- Disorder▼
- Domain▼
- PTM▼
- Variation▼
- Mutation▼
- Interaction▼
- Disease▼
- Drug▼
- Physicochemical▼
- Function▼
- Proteomics▼
- Structure▼
- Localization▼
- Expression▼
- Element▼
- Methylation▼
- SMART
- CDD
- Gene3D
SMART  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Domain | Start | End | E-value | Type | Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam:NUP50 | 2 | 82 | 5.9e-23 | PFAM | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RanBD | 297 | 420 | 3.60276602005379e-06 | SMART | Visible|ok | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam:Ran_BP1 | 303 | 422 | 6e-12 | PFAM | Hidden|overlap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CDD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Hit Type | PSSM-ID | From | To | E-value | Bitscore | Accession | Short Name | Incomplete | Superfamily | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Specific | 269991 | 305 | 421 | 2.64783e-43 | 146.979 | Cd13170 | RanBD_NUP50 | - | Cl17171 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Superfamily | 354315 | 305 | 421 | 2.64783e-43 | 146.979 | Cl17171 | PH-like superfamily | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Specific | 337254 | 3 | 64 | 2.96901e-20 | 83.8784 | Pfam08911 | NUP50 | - | Cl07486 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Superfamily | 337254 | 3 | 64 | 2.96901e-20 | 83.8784 | Cl07486 | NUP50 superfamily | - | - | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Non-specific | 269907 | 311 | 421 | 7.15438e-19 | 81.4894 | Cd00835 | RanBD_family | - | Cl17171 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Non-specific | 270001 | 314 | 419 | 2.32301e-09 | 54.5447 | Cd13180 | RanBD_RanBP3 | - | Cl17171 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Non-specific | 197549 | 297 | 419 | 2.11894e-08 | 52.3899 | Smart00160 | RanBD | - | Cl17171 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Non-specific | 270002 | 292 | 421 | 1.36676e-06 | 46.6617 | Cd13181 | RanBD_NUP2 | - | Cl17171 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Non-specific | 269992 | 314 | 421 | 4.1474e-05 | 42.4538 | Cd13171 | RanBD1_RanBP2_insect-like | - | Cl17171 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Non-specific | 269994 | 308 | 365 | 0.0010901 | 38.233 | Cd13173 | RanBD3_RanBP2_insect-like | C | Cl17171 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CATH SUPERFAMILY CODE | Start-End | E-value | Domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2.30.29.30 | 246-421 | 9e-31 | Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||