | Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 81 | 120 | 1.03620437042674e-06 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 82 | 120 | 3.2e-06 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 123 | 163 | 2.45405021141122e-08 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 124 | 163 | 1.4e-07 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 166 | 205 | 9.73295008598607e-12 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 167 | 205 | 2.5e-10 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 208 | 247 | 3.02129020733922e-08 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 209 | 247 | 1.5e-05 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 250 | 289 | 3.5776715905558e-10 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 251 | 289 | 1.1e-07 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 292 | 331 | 2.13637479414029e-08 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 293 | 331 | 2.6e-06 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 334 | 373 | 1.20851608158174e-07 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 335 | 373 | 2.6e-05 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 376 | 412 | 0.770209166787537 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 377 | 409 | 0.0086 | PFAM | Hidden|overlap |
InterPro ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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InterPro ID | Name | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IPR020472 | G-protein_beta_WD-40_rep | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IPR015943 | WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IPR001680 | WD40_repeat | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IPR019775 | WD40_repeat_CS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IPR017986 | WD40_repeat_dom | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IPR036322 | WD40_repeat_dom_sf |
CDD ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Hit Type | PSSM-ID | From | To | E-value | Bitscore | Accession | Short Name | Incomplete | Superfamily | ||||||||||||||||||||||||||||||
Specific | 238121 | 84 | 372 | 2.15679e-93 | 282.301 | Cd00200 | WD40 | - | Cl29593 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Superfamily | 356469 | 84 | 372 | 2.15679e-93 | 282.301 | Cl29593 | WD40 superfamily | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 238121 | 126 | 405 | 1.97278e-87 | 267.279 | Cd00200 | WD40 | - | Cl29593 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 238121 | 84 | 331 | 1.0809e-80 | 249.945 | Cd00200 | WD40 | - | Cl29593 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 238121 | 78 | 289 | 3.67101e-56 | 186.772 | Cd00200 | WD40 | N | Cl29593 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 317357 | 4 | 81 | 0.000105857 | 41.9147 | Pfam14933 | CEP19 | C | Cl20818 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Superfamily | 317357 | 4 | 81 | 0.000105857 | 41.9147 | Cl20818 | CEP19 superfamily | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 319068 | 179 | 310 | 0.000464094 | 41.5797 | Pfam17005 | WD40_like | C | Cl25540 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Superfamily | 319068 | 179 | 310 | 0.000464094 | 41.5797 | Cl25540 | WD40_like superfamily | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 225201 | 88 | 405 | 4.29139e-55 | 189.144 | COG2319 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 225201 | 86 | 376 | 1.57899e-53 | 184.907 | COG2319 | WD40 | N | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 225201 | 87 | 406 | 5.29865e-49 | 172.966 | COG2319 | WD40 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 225201 | 78 | 369 | 1.46185e-48 | 171.81 | COG2319 | WD40 | N | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 225201 | 194 | 416 | 1.86218e-19 | 89.7627 | COG2319 | WD40 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 177776 | 98 | 364 | 4.2484e-15 | 77.0491 | PLN00181 | PLN00181 | N | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 177776 | 176 | 372 | 3.79454e-10 | 61.6411 | PLN00181 | PLN00181 | N | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 173611 | 215 | 352 | 7.87432e-10 | 60.2918 | PTZ00421 | PTZ00421 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 166 | 205 | 8.37198e-10 | 53.4702 | Smart00320 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 177776 | 24 | 280 | 2.84757e-09 | 58.9447 | PLN00181 | PLN00181 | N | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 334060 | 167 | 205 | 3.37459e-09 | 51.9787 | Pfam00400 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 250 | 289 | 7.00095e-09 | 50.7738 | Smart00320 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 173611 | 271 | 404 | 2.25254e-08 | 55.6694 | PTZ00421 | PTZ00421 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 334060 | 251 | 289 | 4.93466e-08 | 48.5119 | Pfam00400 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 123 | 163 | 2.0145e-07 | 46.9218 | Smart00320 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 173611 | 132 | 290 | 3.89173e-07 | 51.8174 | PTZ00421 | PTZ00421 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 334060 | 124 | 163 | 4.93528e-07 | 45.8155 | Pfam00400 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 293 | 331 | 5.92181e-07 | 45.381 | Smart00320 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 208 | 247 | 7.27577e-07 | 45.381 | Smart00320 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 334060 | 293 | 331 | 1.8913e-06 | 43.8895 | Pfam00400 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 334060 | 209 | 247 | 2.88376e-06 | 43.5043 | Pfam00400 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 173611 | 94 | 248 | 2.95224e-06 | 49.121 | PTZ00421 | PTZ00421 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 334 | 372 | 3.49529e-06 | 43.455 | Smart00320 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 88 | 120 | 1.55415e-05 | 41.529 | Smart00320 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 173611 | 226 | 404 | 1.73079e-05 | 46.8098 | PTZ00421 | PTZ00421 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 240412 | 173 | 303 | 2.65224e-05 | 46.0964 | PTZ00420 | PTZ00420 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 334060 | 86 | 120 | 2.86808e-05 | 40.8079 | Pfam00400 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 334060 | 335 | 372 | 6.41928e-05 | 39.6523 | Pfam00400 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 240412 | 130 | 208 | 0.00259963 | 39.9332 | PTZ00420 | PTZ00420 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 315554 | 160 | 225 | 0.00517351 | 35.717 | Pfam12894 | ANAPC4_WD40 | N | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 376 | 405 | 0.00673122 | 34.2102 | Smart00320 | WD40 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 315554 | 183 | 271 | 0.00795305 | 35.3318 | Pfam12894 | ANAPC4_WD40 | - | - |
Gene3D ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CATH SUPERFAMILY CODE | Start-End | E-value | Domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2.130.10.10 | 86-173 | 6e-29 | YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2.130.10.10 | 174-256 | 6.1e-27 | YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2.130.10.10 | 257-340 | 1.4e-24 | YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2.130.10.10 | 341-415 | 1.1e-23 | YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase |