SMART ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Domain | Start | End | E-value | Type | Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
SFM | 88 | 140 | 6.92443331010891e-22 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:PRP4 | 93 | 121 | 4.1e-17 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 200 | 244 | 0.0036 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 205 | 244 | 0.000700047284230906 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 247 | 294 | 0.000609426557963592 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 248 | 294 | 5.7e-06 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 297 | 336 | 3.66353568820868e-07 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 298 | 336 | 0.00041 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 339 | 378 | 6.73327585358121e-06 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 340 | 378 | 4.2e-05 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 381 | 420 | 4.72076596482846e-10 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 382 | 420 | 3.1e-08 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 423 | 463 | 3.02129020733922e-08 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 424 | 463 | 5.9e-05 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
WD40 | 466 | 505 | 2.86213726763668e-09 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam:WD40 | 467 | 505 | 1.3e-08 | PFAM | Hidden|overlap |
CDD ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Hit Type | PSSM-ID | From | To | E-value | Bitscore | Accession | Short Name | Incomplete | Superfamily | ||||||||||||||||||||||||||||||
Specific | 238121 | 218 | 504 | 7.30799e-82 | 255.723 | Cd00200 | WD40 | - | Cl29593 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Superfamily | 356469 | 218 | 504 | 7.30799e-82 | 255.723 | Cl29593 | WD40 superfamily | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 238121 | 250 | 504 | 2.68707e-69 | 223.366 | Cd00200 | WD40 | - | Cl29593 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 238121 | 214 | 420 | 7.88821e-49 | 169.438 | Cd00200 | WD40 | N | Cl29593 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Specific | 128776 | 88 | 124 | 5.87638e-14 | 65.8411 | Smart00500 | SFM | - | Cl02632 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Superfamily | 351834 | 88 | 124 | 5.87638e-14 | 65.8411 | Cl02632 | PRP4 superfamily | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Specific | 337208 | 93 | 121 | 1.4646e-12 | 61.1659 | Pfam08799 | PRP4 | - | Cl02632 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 238121 | 202 | 294 | 3.90175e-12 | 66.5896 | Cd00200 | WD40 | N | Cl29593 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 227498 | 387 | 457 | 0.000497434 | 42.3237 | COG5170 | CDC55 | NC | Cl27186 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Superfamily | 227498 | 387 | 457 | 0.000497434 | 42.3237 | Cl27186 | CDC55 superfamily | NC | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Non-specific | 319068 | 394 | 458 | 0.000506919 | 41.9649 | Pfam17005 | WD40_like | C | Cl25540 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Superfamily | 319068 | 394 | 458 | 0.000506919 | 41.9649 | Cl25540 | WD40_like superfamily | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 225201 | 192 | 504 | 2.3364e-51 | 181.44 | COG2319 | WD40 | N | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 225201 | 208 | 504 | 1.31356e-46 | 168.729 | COG2319 | WD40 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 225201 | 224 | 427 | 5.23778e-34 | 133.675 | COG2319 | WD40 | N | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 225201 | 294 | 504 | 3.13866e-26 | 111.334 | COG2319 | WD40 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 225201 | 213 | 414 | 7.52034e-23 | 100.933 | COG2319 | WD40 | N | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 467 | 504 | 3.12504e-09 | 52.3146 | Smart00320 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 381 | 420 | 4.90189e-09 | 51.5442 | Smart00320 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 334060 | 467 | 504 | 5.06806e-09 | 51.5935 | Pfam00400 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 177776 | 363 | 504 | 5.71105e-09 | 58.5595 | PLN00181 | PLN00181 | N | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 173611 | 213 | 352 | 1.61186e-08 | 56.825 | PTZ00421 | PTZ00421 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 334060 | 382 | 420 | 2.62477e-08 | 49.6675 | Pfam00400 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 423 | 462 | 7.68473e-07 | 45.381 | Smart00320 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 334060 | 424 | 462 | 1.15302e-06 | 45.0451 | Pfam00400 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 173611 | 343 | 434 | 1.2006e-06 | 50.6618 | PTZ00421 | PTZ00421 | NC | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 297 | 336 | 1.55706e-06 | 44.6106 | Smart00320 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 177776 | 211 | 419 | 2.04898e-06 | 50.4703 | PLN00181 | PLN00181 | N | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 334060 | 341 | 378 | 8.20493e-06 | 42.3487 | Pfam00400 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 334060 | 299 | 336 | 1.36708e-05 | 41.9635 | Pfam00400 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 347 | 378 | 2.43187e-05 | 41.1438 | Smart00320 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 240412 | 254 | 419 | 4.21515e-05 | 46.0964 | PTZ00420 | PTZ00420 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 334060 | 249 | 294 | 5.04852e-05 | 40.4227 | Pfam00400 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 249 | 294 | 7.23811e-05 | 39.9882 | Smart00320 | WD40 | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 240412 | 347 | 453 | 0.000252773 | 43.4 | PTZ00420 | PTZ00420 | C | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
Multi-dom | 197651 | 214 | 244 | 0.000880615 | 36.9066 | Smart00320 | WD40 | N | - |
Gene3D ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CATH SUPERFAMILY CODE | Start-End | E-value | Domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1.10.720.150 | 61-129 | 0.00016 | Pre-mRNA processing factor 4 domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2.130.10.10 | 130-342 | 1.8e-30 | YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2.130.10.10 | 343-507 | 5.5e-51 | YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase |